Project/Area Number |
15H00473
|
Research Category |
Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
|
Allocation Type | Single-year Grants |
Research Field |
農学・水産学
|
Research Institution | 那須野ヶ原アニマルクリニック |
Principal Investigator |
鷹栖 雅峰 那須野ヶ原アニマルクリニック, 院長 : 獣医師
|
Project Period (FY) |
2015
|
Project Status |
Completed (Fiscal Year 2015)
|
Budget Amount *help |
¥500,000 (Direct Cost: ¥500,000)
Fiscal Year 2015: ¥500,000 (Direct Cost: ¥500,000)
|
Keywords | スコティッシュ・フォールド・キャット / フィブリリン2 / RT-PCR |
Outline of Annual Research Achievements |
本研究は、スコティッシュ・フォールド・キャット(スコティッシュ)の折れ耳表現型とリンクする骨軟骨形成不全症に関わる遺伝子の探索を行ったものである。昨年度の奨励研究(26925026)によるスコティッシュのゲノムDNAを用いたエクソン解析では、エクソン近傍のイントロンおよびエクソン領域に多数の点変異が認められ、中にはスプライシング異常をもたらす可能性のある変異が複数確認された。 本年度は、スコティッシュの卵巣由来のtotal RNAを用いて、フィブリリン2遺伝子(FBN2)のmRNAを逆転写-ポリメラーゼ連鎖反応(RT-PCR)を行い、cDNA解析を行った。NCBIの情報(XM_003980732)をもとに、FBN2のオープンリーディングフレーム全長(8, 739bp)は大型であるため、複数のフラグメントに分け、全長をカバーするように複数のプライマーを設計した。RT-PCRで増幅されたPCR産物をアガロースゲル電気泳動でサイズ分画を行い、プライシングの有無あるいは異常を調査した。またRT-PCR産物のダイレクト・シーケンシングによりcDNA配列を解析した。得られたcDNA配列をアビシニアン由来のFBN2 cDNA配列(XM_003980732)と比較して変異の有無を確認した。 スコティッシュのFBN2のRT-PCR産物はアガロースゲル電気泳動上で全て単一増幅物であり、スプライシング異常を疑うサイズ分画は得られなかった。PCR産物のダイレクト・シーケンシングから得られたcDNAの配列にもミスセンス変異や欠損変異は認められなかった。 ゲノムDNAのエクソン解析ではスプライシングに影響する可能性のある点変異を複数確認したが、いずれの変異もサイレント変異であり、スプライシング異常には影響を及ぼさないと考えられた。エクソン解析およびcDNA解析の結果から、フィブリリン2はスコティッシュの骨軟骨形成不全症には関連していないことが明らかになった。
|