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究極的DNA鑑定である微量混合試料分析法の開発と評価

Research Project

Project/Area Number 14J03372
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Legal medicine
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

真鍋 翔  京都大学, 医学研究科, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2014-04-25 – 2016-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2015)
Budget Amount *help
¥1,900,000 (Direct Cost: ¥1,900,000)
Fiscal Year 2015: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
KeywordsDNA多型 / マイクロサテライト / 法数学 / 微量混合試料 / continuous model
Outline of Annual Research Achievements

法医鑑識領域において、複数人のDNAが混合した試料や微量試料の分析結果について、何人のDNAが含まれるか、被疑者のDNAは含まれるか等を尤度比を利用して確率的に評価する必要があるが、その方法は未だ確立していない。しかし、最近提唱されたcontinuous modelは、ピークの高さに影響を及ぼす様々な因子を考慮することで、より厳密な確率的評価を行えると期待されている。しかし、この方法は実践的なデータよりも理論的な条件設定が中心であり、パラメータの設定値やプログラムのアルゴリズムに問題点を有している。そこで、本研究ではcontinuous modelに基づいたソフトウェアを独自に作成し、検証することを目的としている。
本年度は、昨年度までに作成したソフトウェアの改良とその検証を行った。昨年度までのソフトウェアでは、本来検出されるはずのアリルが微量なため検出されないこと(アリルドロップアウト)やDNAの断片化の影響を扱えなかったが、本年度はこれら2つの因子をソフトウェアに組み入れた。また、continuous modelではシミュレーション的にパラメータの値を推定した上で確率計算を行うが、昨年度まで利用していたMCMC法では各パラメータが非現実的な値となる問題点があった。そこで本年度は、各パラメータの確率分布を実験的に推定した上で、その確率分布に従って乱数を発生させる方法(モンテカルロ法)を新たに利用することにし、ソフトウェアのプログラムを改良した。
また、2人から4人までのDNA混合試料を計20例作製し、ソフトウェアで分析した。各混合試料について、何人のDNAが含まれるかの推定と仮に設定した被疑者の関与の有無に関する尤度比の計算を行い、従来の方法と比較した。その結果、本ソフトウェアにおける判定の精度は従来法よりも向上した。よって、本ソフトウェアは混合試料の解析に有用であった。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2015 Annual Research Report
  • 2014 Annual Research Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2016 2015 2014

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] New stutter ratio distribution for DNA mixture interpretation based on a continuous model2016

    • Author(s)
      Sho Manabe, Yuya Hamano, Chie Morimoto, Chihiro Kawai, Shuntaro Fujimoto, Keiji Tamaki
    • Journal Title

      Legal Medicine

      Volume: 19 Pages: 16-21

    • DOI

      10.1016/j.legalmed.2016.01.007

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Development of new peak-height models for a continuous method of mixture interpretation2015

    • Author(s)
      Sho Manabe, Yuya Hamano, Chihiro Kawai, Chie Morimoto, Keiji Tamaki
    • Journal Title

      Forensic Science International: Genetics Supplement Series

      Volume: 5 Pages: e104-e106

    • DOI

      10.1016/j.fsigss.2015.09.042

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] ピーク高に影響を及ぼす各パラメータの分布に関する統計学的推定2015

    • Author(s)
      真鍋翔、濱野悠也、川合千裕、森本千恵、宮尾昌、玉木敬二
    • Journal Title

      DNA多型

      Volume: 23 Pages: 159-165

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 同胞鑑定例におけるIdentifiler検査の有効性の検討2014

    • Author(s)
      真鍋 翔、吉田 耕一、川合 千裕、尾関 宗孝、小谷 泰一、玉木 敬二
    • Journal Title

      DNA多型

      Volume: 22 Pages: 158-161

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 混合試料分析において、対立仮説に被疑者の血縁者の関与を想定した尤度比計算とその評価2014

    • Author(s)
      真鍋 翔、川合 千裕、垣本 由布、石田 季子、宮尾 昌、玉木 敬二
    • Journal Title

      DNA多型

      Volume: 22 Pages: 181-183

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 身元確認のための2者間血縁鑑定ツールの開発2014

    • Author(s)
      濱野 悠也、真鍋 翔、吉田 耕一、川合 千裕、玉木 敬二
    • Journal Title

      法科学技術

      Volume: 19 Pages: 129-132

    • NAID

      130004678714

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 新しく開発した混合試料分析ソフトウェアの検証―米国NISTによる調査で扱われた複雑な混合試料を用いて―2015

    • Author(s)
      真鍋翔、森本千恵、濱野悠也、藤本駿太朗、川合千裕、小谷泰一、玉木敬二
    • Organizer
      日本DNA多型学会第24回学術集会
    • Place of Presentation
      岡山
    • Year and Date
      2015-11-19
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] Continuous modelに基づく混合試料分析プログラムの開発と評価2015

    • Author(s)
      真鍋翔、濱野悠也、森本千恵、川合千裕、藤本駿太朗、玉木敬二
    • Organizer
      第21回日本法科学技術学会
    • Place of Presentation
      柏
    • Year and Date
      2015-11-12
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] Development of new peak-height models for a continuous method of mixture interpretation2015

    • Author(s)
      Sho Manabe, Yuya Hamano, Chihiro Kawai, Chie Morimoto, Keiji Tamaki
    • Organizer
      26th Congress of the International Society for Forensic Genetics
    • Place of Presentation
      Krakow, Poland
    • Year and Date
      2015-08-31
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Analysis of DNA mixture interpretation using the statistical software R2015

    • Author(s)
      Sho Manabe, Yuya Hamano, Chie Morimoto, Chihiro Kawai, Munetaka Ozeki, Hirokazu Kotani, Keiji Tamaki
    • Organizer
      第99次日本法医学会学術全国集会
    • Place of Presentation
      高知
    • Year and Date
      2015-06-10
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] ピーク高に影響を及ぼす各パラメータの分布に関する統計的推定2014

    • Author(s)
      真鍋 翔、濱野 悠也、川合 千裕、森本 千恵、宮尾 昌、玉木 敬二
    • Organizer
      日本DNA多型学会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2014-11-26 – 2014-11-28
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] ピーク高を考慮した混合試料の新しい分析法の開発2014

    • Author(s)
      真鍋 翔、濱野 悠也、川合 千裕、森本 千恵、玉木 敬二
    • Organizer
      日本法科学技術学会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2014-11-13 – 2014-11-14
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Usefulness of kinship determination using exact likelihood ratios incorporating all allele inheritance patterns and correct mutation rates2014

    • Author(s)
      Sho Manabe, Chihiro Kawai, Munetaka Ozeki, Hirokazu Kotani, Keiji Tamaki
    • Organizer
      9th International Symposium on Advances in Legal Medicine
    • Place of Presentation
      Fukuoka
    • Year and Date
      2014-06-16 – 2014-06-20
    • Related Report
      2014 Annual Research Report

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Published: 2015-01-22   Modified: 2024-03-26  

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