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新規プロテオーム解析手法による根粒菌の窒素固定機構の解明とアンモニア生産への応用

Research Project

Project/Area Number 14J01156
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Applied microbiology
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

立上 陽平  京都大学, 農学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2014-04-25 – 2017-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2016)
Budget Amount *help
¥2,500,000 (Direct Cost: ¥2,500,000)
Fiscal Year 2016: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2015: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2014: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Keywords窒素固定 / 根粒菌 / 転写因子 / ジベレリン / 根粒形成制御 / アンモニア / アンモニア生産
Outline of Annual Research Achievements

①Mesorhizobium lotiの転写因子による人工遺伝子発現制御
これまでの研究の成果から、我々はM. lotiの共生状態特異的な転写因子である、nifA2(mlr5837)とrpoN2(mll5872)に着目し、これら二つの転写因子を試験管培養下でも誘導発現させることにより、M. lotiのタンパク質発現が共生状態に近づけた。2つの転写因子を同時にIPTG誘導できるようにするため、lac promoterの下流にこれらの遺伝子を組み込みオペロン化し、その領域を広域宿主プラスミドpLAFR1に組み込んだ。さらに窒素固定タンパク質ニトロゲナーゼの活性中心の合成に必要なホモクエン酸合成のため、ホモクエン酸シンターゼ遺伝子nifVを土壌細菌Azotobacter vinelandiiからクローニングし、相同組換えによりM. lotiへのゲノム挿入を試みた。この状態でニトロゲナーゼの中心酵素NifHが発現することをウェスタンブロッティングにより確認し、さらに、その他の窒素固定関連遺伝子20種類以上が発現していることもプロテオーム解析により確認した。ただし、外的に導入したnifVは発現せず、結果としてニトロゲナーゼ中心錯体が形成されずに根粒菌が窒素固定能を示さなかった。
②M. lotiの共生時特異的な植物ホルモンの生産
根粒菌のメタボローム解析の結果、根粒菌が植物ホルモンであるジベレリンを合成していることを発見した。加えて、各酵素群の機能解明を行い、合成経路を世界で初めて同定した。さらに、根粒菌のジベレリン合成遺伝子破壊株を用い、植物生理学的な実験を行った結果、根粒菌の合成するジベレリンが宿主植物の根粒数を負に制御することを見出した。現在はさらに解析を進め、根粒菌由来のジベレリンがどのようなシグナル伝達系で植物表現型に影響を与えているかを検証中である。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2016 Annual Research Report
  • 2015 Annual Research Report
  • 2014 Annual Research Report
  • Research Products

    (18 results)

All 2017 2016 2015 2014

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 4 results) Presentation (12 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results) Book (2 results)

  • [Journal Article] Ammonia production from amino acid-based biomass-like sources by engineered Escherichia coli2017

    • Author(s)
      Yosuke Mikami, Hisanari Yoneda, Yohei Tatsukami, Wataru Aoki, Mitsuyoshi Ueda
    • Journal Title

      AMB Express

      Volume: 7 Issue: 1 Pages: 83-83

    • DOI

      10.1186/s13568-017-0385-2

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Rhizobial gibberellin negatively regulates host nodule number2016

    • Author(s)
      Yohei Tatsukami, Mitsuyoshi Ueda
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 6 Issue: 1 Pages: 27998-27998

    • DOI

      10.1038/srep27998

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Putative alginate assimilation process of the marine bacterium Saccharophagus degradans 2-40 based on quantitative proteomic analysis2016

    • Author(s)
      Toshiyuki Takagi, Hironobu Morisaka, Shunsuke Aburaya, Yohei Tatsukami, Kouichi Kuroda, Mitsuyoshi Ueda
    • Journal Title

      Marine Biotechnology

      Volume: 18 Issue: 1 Pages: 15-23

    • DOI

      10.1007/s10126-015-9667-3

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Quantitative time-course proteome analysis of Mesorhizibium loti during nodule maturation2015

    • Author(s)
      Mami Nambu, Yohei Tatsukami, Hironobu Morisaka, Kouichi Kuroda, Mitsuyoshi Ueda
    • Journal Title

      Journal of Proteomics

      Volume: 125 Pages: 112-120

    • DOI

      10.1016/j.jprot.2015.04.034

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 根粒菌の生産するジベレリンが宿主の根粒数を負に制御する2016

    • Author(s)
      立上陽平
    • Organizer
      植物微生物研究会 第25回研究交流会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2016-09-07
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] 根粒菌の生産するジベレリンが根粒数を制御する2016

    • Author(s)
      立上陽平
    • Organizer
      2016年度生物工学若手研究者の集い 夏のセミナー
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-07-16
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Validation of gibberellin synthetic pathway of rhizobia2016

    • Author(s)
      Yohei Tatsukami
    • Organizer
      ECB2016, 17th European Congress on Biotechnology
    • Place of Presentation
      Krakow, Poland
    • Year and Date
      2016-07-03
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 根粒菌のジベレリン生合成が根粒形成を制御する2016

    • Author(s)
      立上陽平、植田充美
    • Organizer
      日本農芸化学会 2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] Qualitative and quantitative proteomics of legume-symbiont Mesorhizobium loti2015

    • Author(s)
      Yohei Tatsukami, Mami Nambu, Hironobu Morisaka, Kouichi Kuroda, Mitsuyoshi Ueda
    • Organizer
      PacifiChem 2015
    • Place of Presentation
      Honolulu, HI, USA
    • Year and Date
      2015-12-15
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 根粒菌によるジベレリン生合成が植物の根粒形成を制御する可能性についての考察2015

    • Author(s)
      立上陽平、植田充美
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2015-12-01
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 根粒菌のジベレリン生合成が根粒形成を制御する2015

    • Author(s)
      立上陽平、植田充美
    • Organizer
      植物微生物研究会 第25回研究交流会
    • Place of Presentation
      つくば
    • Year and Date
      2015-09-14
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 共生過程におけるミヤコグサ根粒菌Mesorhizobium lotiの時系列定量プロテオーム解析2015

    • Author(s)
      立上陽平、南部真実、森坂裕信、黒田浩一、植田充美
    • Organizer
      2015年度生物工学若手研究者の集い 夏のセミナー
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2015-07-11
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] Analysis of metabolic changes in Mesorhizobium loti during nodule maturation by quantitative proteomics2015

    • Author(s)
      Yohei Tatsukami, Mami Nambu, Hironobu Morisaka, Kouichi Kuroda, Mitsuyoshi Ueda
    • Organizer
      FEMS2015, 6th Congress of European Microbiologists
    • Place of Presentation
      Maastricht, the Netherland
    • Year and Date
      2015-06-07
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ミヤコグサ根粒菌Mesorhizobium lotiによる共生時特異的なジベレリンの生合成2015

    • Author(s)
      立上陽平 南部真実 森坂裕信 黒田浩一 植田充美
    • Organizer
      日本農芸化学会2015年度大会
    • Place of Presentation
      岡山
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] プロテオーム解析によるミヤコグサ根粒菌の新規代謝経路の予測2014

    • Author(s)
      立上陽平 南部真実 森坂裕信 黒田浩一 植田充美
    • Organizer
      2014年度生物工学若手研究者の集い
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2014-07-12 – 2014-07-13
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Putative secondary metabolic pathway in Mesorhizobium loti disclosed by novel proteome analysis2014

    • Author(s)
      Yohei Tatsukami, Mami Nambu, Hironobu Morisaka, Kouichi Kuroda, Mitsuyoshi Ueda
    • Organizer
      ASM2014, the 114th American Society for Microbiology
    • Place of Presentation
      Boston, MA, USA
    • Year and Date
      2014-05-17 – 2014-05-20
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Book] 「バイオサイエンスとインダストリー(B&I)」2017年 Vol.75, No.12017

    • Author(s)
      立上陽平・植田充美
    • Total Pages
      2
    • Publisher
      バイオインダストリー協会
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Book] 立上陽平・植田充美2015

    • Author(s)
      バイオ水素とキャリア開発の最前線 3章-7 「微生物の合成生物学的改質育種に向けて」
    • Total Pages
      8
    • Publisher
      CMC出版
    • Related Report
      2015 Annual Research Report

URL: 

Published: 2015-01-22   Modified: 2024-03-26  

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