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ゲノムのピンポイント修飾を目指したDNA配列特異的な官能基転移反応の検討

Research Project

Project/Area Number 15659004
Research Category

Grant-in-Aid for Exploratory Research

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Chemical pharmacy
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

佐々木 茂貴  九州大学, 薬学研究院, 教授 (10170672)

Project Period (FY) 2003 – 2004
Project Status Completed (Fiscal Year 2004)
Budget Amount *help
¥3,200,000 (Direct Cost: ¥3,200,000)
Fiscal Year 2004: ¥1,500,000 (Direct Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2003: ¥1,700,000 (Direct Cost: ¥1,700,000)
KeywordsS-ニトロシル / S,N-転移反応 / N-ニトロシル / 脱アミノ化 / 点変異 / 遺伝子修復 / 官能基転移 / オリゴヌクレオチド
Research Abstract

がん遺伝子の例で示されるようにわずか1個の塩基の変化で、たんぱく質機能が大きく変化する。本研究は、このような塩基変換を引き起こす化学反応を配列および塩基特異的にコントロールできる高機能分子を開発しようとするものである。本研究では、化学的に遺伝子機能を改変する新しい手法の開発を目的とした。
平成15年度に6位に官能基を含む2-aminopurine nucleoside誘導体とシトシンとの反応を分子軌道計算で予測し、シトシン4-アミノ基にニトロシル基を転移するヌクレオシドアナログとしてS-ニトロシル-6-チオグアノシンを設計した。さらに、チオグアノシンを保護基を用いてDNAに組み込んだ後、SNAP(S-nitroso-N-acetylpenicillamine)と反応させることによりS-ニトロシル体に変換した。引き続きこのようにして合成した6-(S-ニトロシル)-置換-2aminopurineを含むDNAと標的位置にシチジン、5-メチルシチジン、アデノシン、グアノシン、チミジンを含む相補的DNAとの反応性を比較したところ、シチジンと5-メチルシチジン特異的に転移反応が速やかに起こることを確認した。
平成16年度は,主に本反応による点変異誘起能について検討した。すでに、化学反応としては、シチジンあるいは5-メチルシチジンにニトロシル基が転移した標的DNAを酸性条件下1日-5日放置することによりシチジンからはdU(8%)とdC-diazoate^<15>(14%)が5-メチルシチジンからdT(42%)とd^mC-diazoate(13%)が生成することを見出している。そこで、平成16年度にはニトロシル転移DNAを鋳型とするポリメラーゼ反応による変異誘起について調べた。その結果、酸性条件下放置後のDNAは予想通りシチジンの変わりにアデノシンが取り込まれ変異が生じることが確認された。しかし、ニトロシル転移DNAそのものからは有意な変異は観測されなかった。引き続きポリメラーゼは基質特異性があることが知られているので、さらに異なるポリメラーゼによる検討の必要があるものと考えられる。
結論として、本萌芽研究の期間内に従来まったく試みられていなかったニトロシル基の転移による配列および塩基特異的な変異誘起法の基礎を確立した。

Report

(2 results)
  • 2004 Annual Research Report
  • 2003 Annual Research Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2005 2004 Other

All Journal Article (6 results) Book (1 results) Publications (6 results)

  • [Journal Article] Hybridization-Promoted and Cytidine-Selective Activation for Cross-Linking with the Use of 2-Amino-6-Vinylpurine Derivatives2005

    • Author(s)
      T.Kawasaki, F.Nagatsugi Md.M.Ali, M.Maeda, K.Sugiyama, K.Hori
    • Journal Title

      J.Org.Chem. 70(1)

      Pages: 14-23

    • Related Report
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  • [Journal Article] Smart Polyion Complex Micelles for Targeted Intracellular Delivery of PEG vlated Antisense Oligonucleotide with Acid-Labile Linkage2005

    • Author(s)
      M.Oishi, F.Nagatsugi, S.Sasaki, Y.Nagasaki, K.Kataoka
    • Journal Title

      ChemBioChem 6

      Pages: 1-6

    • Related Report
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  • [Journal Article] New DNA Binding Ligands as a Model of Chromomycin A32004

    • Author(s)
      Imoto, S., Haruta Y., Watababe K., Sasaki S.
    • Journal Title

      Bioorg.Med.Chem.Lett 14

      Pages: 4855-4859

    • Related Report
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  • [Journal Article] Sequence- and Base-Specific Delivery of Nitric Oxide to Cytidine and 5-Methylcytidine Leading to Efficient Deamination2004

    • Author(s)
      Md.M.Ali, Md.R.Alam, T.Kawasaki, S.Nakayama, F.Nagatsugi, S., S
    • Journal Title

      J.Am.Chem.Soc. 126

      Pages: 8864-8865

    • Related Report
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  • [Journal Article] Chemical tools for targeted mutagenesis of DNA based on triple helix formation2004

    • Author(s)
      Nagatsugi Fumi, Sasaki Sasaki
    • Journal Title

      Biol Pharm Bull. 27・4

      Pages: 463-467

    • NAID

      110003608787

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  • [Journal Article] Synthesis of 11C-Labeled Bis(phenylalyl)amine and Their in Vitro and in Vivo Binding Properties in Rodent and Monkey Brains2004

    • Author(s)
      Shigeki Sasaki, Fumie Kurosaki, Terushi Haradahira, Fumihiko Yamamoto, Jun Maeda, Takesh Okauchik Kazatoshi Suzuki, Tetsuya
    • Journal Title

      Biol.Pharm.Bull 27(4)

      Pages: 531-537

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  • [Book] Molecular Design for Specific Recognition and Reaction in Genome-Targeting Chemistry in Frontiers in Organic Chemistry2005

    • Author(s)
      Shigeki Sasaki, Fumi Nagatsugi
    • Publisher
      Bentham Science Publishers Ltd
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  • [Publications] Nagatsugi F., Sasaki S., Miller P.S., Seidman M.M.: "Site-Specific Mutagenesis by Triple-Helix Forming Oligonucleotides Containing a Reactive Nucleoside Analogue."Nucleic Acids Res.. 31・6. e31 (2003)

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  • [Publications] Shigeki Sasaki, Yosuke Taniguchi, Ryo Takahashi, Yusuke Senko, Keiichi Kodama, Fumi Nagatsugi, Minoru Maeda: "Selective Formation of Stable Triplexes Including a TA or a CG Interrupting Site with New Bicyclic Nucleoside Analogs (WNA)"J.Amer.Chem.Soc.. 126(2). 516-528 (2004)

    • Related Report
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  • [Publications] Tanada, Mikimasa, Shibata, Yoshihiro, Maeda, Minoru, Sasaki, Shigeki: "Bipyrrole Derivatives as New DNA-Minor Groove Binders,"Heterocycles. 63(1). 29-39 (2004)

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  • [Publications] Oishi M, Sasaki S, Nagasaki Y, Kataoka K.: "pH-responsive oligodeoxynucleotide (ODN)-poly(ethylene glycol) conjugate through acid-labile beta-thiopropionate linkage : preparation and polyion complex micelle formation,"Biomacromolecules. 4(5). 1426-1432 (2003)

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  • [Publications] Hiroshi Tokiwa, Nobuyuki Sera, Kiyoshi Fukuhara, Hideo Utsumi, Shigeki Sasaki, Naoki Miyata: "Structural activity relationship between Salmonella-mutagenicity and nitro-orientation of nitroazaphenanthrenes,"Chemico-Biological Interactions. 146(1). 19-25 (2003)

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  • [Publications] 佐々木茂貴: "ゲノムケミストリー第2章6,2本鎖DNA形成をトリガーとするシンクロナイゼーション活性化によるクロスリンク反応(関根光雄, 斎藤烈編)"講談社サイエンティフィク. 240(89-100) (2003)

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Published: 2003-04-01   Modified: 2016-04-21  

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