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核構造とRNA輸送の分子制御

Research Project

Project/Area Number 15030236
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionKumamoto University

Principal Investigator

斉藤 寿仁  熊本大学, 発生医学研究センター, 助教授 (50211925)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 斉藤 典子  熊本大学, 発生医学研究センター, 研究員
Project Period (FY) 2003 – 2004
Project Status Completed (Fiscal Year 2004)
Budget Amount *help
¥6,400,000 (Direct Cost: ¥6,400,000)
Fiscal Year 2004: ¥3,200,000 (Direct Cost: ¥3,200,000)
Fiscal Year 2003: ¥3,200,000 (Direct Cost: ¥3,200,000)
KeywordsSUMO / 翻訳後修飾 / 核輸送 / 核膜孔 / シグナル伝達 / シャペロン / 酵素 / ユビキチン / RNA輸送 / 核構造 / IGC / c-fos / 転写 / スプライシング
Research Abstract

細細胞の核内構造が転写を代表する核内反応の制御に関わる例が近年数々報告されている。本研究ではIGCの構成成分とRNA転写およびスプライシング、mRNA輸送に関わる機序と、核膜孔の細胞質フィラメント構成因子であるSUMO E3リガーゼRanBP2に焦点を当て、核膜孔におけるRNAの輸送と翻訳後修飾因子SUMOの役割を明らかにすることを目的として研究を推進し、以下の結果を得た。
1.SUMO結合タンパク質の解析:大腸菌体内でSUMO化タンパク質を大量に合成するシステムを完成させた。酵母2ハイブリッド法によりSUMO化タンパク質結合因子STIPsを複数同定し、大腸菌システムによるリコンビナントSUMO化タンパク質を用いた解析を行った。STIP3はRNA結合タンパク質であり、SUMOがSTIP3との相互作用を介して核内RNAの動態制御に関わるというモデルを提案した。
2.in situ SUMO化反応とRNAiによるSUMO化システムの解析:SUMO化反応と核内構造、および生体分子輸送の解析をセミインタクト細胞において解析する技術を確立した(in situ SUMo化反応系)。こうした新技術と、RNAi法を組み合わせることで、SUMO化システムとIGC、核膜孔の構築メカニズム、そして核膜孔におけるSUMO化およびRanBP2-E3活性生理的な意義を解析した。
3.RanBP2のsiRNAによるノックダウン効果の解析:RanBP2のsiRNAにより,細胞内のRanBP2を約80%ほどノックダウンすることに成功した。RanBP2ノックダウン細胞において、ポリA-RNAの核内における蓄積をポリAのin situ hybridization反応を用いて観察したのと同時に、IGC核スペックルの構成因子の局在異常を免疫染色法により検出した。核膜孔タンパク質や核ラミナの構造には変化が見られなかったことから、この結果は、RanBP2の機能破綻が直接的にRNA輸送及び核構造の制御に関わることを示していると考えられた。

Report

(2 results)
  • 2004 Annual Research Report
  • 2003 Annual Research Report
  • Research Products

    (15 results)

All 2004 2003 Other

All Journal Article (6 results) Book (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results) Publications (7 results)

  • [Journal Article] Noncovalent SUMO-1 binding activity of TDG is required for its SUMO-1 modification and colocalization with PMI2004

    • Author(s)
      H.Takahashi
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry (in press)

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] The RanBP2 SUMO E3 ligase is neither HECT nor RING type.2004

    • Author(s)
      A.Pichler
    • Journal Title

      Nature Structural and Molecular Biology 11

      Pages: 984-989

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Overproduction of eukaryotic SUMO-l- and SUMO-2-conjugated proteins in Escherichia coli.2004

    • Author(s)
      Y.Uchimura
    • Journal Title

      Analytical Biochemistry 331

      Pages: 204-206

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Generation of SUMO-1 modified proteins in E.coli: towards understading the biochemistry/strucmral biology of the SUMO-1 pathway.2004

    • Author(s)
      Y.Uchimura
    • Journal Title

      FEBS Letter 564

      Pages: 85-90

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] ユビキチンファミリーの制御機構2004

    • Author(s)
      内村康寛
    • Journal Title

      医学のあゆみ 221

      Pages: 30-33

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] SUMO meets ubiquitin.2004

    • Author(s)
      斉藤寿仁
    • Journal Title

      実験医学 22

      Pages: 1260-1266

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Book] Sumoylation : Molecular Biology and Biochemistry Chanter 6: Edited by V.G.Wilson2004

    • Author(s)
      H.Saitoh
    • Total Pages
      33
    • Publisher
      Horizon Scientific Press, UK.
    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] タンパク質ポリマー及びその購法2003

    • Inventor(s)
      斉藤 寿仁
    • Industrial Property Rights Holder
      熊本テクノ産業財団
    • Filing Date
      2003-10-01
    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Publications] Y.Uchimura: "Generation of SUMO-1 modified proteins in E.coli : Towards understanding the biochemistry/structural biology of the SUMO-1 pathway."FEBS Lett.. (in press). (2004)

    • Related Report
      2003 Annual Research Report
  • [Publications] Y.Uchimura: "Overproduction of Eukaryotic SUMO-1-and SUMO-2-conjugated Proteins in Escherichia coli."Anal.Biochem.. (in press). (2004)

    • Related Report
      2003 Annual Research Report
  • [Publications] S.Isik: "The SUMO pathway is required for selective degradation of DNA topoisomerase IIb induced by a catalytic inhibitor ICRF-193."FEBS Lett.. 546. 347-378 (2003)

    • Related Report
      2003 Annual Research Report
  • [Publications] K.Matsuzaki: "Serum response factor is modulated by the SUMO-1 conjugation system."Biochem.Biophys.Res.Commun.. 306. 32-38 (2003)

    • Related Report
      2003 Annual Research Report
  • [Publications] K.Matsuzaki: "PML-nuclear bodies are involved in cellular serum response."Genes to Cells. 8. 275-286 (2003)

    • Related Report
      2003 Annual Research Report
  • [Publications] Nishijima, H.: "Caffeine mimics adenine and 2'-deoxyadenosine, both of which inhibit the guanin-nucleotide exchange activity of RCC1 and the kinase activity of ATR."Genes to Cells. 8. 423-435 (2003)

    • Related Report
      2003 Annual Research Report
  • [Publications] H.Saitoh: "Sumoylation, molecular biology and biochemistry.Chapter 6:Unraveling the SUMO-2/3 conjugation and de-conjugation pathways.(V.G.Wilson (Ed))"Horizon Bioscience, Norfolk, U.K.. 33(175-208) (2004)

    • Related Report
      2003 Annual Research Report

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Published: 2003-04-01   Modified: 2018-03-28  

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