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細胞分化における体細胞piRNAの機能解明

Research Project

Project/Area Number 15J00469
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Insect science
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

庄司 佳祐  東京大学, 農学生命科学研究科, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2015-04-24 – 2017-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2016)
Budget Amount *help
¥2,300,000 (Direct Cost: ¥2,300,000)
Fiscal Year 2016: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2015: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
KeywordspiRNA / BmN4 / 脂肪細胞分化 / Bombyx mori / small RNA / 小分子RNA / ピンポンサイクル / トランスクリプトーム / エピジェネティクス
Outline of Annual Research Achievements

piRNAは主に生殖巣において機能すると考えられているが、近年、体細胞においても機能することが示唆されつつある。本研究ではpiRNAを発現する卵巣由来のカイコ培養細胞(BmN4)を脂肪細胞様に分化させ、生殖細胞から体細胞に分化する際のpiRNA動態を捉えるための実験基盤の構築を目的とした。また、BmN4細胞を用いた人工piRNA産生系の確立を試みた。
1. piRNAの多くはゲノム上のpiRNAクラスタと呼ばれる領域に由来する。BmN4細胞における脂肪細胞分化誘導時のmRNAおよびpiRNAの変動を調査したところ、piRNAクラスタの一部から発現するmRNAおよびpiRNAは、脂肪細胞分化によって顕著に変化した。カイコ胚子期の発達段階別のpiRNAライブラリとの比較を行った結果、これらのpiRNAクラスタは、胚子の発達に伴っても類似の発現変動を示すことが分かった。この結果は、本研究で用いた誘導系がpiRNAクラスタの発現調節の観点で胚子期の変動を模倣している可能性を示唆している。この結果は平成29年度蚕糸・昆虫機能利用学術講演会において発表した。
2. piRNAはping-pong cycleと呼ばれる増幅経路によって増幅すると考えられている。しかし、ping-pong cycleはバイオインフォマティクス解析から想定されたモデルであって、堅固な実験的証明は存在しなかった。本研究では、BmN4細胞を用いて人工的にping-pong piRNAを産生する系を構築し、ping-pong cycleの実証に成功した。さらに、この実験系を利用することによって、piRNA-PIWIタンパク質による認識には17塩基の相補が必要であり、22塩基の相補があれば充分であることを示した。この結果は、RNA誌に発表するとともに、国際学会においても発表を行い、学生優秀発表賞を受賞した。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2016 Annual Research Report
  • 2015 Annual Research Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2017 2016 2015 Other

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Identification of a bipartite nuclear localization signal in the silkworm Masc protein2016

    • Author(s)
      Sugano Y, Kokusho R, Ueda M, Fujimoto M, Tsutsumi N, Shimada T, Kiuchi T, Katsuma S.
    • Journal Title

      FEBS Lett.

      Volume: 590 Issue: 1 Pages: 2256-2261

    • DOI

      10.1261/rna.058875.116

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Identification and functional analysis of the pre-piRNA 3′ Trimmer in silkworms.2016

    • Author(s)
      Izumi N, Shoji K, Sakaguchi Y, Honda S, Kirino Y, Suzuki T, Katsuma S, Tomari Y
    • Journal Title

      Cell

      Volume: 164 Issue: 5 Pages: 962-973

    • DOI

      10.1016/j.cell.2016.01.008

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Is the expression of sense and antisense transgenes really sufficient for artificial piRNA production?2015

    • Author(s)
      Keisuke Shoji and Susumu Katsuma
    • Journal Title

      Current Biology

      Volume: 25 Issue: 16 Pages: R708-R710

    • DOI

      10.1016/j.cub.2015.07.001

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 生殖細胞系列から体細胞への分化がpiRNA経路に与える影響2017

    • Author(s)
      庄司佳祐・鈴木穣・菅野純夫・嶋田透・勝間進
    • Organizer
      平成29年度蚕糸・昆虫機能利用学術講演会(日本蚕糸学会第87回大会)
    • Place of Presentation
      農林水産技術会議事務局 筑波産学連携支援センター (茨城県 つくば市)
    • Year and Date
      2017-03-21
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Artificial “ping-pong” cascade of PIWI-interacting RNA in silkworm cells.2017

    • Author(s)
      Keisuke Shoji and Susumu Katsuma.
    • Organizer
      The 5th Asia-Pacific Congress of Sericulture and Insect Biotechnology
    • Place of Presentation
      Maruay Garden Hotel (Thailand Bangkok)
    • Year and Date
      2017-02-28
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Revealing Nbr functions in pre-piRNA trimming in silkworms by bioinfomatics analysis2016

    • Author(s)
      Keisuke Shoji, Natsuko Izumi, Yukihide Tomari, Susumu Katsuma.
    • Organizer
      RNA 2016
    • Place of Presentation
      Kyoto International Conference Center (Kyoto-hu Kyoto-shi)
    • Year and Date
      2016-06-28
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Proof-of-concept for the “ping-pong” amplification cycle of PIWI-interacting RNAs.2016

    • Author(s)
      Keisuke Shoji, Yutaka Suzuki, Sumio Sugano, Toru Shimada, and Susumu Katsuma
    • Organizer
      Keystone symposia [Small RNA Silencing: Little Guides, Big Biology]
    • Place of Presentation
      Keystone, Colorado USA
    • Year and Date
      2016-01-25
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] カイコ培養細胞を用いたping-pong cycleの実験的証明2015

    • Author(s)
      庄司佳祐・鈴木穣・菅野純夫・嶋田透・勝間進.
    • Organizer
      第38回分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Remarks] 昆虫遺伝研究室ホームページ

    • URL

      http://papilio.ab.a.u-tokyo.ac.jp/igb/

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Remarks] カイコ培養細胞を用いた人工ping-pong piRNA産生系の確立

    • URL

      http://www.a.u-tokyo.ac.jp/topics/2016/20161101.html

    • Related Report
      2016 Annual Research Report

URL: 

Published: 2015-11-26   Modified: 2024-03-26  

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