マダイイリドウイルス耐病形質を識別可能な遺伝マーカーの単離

• Project/Area Number: 15780131
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: General fisheries
• Research Institution: Tokyo University of Marine Science and Technology (2004-2005); 東京水産大学 (2003)
• Principal Investigator: 坂本 崇 東京海洋大学, 海洋科学部, 助教授 (40313390)
• Project Period (FY): 2003 – 2005
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2005)
• Budget Amount: ¥3,800,000 (Direct Cost: ¥3,800,000); Fiscal Year 2005: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000); Fiscal Year 2004: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000); Fiscal Year 2003: ¥1,500,000 (Direct Cost: ¥1,500,000)
• Keywords: マイクロサテライト / 遺伝子地図 / 連鎖地図 / 耐病性 / QTL解析 / マダイ / 遺伝形質 / 連鎖解析

Research Abstract

1.マダイマイクロサテライト連鎖地図の作成
昨年度までに合計132マーカー座からなるマダイマイクロサテライト連鎖地図を作成した。今年度は、昨年度開発したマイクロサテライトマーカーを用いて、新たに41マーカー座をマッピングし、合計173マーカー座を用いたマダイマイクロサテライト連鎖地図を作成した。
2.マダイイリドウイルス耐病形質を識別可能な遺伝マーカーの単離
(株)日本水産・中央研究所大分海洋研究センターにおいて飼育されているマダイイリドウイルス耐病性系統と感受性系統を交配したF_1家系を作出し、このF_1家系に感受性系統を戻し交配したマダイイリドウイルス耐病形質解析家系を作出した。この戻し交配家系において、マダイイリドウイルス人為感染実験を行い、各個体の表現型(生存と死亡)を評価した。各個体のゲノムDNAを抽出し、マイクロサテライトマーカーを用いてマーカー型を解析した。各個体の表現型とマーカー型との関連性を連鎖解析した結果、イリドウイルス耐性形質と関連する6マーカー座を明らかにした。さらに、この解析家系で耐病性形質と有意差な関連性みられたマーカー座に関して、遺伝的背景の異なる2家系でも連鎖解析を行った。その結果、6マーカー座のうち、2マーカー座で他の解析家系でも同様の関連性が見出された。この2マーカー座は、マダイイリドウイルス耐病形質を識別可能な遺伝マーカーとして特に有効であると考えられた。
3.マダイMHC class Iとマダイイリドウイルス耐病形質との関連性の解析
マダイMHC class Iをマダイマイクロサテライト連鎖地図上にマッピングした結果、マダイイリドウイルス耐病形質と関連性のあるマイクロサテライトマーカーが存在する領域と異なる領域にマッピングされた。この解析家系では、マダイMHC class Iはイリドウイルス耐性形質との関連性は低いと考えられた。

Research Products

• [Journal Article] Characterization of novel microsatellite DNA markers in ayu, Plecoglossus altivelis. (2006)
  • Author(s): M.Hara et al.
  • Journal Title: Fisheries Science 72(1) Pages: 208-210
• [Journal Article] Identification of a single major genetic locus controlling the resistance to lymphocystis disease in Japanese flounder (Paralichthys olivaceus). (2006)
  • Author(s): K.Fuji et al.
  • Journal Title: Aquaculture (In press)
• [Journal Article] Genetic linkage maps of two yellowtails (Seriola quinqueradiata and Seriola lalandi). (2005)
  • Author(s): E.Ohara et al.
  • Journal Title: Aquaculture 244 Pages: 41-48
• [Journal Article] Sex-linked quantitative trait loci for thermotolerance and length in rainbow trout. (2005)
  • Author(s): G.M.Perry et al.
  • Journal Title: Journal of Heredity 96 Pages: 97-107
• [Journal Article] Structural and functional evolution of three cardiac natriuretic peptides. (2005)
  • Author(s): K.Inoue et al.
  • Journal Title: Molecular Biology and Evolution 22(12) Pages: 2428-2434
• [Journal Article] A comparative analysis of the rainbow trout genome with two other species of fish (Arctic chary and Atlantic salmon) within the tetraploid derivative Salmonidae family (subfamily : Salmoninae). (2005)
  • Author(s): R.G.Danzmann et al.
  • Journal Title: Genome 48(6) Pages: 1037-1051
• [Journal Article] Identification of a Novel Chromosomal Region Associated with Infectious Hematopoietic Necrosis (IHN) Resistance in Rainbow Trout Oncorhynchus mykiss. (2004)
  • Author(s): S-K Khoo et al.
  • Journal Title: Fish Pathology 39 Pages: 95-101
• [Journal Article] マイクロサテライトマーカーを用いた連鎖地図作成と有用遺伝形質の解析 (2004)
  • Author(s): 坂本 崇
  • Journal Title: 日本水産学会誌 70(4) Pages: 496-499
  • NAID: 110003145759
• [Book] 海洋生命系のダイナミクス(2)「海洋生物の機能」 (2005)
  • Author(s): 坂本 崇(分担執筆)
  • Total Pages: 428
  • Publisher: 東海大学出版会
• [Publications] Maria R.M.Coimbra, et al.: "A genetic linkage map of the Japanese flounder, Paralichthys olivaceus."Aquaculure. 220. 203-218 (2003)
• [Publications] Kathleen G.O'Malley, Takashi Sakamoto, et al.: "Quantitative trait loci for spawning date and body weight in rainbow trout : Testing for conserved effects across ancestrally duplicated chromosomes."Journal of Heredity. 94. 273-284 (2003)
• [Publications] A.Ozaki, S.Khoo, T.Sakamoto, N.Okamoto: "Thirty-one polymorphic microsatellite markers for genetic mapping in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)."Animal Genetics. 34. 315-317 (2003)
• [Publications] Eriko Ohara, et al.: "Isolation and characterization of microsatellite loci from yellowtail Seriola quinqueradiata and cross-species amplification within the genus Seriola."Molecular Ecology Notes. 3. 390-391 (2003)