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合成プロモーターを用いた感染応答の分子マーカー群の開発

Research Project

Project/Area Number 15F15088
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section外国
Research Field Plant protection science
Research InstitutionGifu University

Principal Investigator

山本 義治  岐阜大学, 応用生物科学部, 教授 (50301784)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) MOST. HUSHNA ARA Naznin  岐阜大学, 応用生物科学部, 外国人特別研究員
MOST. HUSHNA ARA NAZNIN  岐阜大学, 応用生物科学部, 外国人特別研究員
Project Period (FY) 2015-04-24 – 2017-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2016)
Budget Amount *help
¥2,300,000 (Direct Cost: ¥2,300,000)
Fiscal Year 2016: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2015: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
Keywords過酸化水素 / 転写制御配列 / 合成プロモーター / 植物ホルモン応答 / レポーター遺伝子
Outline of Annual Research Achievements

シロイヌナズナのマイクロアレイ解析を詳細に行った。地上部のタイムコース(0h、3h、6h、12h、24h)、根部、また根部及び地上部での全身応答についてRNAを調製しマイクロアレイ解析を行った。
得られたマイクロアレイデータのうち地上部タイムコースの解析結果を用いて、過酸化水素応答を担う転写制御配列をプロモーター領域より多数予測した。また、並行して生物・環境ストレス応答(細菌性斑紋病(シュードモナス)感染、黒斑病(アルタナリア)感染、エリシター応答、傷害、塩、低温、紫外線、高温、高浸透圧、乾燥、他)及びストレス系植物ホルモン応答(ジャスモン酸、エチレン、ABA、及びサリチル酸)の外部マイクロアレイデータを取り込み転写制御配列を予測した。これらの予測結果を過酸化水素応答を担う予測配列と参照することで、多数の過酸化水素応答配列候補を分類することができた。これらの解析結果については過酸化水素応答を担う転写制御ネットワークの部分的な解明結果と合わせて投稿準備中である。
予測された過酸化水素応答配列候補をそれぞれの分類グループから満遍なく選抜し計20程度の候補配列を得た。これらについてそれぞれ合成プロモーターを作成しレポーター遺伝子であるナノランタンをドライブさせシロイヌナズナへ導入した。現在植物へのアグロバクテリアの感染とT1種子の調製は完了しており、薬剤耐性を指標として形質転換体の選抜とライン化を進めている。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2016 Annual Research Report
  • 2015 Annual Research Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2016 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Possible involvement of MYB44-mediated stomatal regulation in induced systemic resistance by Penicillium simplicissimum GP17-2 in Arabidopsis.2016

    • Author(s)
      Hieno A, Naznin HA, Hyakumachi M, Higuchi M, Matsui M, Yamamoto YY
    • Journal Title

      Microbes and Environments

      Volume: in press

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Specific detection of Type 1 and Type 2 isolates of Pyrenochaeta lycopersici by loop-mediated isothermal amplification reaction.2016

    • Author(s)
      Hieno A, Naznin HA, Suga H, Yamamoto YY, Hyakumachi M
    • Journal Title

      Acta Agri Scand, Sect B

      Volume: 66 Issue: 4 Pages: 353-358

    • DOI

      10.1080/09064710.2015.1120341

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Empirical identification of the transcriptional network for H2O2 responses in Arabidopsis2016

    • Author(s)
      Hieno A, Naznin HA, Hasegawa-Inaba K, Yokogawa T, Obata D, Nomoto M, Tada Y, Yokogawa T, Higuchi M, Hanada K, Matui M, Hirayama T, Mitsuda N, Yamamoto YY
    • Organizer
      The 13th International Colloquium on Endocytobiology and Symbiosis, Kyoto
    • Place of Presentation
      Kyoto
    • Year and Date
      2016-09-10
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 過酸化水素応答を担う転写因子間の発現制御ネットワークの実験的同定2016

    • Author(s)
      日恵野綾香、フシュナ・アラ・ナズニン、長谷川桂子、横川朋子、小畑大地、横川隆志、野元美佳、多田安臣、山本義治
    • Organizer
      日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      盛岡
    • Year and Date
      2016-03-18
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] シロイヌナズナの過酸化水素応答のトランスクリプトーム解析2016

    • Author(s)
      日恵野綾香、 フシュナ・アラ・ナズニン、花田耕介、樋口美栄子、松井南、山本義治
    • Organizer
      日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      盛岡
    • Year and Date
      2016-03-18
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Remarks] Plant Promoter Database

    • URL

      http://ppdb.agr.gifu-u.ac.jp

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Remarks] 研究室ホームページ

    • URL

      http://www1.gifu-u.ac.jp/~yyy/

    • Related Report
      2015 Annual Research Report

URL: 

Published: 2015-11-26   Modified: 2024-03-26  

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