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代謝ストレス応答性長鎖非コードRNAの分解制御と遺伝子発現における役割

Research Project

Project/Area Number 14J08792
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Molecular biology
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

三木 敦子  東京大学, 理学系研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2014-04-25 – 2017-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2016)
Budget Amount *help
¥2,900,000 (Direct Cost: ¥2,900,000)
Fiscal Year 2016: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2015: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
KeywordsRNA分解 / 長鎖ノンコーディングRNA / ストレス応答
Outline of Annual Research Achievements

近年、大規模ゲノム解析が行われるようになり、ゲノムDNA中の非コード領域からタンパク質をコードしない「ノンコーディングRNA(ncRNA)」が多数転写されていることが明らかになった。また、RNAの品質保証系によるRNA分解が、クロマチン修飾や遺伝子発現制御と関連あることが示されつつある。したがって、ncRNAを介したストレス応答性遺伝子発現制御とRNA分解系の関係も興味深い課題である。
これまでの研究から、分裂酵母でグルコース飢餓ストレスに応答して転写される遺伝子であるfbp1領域から、グルコースが豊富な条件下でアンチセンスRNA(fbp1-as)が発現しており、センス鎖のmRNAと逆のストレス応答性を示すことが明らかになっている。
そこで、本研究は分裂酵母を用いて、先述のグルコース飢餓応答性領域から非ストレス下で転写されるアンチセンスRNAの分解経路の同定および翻訳に共役した分解による遺伝子発現制御への影響を調べることを目的としている。平成28年度はリボソームプロファイリングのデータを参照することによってfbp1-asのリボソーム結合位置を特定した。また、fbp1-asの細胞質内分解経路を調べたところ、翻訳と共役したNMD経路によって分解されることがわかった。さらに、他の複数のグルコース飢餓ストレス応答性を示す遺伝子領域から転写されるアンチセンスRNAで同様の制御を受けているものを複数同定した。以上の結果と、平成26年度、27年度で得られた局在などのデータを論文にまとめて発表した。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2016 Annual Research Report
  • 2015 Annual Research Report
  • 2014 Annual Research Report
  • Research Products

    (5 results)

All 2017 2016 2015

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results)

  • [Journal Article] RNA decay systems enhance reciprocal switching of sense and antisense transcripts in response to glucose starvation2016

    • Author(s)
      A.Miki, J.Galipon, S.Sawai, T.Inada, and K.Ohta
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 21 Issue: 12 Pages: 1276-1289

    • DOI

      10.1111/gtc.12443

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Dynamics of antisense RNAs from stress responsive loci2017

    • Author(s)
      Atsuko Miki, Josephine Galipon, Satoshi Sawai, Toshifumi Inada, and Kunihiro Ohta
    • Organizer
      2017 Winter q-bio
    • Place of Presentation
      ハワイ(アメリカ合衆国)
    • Year and Date
      2017-02-21
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Distinct regulation of ribosome-bound long non-coding RNAs transcribed from stress responsive genes2016

    • Author(s)
      Atsuko Miki, Josephine Galipon, Satoshi Sawai, Toshifumi Inada, and Kunihiro Ohta
    • Organizer
      RNA 2016
    • Place of Presentation
      国立京都国際会館(京都府京都市)
    • Year and Date
      2016-06-28
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 分裂酵母グルコース飢餓におけるfbp1+センス・アンチセンスlncRNAの制御2015

    • Author(s)
      三木敦子,Josephine Galipom,太田邦史
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01
    • Related Report
      2015 Annual Research Report 2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Distinct decay dynamics of ribosome-bound lncRNAs and mRNAs2015

    • Author(s)
      Atsuko Miki, Josephine Galipon, Kunihiro Ohta
    • Organizer
      Pombe 2015 : 8th International Fission Yeast Meeting
    • Place of Presentation
      生田神社会館(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-06-21
    • Related Report
      2015 Annual Research Report 2014 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2015-01-22   Modified: 2024-03-26  

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