• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

植物の温度ストレス応答におけるRNA分解酵素DCP凝集の意義とその役割の解明

Research Project

Project/Area Number 14J08936
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Applied molecular and cellular biology
Research InstitutionNagoya University (2015)
The University of Tokyo (2014)

Principal Investigator

元村 一基  名古屋大学, トランスフォーマティブ 生命分子研究所, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2014-04-25 – 2016-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2015)
Budget Amount *help
¥2,500,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2015: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
Keywords植物 / 環境応答 / 高温 / RNA分解 / デキャッピング / 細胞質顆粒 / 植物の高温ストレス / mRNA分解 / RNA顆粒 / 細胞生物学
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、環境ストレス応答においてmRNAが分解を伴った量的・質的変動を起こすことに着目し、この現象の一端を担うと考えられる、mRNA分解酵素DCP1とDCP2について研究を行った。本年度はまず高温処理前後におけるDCP1SA植物トランスクリプトーム実験の解析からはじめた。解析により、DCP1SAでは通常温度時にはほとんど通常植物と同様のRNAの蓄積を示していること、一方で高温処理によって短時間でmRNAの蓄積量が変化していることが分かってきた。
これらの変動したmRNAには、DCP1とDCP2が直接分解を行う標的mRNAと、直接の標的ではなく、二次的な影響により変動したものが含まれているのではないかと考えられた。そこでDCP1SAで安定化を示したmRNAのうちの数種類について、転写阻害剤を加えた植物に高温処理をしてタイムコースを取り、その変動率からこれらのmRNAの半減期を算出した。
本解析の結果、DCP1SA植物で安定化を示したmRNAのうち、一部のmRNAは高温時に分解されていることが示唆された。また、一部のmRNAは分解とは独立して、転写に依存したmRNA量の変動が引き金となってDCP1SAで量的変動が起きていることが示唆された。本研究手法により、様々な細胞応答の総和であるmRNA量の変動から、DCP1とDCP2に依存したmRNA分解の直接的な標的候補だけ同定することに成功した。
本研究成果から、植物が高温応答時にリン酸化を通じてDCP2の局在を変化させることで、細胞内RNA分布を変化させることが示唆された。更に、このリン酸化依存的に選択的なmRNA分解が引き起こされていることが示唆され、高温応答におけるmRNA分解機構とその意義の一端を明らかにすることができた。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2015 Annual Research Report
  • 2014 Annual Research Report
  • Research Products

    (12 results)

All 2016 2015

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (11 results)

  • [Journal Article] Diffuse Decapping Enzyme DCP2 Accumulates in DCP1 Foci Under Heat Stress in Arabidopsis thaliana2015

    • Author(s)
      Motomura K, Le TN. Q, Hamada T, Kutsuna N, Mano S, Nishimura M and Watanabe Y.
    • Journal Title

      Plant Cell Physiology

      Volume: 56 Issue: 1 Pages: 107-115

    • DOI

      10.1093/pcp/pcu151

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Imaging Analysis in Roles of mRNA Decay at Early Plant Development2016

    • Author(s)
      元村 一基,栗原大輔、丸山大輔、渡邊 雄一郎,東山哲也
    • Organizer
      日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      盛岡
    • Year and Date
      2016-03-20
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] TARPタンパク質が関与するsiRNA生合成経路の解析2016

    • Author(s)
      塚田道雄、都筑正行、深尾陽一朗、栗原志夫、松井南、元村 一基、田村謙太郎、西村いくこ、渡邊雄一郎、濱田隆宏
    • Organizer
      日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      盛岡
    • Year and Date
      2016-03-18
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 初期発生におけるmRNA分解タンパク質の 局在・変異体のイメージング解析2016

    • Author(s)
      元村 一基、濱田隆宏、渡邊雄一郎、東山哲也
    • Organizer
      第5回植物RNA研究ネットワークシンポジウム
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-01-08
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] TARPタンパク質が関与するsiRNA生合成経路の解析2016

    • Author(s)
      塚田道雄、都筑正行、深尾陽一朗、栗原志夫、松井南、元村 一基、田村謙太郎、西村いくこ、渡邊雄一郎、濱田隆宏
    • Organizer
      第5回植物RNA研究ネットワークシンポジウム
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-01-08
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] シロイヌナズナtudorタンパク質によるsiRNA制御メカニズムの解析2015

    • Author(s)
      塚田道雄、都筑正行、元村 一基、深尾陽一朗、田村謙太郎、西村いくこ、渡邊雄一郎、濱田隆宏
    • Organizer
      日本植物学会
    • Place of Presentation
      新潟
    • Year and Date
      2015-09-08
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 発生過程におけるmRNA分解酵素DCPの局在2015

    • Author(s)
      元村 一基、濱田隆宏、渡邊雄一郎、東山哲也
    • Organizer
      日本植物学会
    • Place of Presentation
      新潟
    • Year and Date
      2015-09-07
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] RNA 分解酵素DCP は選択的RNA 代謝を通じて高温耐性に寄与する2015

    • Author(s)
      元村 一基、Le Thi Nhat Quy、倉田哲也、朽名夏麿、真野昌二、西村幹夫、濱田隆宏、渡邊雄一郎
    • Organizer
      日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      東京農業大学(東京都世田谷区)
    • Year and Date
      2015-03-17
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] シロイヌナズナにおける新規tudorタンパク質の機能解析2015

    • Author(s)
      塚田 道雄,都筑 正行,元村 一基,深尾 陽一朗,田村 謙太郎,西村 いくこ,渡邊 雄一郎,濱田隆宏
    • Organizer
      日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      東京農業大学(東京都世田谷区)
    • Year and Date
      2015-03-17
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 種子内におけるmiRNA の機能解析2015

    • Author(s)
      吉田 誠也,都筑 正行,元村 一基,濱田 隆宏,渡邊 雄一郎
    • Organizer
      日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      東京農業大学(東京都世田谷区)
    • Year and Date
      2015-03-17
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] シロイヌナズナにおけるストレス顆粒形成機構の解析2015

    • Author(s)
      福澤 麻里奈,佐藤 繭子,元村 一基,柳川 由紀,西村 いくこ,豊岡 公徳,渡邊 雄一郎,濱田 隆宏
    • Organizer
      日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      東京農業大学(東京都世田谷区)
    • Year and Date
      2015-03-17
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 生物学的ストレス下における植物RNA 顆粒の機能解析2015

    • Author(s)
      重政 理紗,元村 一基,別役 重之,濱田 隆宏,渡邊 雄一郎
    • Organizer
      日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      東京農業大学(東京都世田谷区)
    • Year and Date
      2015-03-16
    • Related Report
      2014 Annual Research Report

URL: 

Published: 2015-01-22   Modified: 2024-03-26  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi