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膜結合蛋白質の自己組織化を促進する、生体膜の作用メカニズム解明

Research Project

Project/Area Number 14J07513
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Biophysics
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

田中 耕路  東京大学, 工学系研究科, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2014-04-25 – 2016-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2015)
Budget Amount *help
¥2,200,000 (Direct Cost: ¥2,200,000)
Fiscal Year 2015: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
Keywords膜蛋白質 / 自己組織化 / 熱力学的解析 / 速度論的解析 / 蛋白質糖間相互作用 / 蛋白質結晶構造解析 / Pore forming toxin / 脂質膜のダイナミクス / 蛋白質の構造変化 / 脂質膜の流動性 / 糖鎖 / 糖結合蛋白質
Outline of Annual Research Achievements

(1) FraC による糖鎖認識機構の解明
生体膜は脂質のみからなるものではなく,その表面には様々な蛋白質,糖鎖が存在する.そのため生体膜を標的とする蛋白質(ウイルス・毒素)には膜表面の蛋白質や糖鎖を受容体とするものが多く存在する.本研究では,脂質のみを受容体とすると考えられてきたFraCが糖鎖結合能を有することを証明し,酸性糖鎖に対してより強く結合することを明らかにした.特に本年度は、FraCとGlcNAc(6S)との共結晶構造の決定を行った。また,FraCの糖鎖結合部位が脂質結合部位と重なっていることを示し,蛋白質による基質認識の二重特異性に関する知見を深めた.
(2) 水溶性構造・膜貫通構造間での双方向的な蛋白質構造変化の実現
PFTの膜孔形成に代表される水溶性蛋白質の膜蛋白質への変化は,準安定構造から安定構造への変化なので不可逆な過程であると考えられてきた.本研究では,FraC膜孔を可溶化する界面活性剤の交換によって,選択的に膜孔を水溶性単量体に構造変化させることを初めて達成した.研究では複数の界面活性剤を用い、様々な界面活性剤がFraC膜孔の安定化に及ぼす影響を系統的に解析した。分子種の同定はサイズ排除クロマトグラフィーによって行った。その結果、幾つかの界面活性剤は膜孔を単量体に変化させることが明らかになった。膜孔の単量体化を促進する界面活性剤の一つとしてオクチルグルコサイド(OG)に着目し、OG処理前後の蛋白質の結晶構造解析、熱安定性評価、保存安定性の評価を行った。
以上の研究を通じて、本研究は蛋白質毒素の詳細な作用機序、および膜蛋白質の自己組織化が生体膜から受ける影響を解き明かした。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2015 Annual Research Report
  • 2014 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2015 2014

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Bidirectional transformation of a protein between its Native Water-Soluble and Transmembrane Conformations.2015

    • Author(s)
      Tanaka, K., Caaveiro, J.M.M., and Tsumoto, K.
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 54 Issue: 46 Pages: 6863-6866

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.5b01112

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Structural basis for self-assembly of a cytolytic pore lined by protein and lipid2015

    • Author(s)
      Koji Tanaka, Jose M.M. Caaveiro, Koldo Morante, Juan Manuel Gonzalez-Manas and Kouhei Tsumoto
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 6 Issue: 1 Pages: 6337-6337

    • DOI

      10.1038/ncomms7337

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] A Pore-Forming Toxin Requires a Specific Residue for its Activity in Membranes with Particular Physicochemical Properties2015

    • Author(s)
      Koldo Morante, Jose M.M. Caaveiro, Koji Tanaka, Juan Manuel Gonzalez-Manas and Kouhei Tsumoto
    • Journal Title

      The Journal of Biological Chemistry

      Volume: M114 Issue: 17 Pages: 615211-615211

    • DOI

      10.1074/jbc.m114.615211

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Mechanism of self-assembly of a transmembrane pore triggered by specific biomembranes2015

    • Author(s)
      Koji Tanaka
    • Organizer
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies 2015
    • Place of Presentation
      Honolulu, HA, US
    • Year and Date
      2015-12-15
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 小孔形成毒素( Pore forming Toxin )活性発現機構の構造基盤2015

    • Author(s)
      津本浩平
    • Organizer
      日本薬学会第135年会
    • Place of Presentation
      神戸学院大学等(神戸市)
    • Year and Date
      2015-03-25 – 2015-03-28
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 毒素FraCが形成する蛋白質と脂質からなる膜孔構造2014

    • Author(s)
      田中耕路, Jose Caaveiro, Koldo Morante, Juan Manuel Gonzalez-Manas, 津本浩平
    • Organizer
      日本結晶学会 平成26年度年会
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都)
    • Year and Date
      2014-11-01 – 2014-11-03
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 膜孔形成蛋白質FraCの構造変化機構の解析:可溶性構造から膜貫通構造までの変遷2014

    • Author(s)
      田中耕路, Jose Caaveiro, 津本浩平
    • Organizer
      第52回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(札幌市)
    • Year and Date
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Structural snapshots of the α-helical pore-forming toxin FraC reveal the molecular basis of its activation in membranes2014

    • Author(s)
      Koji Tanaka, Jose Caaveiro, Koldo Morante, Juan Manuel Gonzalez-Manas, Kouhei Tsumoto
    • Organizer
      The 28th Annual Symposium of The Protein Society
    • Place of Presentation
      San Diego, CA, USA
    • Year and Date
      2014-07-27 – 2014-07-30
    • Related Report
      2014 Annual Research Report

URL: 

Published: 2015-01-22   Modified: 2024-03-26  

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