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Enterococcus hirae由来V型ATPaseの回転機構の解明

Research Project

Project/Area Number 14J10948
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Biophysics
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

皆川 慶嘉  東京大学, 工学系研究科, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2014-04-25 – 2016-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2015)
Budget Amount *help
¥1,700,000 (Direct Cost: ¥1,700,000)
Fiscal Year 2015: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2014: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
KeywordsV1-ATPase / 分子モーター / EhVoV1のペリフェラルストークの役割
Outline of Annual Research Achievements

私はこれまで、Enterococcus hirae由来のV1(EhV1)の回転運動を観察し、ATP濃度に依存せずに120°毎に3つの停止点を示しながら1方向に回転することを明らかにした。これらの停止点で固定子(A3B3)の3つの触媒サイトではATP加水分解の反応素過程(ATP結合、ATP開裂、ADPの解離、Piの解離)のいずれかが起こっている。これら反応素過程と機械的な回転運動は強く共役しているため、どの停止点でどの反応素過程が起こっているか同定することは非常に重要である。そこで、蛍光でラベル化されたATP(Cy3-ATP)と回転軸DFに結合させた金コロイドの回転を同時に計測することによって、ATPの結合及びADPの解離と機械的な回転運動の関係を調べた。
結果として、Cy3-ATPの結合及びCy3-ADPの解離はそれぞれ最初の120°ステップ(0°~120°)と最後の120°ステップ(240°~360°)と同期していることが分かった。次に、120°ステップのどのタイミングでそれらの反応が起こっているか調べるため、ステップ直前直後の2点の蛍光強度を詳細に解析した。0° dwellの最後の点と120° dwellの最初の点の間で、蛍光強度は急激に上がっていた。対して、240° dwellの最後の点と360° dwellの最初の点の間では、蛍光強度が下がっていなかった。更に、カメラの撮影速度を60 fpsから150 fpsに上げると、360°dwellの最初の点の蛍光強度は上がった。
これら結果はATPの結合は120°ステップと厳密に同期していることを示している。また、ATPの結合が0°で起こると、ADPは360°で解離することも示している。そのため、ATPの結合に起因してADPの解離が起こっており、ATPの結合とADPの解離には明確な順番が存在していることが明らかとなった。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2015 Annual Research Report
  • 2014 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2015 2014

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Rotational mechanism of Enterococcus hirae V1-ATPase by crystal-structure and single-molecule analysis2015

    • Author(s)
      Iino R, Minagawa Y, Ueno H, Suzuki K, and Murata T
    • Journal Title

      Current Opinion in Structural Biology

      Volume: 31 Pages: 49-56

    • DOI

      10.1016/j.sbi.2015.02.013

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular structure and rotary dynamics of Enterococcus hirae V1-ATPase2014

    • Author(s)
      Iino R, Minagawa Y, Ueno H, Hara M, and Murata T
    • Journal Title

      IUBMB Life

      Volume: 66 Issue: 9 Pages: 624-630

    • DOI

      10.1002/iub.1311

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Torque generation of Enterococcus hirae V-ATPase2014

    • Author(s)
      Ueno H, Minagawa Y, Hara M, Rahman S, Yamato I, Muneyuki E, Murata T, and Iino R
    • Journal Title

      The Journal of Biological Chemistry

      Volume: 289 Issue: 45 Pages: 31212-31223

    • DOI

      10.1074/jbc.m114.598177

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Single-molecule analysis of hybrid Enterococcus hirae V1-ATPase toward elucidation of the chemo-mechanical coupling scheme2015

    • Author(s)
      皆川慶嘉
    • Organizer
      第53回日本生物物理年会
    • Place of Presentation
      金沢大学(石川県金沢市)
    • Year and Date
      2015-09-13
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] Rotation Assay of Hybrid Enterococcus hirae V1-ATPase toward revealing mechano-chemical coupling of V1-ATPase2015

    • Author(s)
      皆川慶嘉
    • Organizer
      9th Asian Biophysics Association Symposium
    • Place of Presentation
      Shangyu International Hotel (Hangzhou, China)
    • Year and Date
      2015-05-09
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] V1-ATPaseの化学力学共役スキーム解明に向けたハイブリッドEnterococcus hirae V1-ATPaseの回転観察2015

    • Author(s)
      皆川慶嘉
    • Organizer
      分子研研究会「膜タンパク内部のプロトン透過を考える」
    • Place of Presentation
      岡崎カンファレンスセンター(愛知県岡崎市)
    • Year and Date
      2015-04-20
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] The role of amino acid residues located at the catalytic site in the rotation of Enterococcus hirae V1-ATPase2015

    • Author(s)
      Yoshihiro Minagawa
    • Organizer
      BIOPHYSICAL SOCIETY 59th ANNUAL MEETING
    • Place of Presentation
      Baltimore, America
    • Year and Date
      2015-02-07 – 2015-02-11
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] The role of amino acid residues located at the catalytic site in the rotation of Enterococcus hirae V1-ATPase2014

    • Author(s)
      皆川慶嘉
    • Organizer
      第52回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター、北海道
    • Year and Date
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • Related Report
      2014 Annual Research Report

URL: 

Published: 2015-01-22   Modified: 2024-03-26  

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