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大腸菌定常期におけるリボソームの構造と動態

Research Project

Project/Area Number 15030239
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionOsaka Medical College

Principal Investigator

和田 明  大阪医科大学, 医学部, 助教授 (80025387)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 吉田 秀司  大阪医科大学, 医学部, 助手 (60288735)
Project Period (FY) 2003 – 2004
Project Status Completed (Fiscal Year 2004)
Budget Amount *help
¥5,900,000 (Direct Cost: ¥5,900,000)
Fiscal Year 2004: ¥2,800,000 (Direct Cost: ¥2,800,000)
Fiscal Year 2003: ¥3,100,000 (Direct Cost: ¥3,100,000)
Keywordsリボソーム / 定常期 / 転移RNA / mRNA / 100S / 大腸菌 / RFHR二次元電気泳動法 / 100Sリボソーム / ribosome modulation factor / ケミカルフットプリント法 / PTase center / peptide exit tunnel / cryo電子顕微鏡
Research Abstract

今年度は定常期特異的に発現するリボソーム結合蛋白質YhbHとYfiAが100S形成に如何に寄与するかについて研究した。この両者は40%の相同性をもち、YfiAがC末18アミノ酸長いことを除けば非常に良く似ている。またYfiAは主として70Sに結合するが、YhbHは100Sに特異的に結合することをわれわれはすでに見出している。したがって特にYhbHの100S形成に対する寄与が注目される。われわれはYhbH, YfiAの欠損株と二重欠損株を作成し、各株のリボソームの態様を蔗糖密度勾配遠心法で調べた。二重欠損株はRMFのみが結合しているが、形成された70Sダイマーは90Sであった。これに対YfiA欠損株ではRMFとYhbHとが結合しているが、100Sが形成された。この100S形成は野生株よりも多かった。以上の結果はRMF単独では90Sが形成され、これにさらにYhbHが結合すると100Sに転化することを示唆している。かつてin vitroでリボソームにRMFを添加する実験で、定常期のリボソーム(予めYhbHを含んでいる)を用いると100Sが形成され、対数期のリボソーム(YhbHを持たない)を用いると90Sが形成されることとよく斉合する(Wada, BBRC, 1995)。また対数期が終了した直後の細胞で、短時間90Sが観察されることも、YhbHがRMFよりわずかに遅れて発現してくると仮定すれば説明できる。つまり100S形成は二段階であり、まずRMFによって未成熟の90Sが出来、ついでYhbHが結合すると100Sに成熟することが明らかになった。他方YfiAとRMFを持つYhbH欠損株では70Sダイマーが形成されなかった。これはYfiAが100S形成を阻害することを示している。構造が良く似たYhbHとYfiAが100S形成に対して逆の働きを持つことは極めて興味深い(投稿中)。

Report

(2 results)
  • 2004 Annual Research Report
  • 2003 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2005 Other

All Journal Article (2 results) Book (1 results) Publications (5 results)

  • [Journal Article] Modulation of mRNA stability participates in stationary-phase specific expression of ribosome modulation factor, RMF2005

    • Author(s)
      Toshiko Sato, Hideji Yoshida, Akira Wada, Reiko Ohki
    • Journal Title

      J.Bacteriol. (In press)

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] The GTP binding protein homologue ObgE is involved in ribosome maturation2005

    • Author(s)
      Aya Sato, Hideji Yoshida, Akira Wada, Kunio Takeyasu, Chieko Wada
    • Journal Title

      Genes to Cells (In press)

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Book] 生物工学ハンドブック 蛋白質の二次元電気泳動法2005

    • Author(s)
      和田 明
    • Total Pages
      860
    • Publisher
      日本生物工学会
    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Publications] Manabu Sato, Hideji Yoshida, Akira Wada, Yasufumi Kaneda et al.: "Ribosomal protein S0 and S21 are involved in the stability of 18S rRNA in fission yeast, Schizosaccharomyces pombe"B.B.R.C.. 311-4. 942-947 (2003)

    • Related Report
      2003 Annual Research Report
  • [Publications] Hideji Yoshida, Hiroshi Yamamoto, Toshio Uchiumi, Akira Wada: "RMF inactivates ribosome by covering the PTase center and entrance of peptide exit tunnel"Genes to Cells. 9-4. 271-278 (2004)

    • Related Report
      2003 Annual Research Report
  • [Publications] Nobuko Arisue, Hideji Yoshida, Akira Wada, Tetsuo Hasimoto: "Comparative analysis of the ribosomal components of the hydrogenosome-containing protisit, Trichomonas vaginalis"J.Mol.Evol.. (in press). (2004)

    • Related Report
      2003 Annual Research Report
  • [Publications] 和田 明, 吉田秀司, 牧 泰史, 前田真希, 和田千恵子: "ゲノミクス・プロテオミクスの新展開〜生物情報の解析と応用〜"プロテオミクスの新しいツールとしてのRFHR二次元電気泳動法〜大腸菌への適用. 1282 (2004)

    • Related Report
      2003 Annual Research Report
  • [Publications] 和田 明: "生物工学ハンドブック"蛋白質の二次元電気泳動法. 850 (2004)

    • Related Report
      2003 Annual Research Report

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Published: 2003-04-01   Modified: 2018-03-28  

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