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人工遺伝子スイッチSAHA-PIPによる心筋細胞の誘導

Research Project

Project/Area Number 15J02111
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Chemical biology
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

谷口 純一  京都大学, 理学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2015-04-24 – 2018-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2017)
Budget Amount *help
¥2,800,000 (Direct Cost: ¥2,800,000)
Fiscal Year 2017: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2016: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2015: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Keywordsピロールイミダゾールポリアミド / 遺伝子発現制御 / エピジェネティクス / ヒストンアセチル化 / ブロモドメイン / 人工ヒストンコード / SOX2 / ヒト多能性幹細胞 / 分化誘導制御 / 人工遺伝子スイッチ / DNA結合分子
Outline of Annual Research Achievements

前年度(平成28年度)はヒト多能性幹細胞から中胚葉への分化を阻害する転写因子SOX2の結合DNA配列を標的としたPIPにより、中胚葉誘導と心筋細胞の分化誘導を達成した。本年度(平成29年度)はこのPIPの詳細な評価を行うとともに、中胚葉誘導プロトコルを最適化した。これらの成果は国際学術誌Nucleic Acids Researchに掲載された。
一方、遺伝子活性化に関して、SAHA-PIPの遺伝子活性化能は不安定であった。この理由としてSAHA-PIPの作用がHDACの阻害による間接的なものであることが考えられ、より直接的にヒストンアセチル化を誘導する分子の開発が望まれた。そこで今年度私は、新たなヒストンアセチル化誘導分子としてBi-PIPを開発した。Bi-PIPはP300/CBP選択的なブロモドメイン阻害剤とPIPから成る分子であり、標的DNA配列へヒストンアセチル基転移酵素P300/CBPを直接リクルートすることでアセチル化を誘導すると期待された。試験管内の実験により、実際にBi-PIPが標的配列を有するヌクレオソームのヒストンをアセチル化することが明らかとなった。また、培養細胞を用いた実験により、Bi-PIPが細胞内でも配列選択的にヒストンアセチル化を誘導し、遺伝子発現を変化させることが示唆された。
細胞内でP300/CBPのブロモドメインはアセチル化ヒストンを認識・結合し、近傍のヒストンを新規アセチル化することでヒストンアセチル化の伝搬へ貢献している。このことから、Bi-PIPはP300/CBPのブロモドメインに認識されうるという点で、人工ヒストンコードととらえることができ、DNA配列選択的な新規エピゲノム制御分子としての利用が期待される。この研究結果は国際学術誌Journal of the American Chemical Societyへ投稿し、受理された。

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2017 Annual Research Report
  • 2016 Annual Research Report
  • 2015 Annual Research Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2018 2017 2016 2015 Other

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Biomimetic Artificial Epigenetic Code for Targeted Acetylation of Histones2018

    • Author(s)
      Junichi Taniguchi, Yihong Feng, Ganesh N. Pandian, Fumitaka Hashiya, Takuya Hidaka, Kaori Hashiya, Soyoung Park, Toshikazu Bando, Shinji Ito, Hiroshi Sugiyama
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: in press

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A synthetic DNA-binding inhibitor of SOX2 guides human induced pluripotent stem cells to differentiate into mesoderm2017

    • Author(s)
      Taniguchi Junichi、Pandian Ganesh N.、Hidaka Takuya、Hashiya Kaori、Bando Toshikazu、Kim Kyeong Kyu、Sugiyama Hiroshi
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 45 Issue: 16 Pages: 9219-9228

    • DOI

      10.1093/nar/gkx693

    • NAID

      120006348322

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Targeted acetylation of nucleosomes by introducing artificial histone codes of acetylation at specific DNA sequences2018

    • Author(s)
      Junichi Taniguchi, Shinji Ito, Hiroshi Sugiyama
    • Organizer
      第2回京都生体質量分析研究会シンポジウム
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] Targeted histone acetylation and gene activation by synthetic molecules that recruit P300 histone acetyltransferase to a specific DNA sequence2017

    • Author(s)
      Junichi Taniguchi, Ganesh N. Pandian, Toshikazu Bando, Hiroshi Sugiyama
    • Organizer
      2017年度生命科学系学会合同年次大会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] Cardiomyocytes Induction By DNA Sequence-Specific Synthetic Molecules2017

    • Author(s)
      谷口純一、Namasivayam Ganesh Pandian、板東俊和、杉山弘
    • Organizer
      日本化学会第97春季年会
    • Place of Presentation
      慶應義塾大学 日吉キャンパス、横浜
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] DNA sequence motif-targeted synthetic molecules for directed differentiation of pluripotent stem cells2016

    • Author(s)
      TANIGUCHI, Junichi; NAMASIVAYAM, Ganesh Pandian; SATO, Shinsuke; BANDO, Toshikazu; SUGIYAMA, Hiroshi
    • Organizer
      日本化学会第96春季年会
    • Place of Presentation
      同志社大学京田辺キャンパス、京都
    • Year and Date
      2016-03-24
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] DNA Sequence Motif-Targeted Synthetic Molecules for Directed Differentiation of Pluripotent Stem Cells2016

    • Author(s)
      Junichi Taniguchi, Ganesh Pandian Namasivayam, Toshikazu Bando, Hiroshi Sugiyama
    • Organizer
      Bioorganic Chemistry, Gordon Research Conference (2016)
    • Place of Presentation
      Proctor Academy, Andover, New Hampshire, USA
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] DNA結合性化合物Py-Imポリアミドによる選択的な遺伝子発現制御2016

    • Author(s)
      谷口純一、Namasivayam Ganesh Pandian、板東俊和、杉山弘
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会第11回年会
    • Place of Presentation
      京都テルサ、京都
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] DNA Sequence-Specific Synthetic Gene Switches For Cell Fate Control2016

    • Author(s)
      Junichi Taniguchi, Ganesh Pandian Namasivayam, Toshikazu Bando, Hiroshi Sugiyama
    • Organizer
      The 43rd International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • Place of Presentation
      Kumamoto University, Kuamamoto, Japan
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] DNA結合性化合物Py-Imポリアミドによる幹細胞の分化誘導制御2016

    • Author(s)
      谷口純一、Namasivayam Ganesh Pandian、板東俊和、杉山弘
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、横浜
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Synthetic genetic switches for directed differentiation of human pluripotent stem cells2015

    • Author(s)
      Junichi Taniguchi, Yulei Wei, Tatsuya Sadoi, Ganesh N Pandian, Shinsuke Sato, Toshikazu Bando, Hiroshi Sugiyama
    • Organizer
      Pacifichem 2015
    • Place of Presentation
      ハワイ、アメリカ合衆国
    • Year and Date
      2015-12-18
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] SYNTHETIC DNA-BINDING EPIGENETIC SWITCHES FOR CELL FATE CONTROL2015

    • Author(s)
      Junichi Taniguchi, Namasivayam Ganesh Pandian, Junetha Syed Jabarulla, Le Han, Shinsuke Sato, Anandhakumar Chandran, Toshikazu Bando, Hiroshi Sugiyama
    • Organizer
      International Society for Stem Cell Research Annual Meeting 2015
    • Place of Presentation
      ストックホルム、スウェーデン
    • Year and Date
      2015-06-25
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 遺伝子を直接制御する合成分子で組織再生の道が開ける

    • URL

      http://www.kyoto-u.ac.jp/ja/research/research_results/2017/170731_2.html

    • Related Report
      2017 Annual Research Report

URL: 

Published: 2015-11-26   Modified: 2024-03-26  

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