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合成生物学的アプローチによる鉄硫黄クラスター合成系の反応機構と多様性の解析

Research Project

Project/Area Number 14J12351
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Applied microbiology
Research InstitutionSaitama University

Principal Investigator

田中 尚志  埼玉大学, 理工学研究科, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2014-04-25 – 2016-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2015)
Budget Amount *help
¥2,200,000 (Direct Cost: ¥2,200,000)
Fiscal Year 2015: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
Keywords鉄硫黄クラスター / 鉄硫黄タンパク質 / 生合成マシナリー / 分子生物学 / 生合成 / マシナリー
Outline of Annual Research Achievements

鉄硫黄(Fe-S)クラスターは鉄と硫黄から構成されるシンプルな形の金属コファクターだが、その生合成には複雑な多成分酵素系(マシナリー)が関与することが知られている。大腸菌は2種類のFe-Sクラスター生合成系(ISCとSUFマシナリー)を有しており、それぞれが独立してクラスターを合成しているが、これらを二重に破壊すると合成致死となるため、これまで詳細な遺伝学的解析が行われていなかった。一方、最近私は大腸菌のイソプレノイド合成経路を放線菌由来のメバロン酸経路に代謝改変することにより、クラスター生合成系の必須性を回避できることを見出した。この発見により、クラスター形成関連遺伝子群を自在に操作・解析して、その影響を正確に評価することができるようになった。そこで本年度は、この実験系を用いてISCマシナリーの中心成分であるIscU(クラスターの新規形成の足場)の機能解析を進めた。
1.HscA/HscB (HSP70型シャペロン/コシャペロン)はISCマシナリーのクラスター形成機能に必須であるが、HscA/HscBの欠損をバイパスする二次的な変異をIscUの分子内部に同定した。クラスター形成反応においてHscA/HscBがIscUの構造変化を引き起こし、クラスター移行反応を促進させる可能性が考えられる。
2.IscU Tyr3を他のアミノ酸に置換すると機能不全となるが、IscSの活性部位近傍の二次的なサプレッサー変異によって機能が回復する(平成26年度)。本年度では(野生型/機能不全型)IscUと(野生型/サプレッサー変異型)IscSをそれぞれ精製し、IscU-IscS間の相互作用および硫黄原子の受け渡し活性を調べたところ、IscU Tyr3がIscSから硫黄原子受け渡しの際の相互作用に重要であることを見出した。IscU Tyr3はIscSの活性部位近傍の構造変化を引き起こし、硫黄原子の移行反応を促進させる分子スイッチとして機能する可能性がある。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2015 Annual Research Report
  • 2014 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2016 2015 2014 Other

All Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Novel features of the ISC machinery revealed by characterization of Escherichia coli mutants that survive without iron-sulfur clusters2016

    • Author(s)
      Naoyuki Tanaka, Miaki Kanazawa, Keitaro Tonosaki, Nao Yokoyama, Tomohisa Kuzuyama, Yasuhiro Takahashi
    • Journal Title

      Molecular Microbiology

      Volume: 99 Issue: 5 Pages: 835-848

    • DOI

      10.1111/mmi.13271

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 鉄硫黄クラスター生合成系の完全欠損変異株を用いたISCマシナリーの再検討2015

    • Author(s)
      田中尚志、金澤美秋、外崎敬太郎、葛山智久、高橋康弘
    • Organizer
      BMB2015 日本分子生物学会年会・日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] Genetic and biochemical analysis of IscU, a central component of Fe-S cluster biosynthesis machinery2015

    • Author(s)
      Naoyuki Tanaka, Miaki Kanazawa, Tomohisa Kuzuyama, Yasuhiro Takahashi
    • Organizer
      Metals in Biology
    • Place of Presentation
      理化学研究所(埼玉県和光市)
    • Year and Date
      2015-06-16
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] イソプレノイド合成経路を代謝改変した大腸菌変異株における鉄硫黄クラスター生合成系の機能解析2015

    • Author(s)
      田中尚志、葛山智久、高橋康弘
    • Organizer
      日本農芸化学会 2015年度大会
    • Place of Presentation
      岡山大学(岡山県・岡山市)
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 鉄硫黄クラスター生合成系(ISCマシナリー)におけるIscUの構造変換の意義2014

    • Author(s)
      田中尚志、松嶋夢叶、北村整一、和田啓、福山恵一、高橋康弘
    • Organizer
      第87回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      京都国際会館(京都府。京都市)
    • Year and Date
      2014-10-15 – 2014-10-18
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 鉄硫黄クラスターの生合成を担うISCマシナリーの機能解析2014

    • Author(s)
      田中尚志、葛山智久、高橋康弘
    • Organizer
      平成26年度日本生化学会関東支部例会
    • Place of Presentation
      茨城大学理学部(茨城県・水戸市)
    • Year and Date
      2014-06-14
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Fe-Sクラスターを持たなくても生存可能な大腸菌変異株を用いたFe-Sクラスター生合成系の解析2014

    • Author(s)
      田中尚志、葛山智久、高橋康弘
    • Organizer
      第11回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      盛岡ホテル大観(岩手県・盛岡市)
    • Year and Date
      2014-06-05 – 2014-06-06
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Remarks] イソプレノイド生合成系を改変した大腸菌における鉄硫黄クラスター生合成系の解析

    • URL

      http://www.sgmj.org/images/3/37/Sgmj_no9.pdf

    • Related Report
      2014 Annual Research Report

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Published: 2015-01-22   Modified: 2024-03-26  

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