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RNA-ポリペプチド相互作用のコンビナトリアル解析

Research Project

Project/Area Number 15030213
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionTokyo Gakugei University

Principal Investigator

原田 和雄  東京学芸大学, 教育学部, 助教授 (00301169)

Project Period (FY) 2003 – 2004
Project Status Completed (Fiscal Year 2004)
Budget Amount *help
¥6,400,000 (Direct Cost: ¥6,400,000)
Fiscal Year 2004: ¥3,200,000 (Direct Cost: ¥3,200,000)
Fiscal Year 2003: ¥3,200,000 (Direct Cost: ¥3,200,000)
KeywordsRNA-ポリペプチド相互作用 / アルギニン・リッチ・モチーフ / コンビナトリアル・ライブラリー / レポーター・アッセイ / RNA / ポリペプチド / 分子認識 / コンビナトリアル / 発現制御 / HIV / Rev / RRE
Research Abstract

申請者は、ヒト免疫不全症ウイルス(HIV) Revタンパク質とその結合相手であるRev response element (RRE)をモデル・システムとしたRNA-ポリペプチド相互作用のメカニズムの解析を行ってきた。その最大の特徴・独創的な点は、申請者らが開発した細胞内RNA-ポリペプチド相互作用検出系を用いて、RNAとペプチドの双方のコンビナトリアル解析を行っている点である。これまで、アルギニンを主体とするコンビナトリアル・ライブラリーを用いたRRE結合ペプチドの探索により、本来の結合相手であるRevペプチドよりも強くRREと結合し、Revペプチドとは異なる結合様式を持つRSG-1.2、重要なグルタミン残基を持つK1およびDLAペプチドペプチドを同定した(Harada et al.,PNAS,1997;Peled-Zehavi et al.,RNA,2003)。本研究期間は、まずRSG-1.2ペプチドとの結合に重要な、RREヌクレオチドを同定し、RREによるRevおよびRSG-1.2ペプチドとの結合の特異性を1塩基置換により容易にスイッチ出来ることを見いだした(Iwazaki et al.,submitted)。また、K1およびDLAペプチドとRREとの相互作用のメカニズムをコンビナトリアルおよび生化学的な手法を用いて解析を行い、その結合の様式およびアミノ酸要求性に関する知見を得た(Sugaya et al.,in preparation)。

Report

(2 results)
  • 2004 Annual Research Report
  • 2003 Annual Research Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2003 Other

All Journal Article (2 results) Publications (4 results)

  • [Journal Article] Selection of RRE RNA binding peptides using a kanamycin antitermination assay2003

    • Author(s)
      Peled-Zehavi, H. et al.
    • Journal Title

      RNA 9

      Pages: 252-261

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] The variability of the peptide-binding specificity of RNA2003

    • Author(s)
      Harada, K. et al.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res.Suppl. 3

      Pages: 201-202

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Publications] H.Peled-Zehavi, S.Horiya, C.Das, K.Harada, A.D.Frankel: "Selection of RRE RNA binding peptides using a kanamycin antitermination assay"RNA. 9. 252-261 (2003)

    • Related Report
      2003 Annual Research Report
  • [Publications] S.Horiya, X.Li, G.Kawai, R.Saito, A.Katoh, K.Kobayashi, K.Harada: "RNA LEGO : Magnesium-dependent formation of specific RNA assemblies through kissing interactions"Chemistry & Biology. 10. 645-654 (2003)

    • Related Report
      2003 Annual Research Report
  • [Publications] K.Harada, T.Iwazaki, X.Li, A.Yuda, K.Kobayashi: "The variability of the peptide-binding specificity of RNA"Nucleic Acids Res.Suppl.. 3. 201-202 (2003)

    • Related Report
      2003 Annual Research Report
  • [Publications] 原田和雄: "ポリペプチドによるRNA構造のターゲティング"植田充美・近藤昭彦編、化学フロンティア(9)コンビナトリアル・バイオエンジニアリング. 163-168 (2003)

    • Related Report
      2003 Annual Research Report

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Published: 2003-04-01   Modified: 2018-03-28  

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