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合成生物学における人工遺伝子回路を用いた細胞内代謝制御による物質生産効率の向上

Research Project

Project/Area Number 14J10450
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Applied molecular and cellular biology
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

相馬 悠希  九州大学, 生物資源環境科学府, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2014-04-25 – 2016-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2015)
Budget Amount *help
¥1,900,000 (Direct Cost: ¥1,900,000)
Fiscal Year 2015: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Keywords代謝工学 / 人工遺伝子回路 / 合成生物学 / クオラムセンシング / 代謝流束制御 / 代謝トグルスイッチ / バイオリファイナリー / バイオプロセス / バイオ燃料生産
Outline of Annual Research Achievements

本研究の目的は、微生物を用いた物質生産の効率化に向けて、菌体増殖過程と物質生産過程でそれぞれ異なる理想的な表現型を動的・可塑的に制御するための人工遺伝子回路を構築することにある。
一般に、物質生産過程に余剰の菌体増殖やこれに寄与する代謝活性が維持されると、標的物質の生産効率の低下を招く。特にTCA回路は様々な物質生産経路の起点となるAcetyl-CoAを消費するため、物質生産の直接的な競合経路とみなせる一方で、菌体増殖に必須な代謝経路でもあるため、従来の代謝工学的手法では競合経路として削除することはできなかった。そこで初年度は、誘導剤の添加によって任意のタイミングでTCA回路を遮断し、余剰の代謝流束を物質生産経路への代謝流束に転換する代謝トグルスイッチを構築した。これを大腸菌によるIsopropanol生産に応用したところ、生産量を従来の3.7倍に向上させることに成功した。
上記の回路では、培養プロセスの進行度を把握するために菌体密度をモニタリングし、最適なタイミングで誘導剤を添加する必要があった。しかし、実際の発酵過程において菌体密度をモニタリングするためには、断続的なサンプリングを行う必要があり、サンプリングに伴う汚染を防ぐための無菌操作設備への投資や運営コストが問題となる。この様な問題を解決するためには、培養過程において人為的な誘導操作を必要としない、菌体自律的な制御誘導システムの構築が必要となる。そこで、本年度は、細菌が互いの菌体密度を感知し、集団で遺伝子発現制御を行うシステムであるクオラムセンシング(Quorum Sensing: QS)に着目し、QSを人為的に改変することで、任意の菌体密度で目的の遺伝子発現の自律的誘導を可能とする菌体密度センサーを構築した。これを遺伝子トグルスイッチに統合することで、大腸菌による菌体密度感知とそれに伴う自律的な遺伝子発現制御・代謝流束制御に成功した。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2015 Annual Research Report
  • 2014 Annual Research Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2016 2015 2014 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Remarks (2 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Self-induced Metabolic State Switching by a Tunable Cell Density Sensor for Microbial Isopropanol Production2015

    • Author(s)
      Yuki Soma, Taizo Hanai
    • Journal Title

      Metabolic Engineering

      Volume: 30 Pages: 7-15

    • DOI

      10.1016/j.ymben.2015.04.005

    • Related Report
      2015 Annual Research Report 2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Metabolic flux redirection from a central metabolic pathway toward a synthetic pathway using a metabolic toggle switch2014

    • Author(s)
      YukiSoma, KeigoTsuruno, MasaruWada, AtsushiYokota, TaizoHanai
    • Journal Title

      Metabolic Engineering

      Volume: in press Pages: 175-184

    • DOI

      10.1016/j.ymben.2014.02.008

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Synthetic Quorum Sensing As a Tunable Cell Density Sensor-Regulator for Dynamic Metabolic Engineering2016

    • Author(s)
      Yuki Soma, Taizo Hanai
    • Organizer
      Metabolic Engineering 11
    • Place of Presentation
      Awaji Yumebutai International Conference Center
    • Year and Date
      2016-06-26
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 様々な菌体密度で遺伝子発現誘導可能な菌体密度センサーの構築2015

    • Author(s)
      堺 優花, 相馬 悠希, 鶴野 圭悟, 花井 泰三
    • Organizer
      第67回 日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      城山観光ホテル
    • Year and Date
      2015-10-26
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 人工遺伝子回路による代謝流束制御を用いた大腸菌でのイソプロパノール生産2014

    • Author(s)
      相馬悠希、鶴野圭悟、花井泰三
    • Organizer
      第21回 日本生物工学会九州支部熊本大会
    • Place of Presentation
      熊本大学工学部キャンパス
    • Year and Date
      2014-12-06
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Metabolic Toggle Switch for Improvement of Productivity in Synthetic Pathway2014

    • Author(s)
      Yuki Soma, Keigo Tsuruno and Taizo Hanai
    • Organizer
      3rd Asia-Oceania Algae Innovation Summit (AOAIS 2014)
    • Place of Presentation
      Hotel ICC, Daejeon, Korea
    • Year and Date
      2014-11-17
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] バイオプロセス効率化に向けた細胞内代謝制御のための人工遺伝子回路2014

    • Author(s)
      相馬悠希、鶴野圭悟、花井泰三
    • Organizer
      「細胞を創る」研究会 7.0
    • Place of Presentation
      東京大学本郷キャンパス
    • Year and Date
      2014-11-13
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Metabolic flux redirection for productivity improvement by metabolic toggle switch2014

    • Author(s)
      Yuki Soma, Keigo Tsuruno and Taizo Hanai
    • Organizer
      5th Asian symposium on innovative bio-production and bio-refinery in Tainan 2014 (iBio-T 2014)
    • Place of Presentation
      National Cheng Kung University, Tainan, Taiwan
    • Year and Date
      2014-11-09
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 代謝トグルスイッチを用いた細胞内代謝流束制御によるIPA生産効率の向上2014

    • Author(s)
      相馬悠希、鶴野圭悟、和田大、横田篤、花井泰三
    • Organizer
      第66回 日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      2014-09-09
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] ピルビン酸と酢酸を効率的に利用するために改良した代謝トグルスイッチによるIPA生産性の向上2014

    • Author(s)
      山路 大樹、相馬 悠希、花井 泰三
    • Organizer
      第66回 日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      2014-09-09
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Metabolic flux redirection from a central metabolic pathway toward a synthetic pathway using a metabolic toggle switch2014

    • Author(s)
      Yuki Soma, Keigo Tsuruno, Masaru Wada, Atsushi Yokota and Taizo Hanai
    • Organizer
      2014 Annual Meeting & Exhibition Society for Industrial Microbiology and Biotechnology (SIMB2014)
    • Place of Presentation
      Hyatt Regency St. Louis, St. Louis, MO, USA
    • Year and Date
      2014-07-20
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Remarks] ResaerchGate

    • URL

      https://www.researchgate.net/profile/Yuki_Soma

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Remarks] 研究室ホームページ

    • URL

      http://www.brs.kyushu-u.ac.jp/bioinfo/

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 新規人工遺伝子回路2015

    • Inventor(s)
      相馬悠希、鶴野圭悟、花井泰三
    • Industrial Property Rights Holder
      相馬悠希、鶴野圭悟、花井泰三
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2015-005363
    • Filing Date
      2015-01-14
    • Related Report
      2014 Annual Research Report

URL: 

Published: 2015-01-22   Modified: 2024-03-26  

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