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チョウザメ類における種および雑種判別のためのDNAマーカーの開発

Research Project

Project/Area Number 14F04751
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section外国
Research Field Aquatic bioproduction science
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

荒井 克俊  北海道大学, 水産科学研究院, 教授 (00137902)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) HAVELKA MILOS  北海道大学, 水産科学研究院, 外国人特別研究員
HAVELKA Milos  北海道大学, 水産科学研究科(研究院), 外国人特別研究員
Project Period (FY) 2014-04-25 – 2017-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2016)
Budget Amount *help
¥2,300,000 (Direct Cost: ¥2,300,000)
Fiscal Year 2016: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2015: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2014: ¥400,000 (Direct Cost: ¥400,000)
Keywords水産学 / 農林水産物 / 遺伝学 / バイオテクノロジー / 交雑 / 倍数体 / 次世代シーケンサー / キャビア / 発生・分化 / 交雑育種 / 希少種 / チョウザメ / 交雑種 / マイクロサテライト / PCR / 種判別 / ゲノム
Outline of Annual Research Achievements

オオチョウザメHuso huso、コチョウザメAcipenser ruthenus、シベリアチョウザメA. baeri、オオチョウザメ雌とコチョウザメ雄の間の交雑種ベステルについて、double-digest restriction-associated DNA(ddRAD)シーケンスにより種特異的な1あるいは2塩基配列変異を同定した。そして、コチョウザメに特異的に反応するポジティブ(+)プライマーとコチョウザメ以外に反応するネガティブ(-)プライマー、ならびにオオチョウザメに特異的に反応する(+)プライマーとオオチョウザメ以外に反応する(-)プライマーを設計した。これらのプライマーと共通のリバースプライマーの組み合わせにより、PCRと電気泳動のみで、増幅フラグメントの存否に基づいて、オオチョウザメ、コチョウザメとこれらの種間雑種ベステル(オオチョウザメ雌×コチョウザメ雄)を他のチョウザメ類8種(シベリアチョウザメA. baeri、 アムールチョウザメA. schrenckii、 ロシアチョウザメA. gueldenstaedtii、 ホシチョウザメ A. stellatus、ペルシャチョウザメ A. percicus、 ミカドチョウザメ A. mikadoi、シロチョウザメ A. transmontanus、ダウリアチョウザメ H. dauricus)から正確かつ簡便に種・雑種判別する手法を確立した。本手法はキャビア1粒のサンプルであっても判別が可能であった。オオチョウザメは最高級キャビアを産し、ベステルのキャビアも広く利用されているので、本手法は食品偽装、不正流通の防止に広く利用可能である。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2016 Annual Research Report
  • 2015 Annual Research Report
  • 2014 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2017 2016 2015 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (2 results)

  • [Int'l Joint Research] 南ボヘミア大学水産・水系保護研究院(チェコ)

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Int'l Joint Research] 南ボヘミア大学水産・水系保護研究院/チェコ科学アカデミー動物生理学遺伝学研究所(チェコ)

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Int'l Joint Research] インスブルック大学陸水学研究所(オーストリア)

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Journal Article] Spontaneous polyploidization in critically dangered Acipenser mikadoi2017

    • Author(s)
      Milos Havelka, He Zhou, Seishi Hagihara, Masaki Ichimura, Takafumi Fujimoto, Etsuro Yamaha, Shinji Adachi, Katsutoshi Arai
    • Journal Title

      Fisheries Science

      Volume: 印刷中 Issue: 4 Pages: 587-595

    • DOI

      10.1007/s12562-017-1083-3

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Nuclear DNA markers for identification of Beluga and Sterlet sturgeons and their interspecific Bester hybrid2017

    • Author(s)
      Milos Havelka, Takafumi Fujimoto, Seishi Hagihara, Shinji Adachi, Katsutoshi Arai
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: - Issue: 1

    • DOI

      10.1038/s41598-017-01768-3

    • NAID

      120006219987

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] The second highest chromosome count among vertebrates is observed in cultured sturgeon and its associated with genome plasticity2016

    • Author(s)
      Milos Havelka, Dmytro Bytyutskyy, Radka Symonova, Petr Rab, Martin Flajshans
    • Journal Title

      Genetics Selection Evolution

      Volume: 48 Issue: 1 Pages: 12-12

    • DOI

      10.1186/s12711-016-0194-0

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Spontaneous polyploidy in Acipenser mikadoi ミカドチョウザメにおける自然発生倍数体2016

    • Author(s)
      Milos Havelka, He Zhou, Masaki Ichimura, Seishi Hagihara, Takafumi Fujimoto, Etsuro Yamaha, Shinji Adachi, Katsutoshi Arai
    • Organizer
      平成28年度日本水産学会秋季大会
    • Place of Presentation
      近畿大学農学部(奈良キャンパス)、奈良市、奈良県、日本
    • Year and Date
      2016-09-09
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] The second highest chromosome count among vertebrates 脊椎動物で二番目に多い染色体数2015

    • Author(s)
      Milos Havelka
    • Organizer
      平成27年度日本水産学会春季大会
    • Place of Presentation
      東京海洋大学品川キャンパス、東京都港区
    • Year and Date
      2015-03-30
    • Related Report
      2014 Annual Research Report

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Published: 2015-01-22   Modified: 2024-03-26  

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