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複雑反応経路網に適用し得る速度解析法の開発

Research Project

Project/Area Number 15J02125
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Physical chemistry
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

住谷 陽輔  北海道大学, 大学院総合化学院, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2015-04-24 – 2018-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2017)
Budget Amount *help
¥2,800,000 (Direct Cost: ¥2,800,000)
Fiscal Year 2017: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2016: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2015: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Keywords速度解析 / 反応経路自動探索 / 多成分連結反応 / 有機反応 / 反応経路ネットワーク / 表面反応 / 分岐比 / stiff問題 / 反応予測 / 縮約 / コンフォメーションエントロピー / 反応性 / 選択性 / 有機反応解析
Outline of Annual Research Achievements

初年度に開発した速度定数行列縮約(RCMC)法の応用範囲を拡げた。RCMC法では、短時間で行き来する安定構造同士を一つにまとめ、安定構造の重み付き総和として得られる超状態間のオーバーオールの速度定数を計算できる。前年度はRCMC法を反応経路の自動探索を行う人工力誘起反応(AFIR)法と組み合わせたプログラムを作成したので、当該年度で本手法の更なる開発と応用を行った。
本手法では、RCMC法による速度解析を、反応経路自動探索のナビゲーションシステムとして利用する。これにより、速度論に基づいて反応経路の探索領域を制限し、反応物から指定した温度・反応時間で到達し得る反応経路を効率的に探索できる。本手法をPasserini反応に適用した。本反応は、多成分の反応基質が相互作用する複雑な反応だが、起こり得る反応機構を得ることができた。本手法の探索では、分子の結合情報や反応パターンなどの情報は使用せず、完全に系統的である。現在、プログラムのチューニングを終え、論文の投稿準備を進めている。
また、さらに計算を高速化する手順を考案し、論文で報告した。この方法では、2つの手順から反応経路ネットワークを作成する。具体的には、(1) 最初の探索ではAFIR法で近似的なlocally updated plane(LUP)経路を求める。(2) 得られたLUP経路ネットワークからボトルネックとして振る舞う経路をRCMC法で抽出し、その経路のみ遷移状態(TS)構造最適化を行い、固有反応座標(IRC)経路を求める。これにより、速度解析の結果にほぼ影響しない経路のTS構造最適化とIRC計算を削減できる。本手順は、Cu(111)表面上のH2Oの反応に適用した。これにより、ボトルネックであった結合組み替えの過程をIRC経路として、その他の高速で進行する過程をLUP経路とした反応経路ネットワークを得ることができた。

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2017 Annual Research Report
  • 2016 Annual Research Report
  • 2015 Annual Research Report
  • Research Products

    (23 results)

All 2018 2017 2016 2015 Other

All Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (16 results) (of which Int'l Joint Research: 7 results,  Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Implementation and performance of the artificial force induced reaction method in the GRRM17 program2018

    • Author(s)
      S. Maeda, Y. Harabuchi, M. Takagi, K. Saita, K. Suzuki, T. Ichino, Y. Sumiya, K. Sugiyama, Y. Ono
    • Journal Title

      Journal of Computational Chemistry

      Volume: 4 Issue: 4 Pages: 233-251

    • DOI

      10.1002/jcc.25106

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Global Reaction Route Mapping for Surface Adsorbed Molecules: A Case Study for H2O on Cu(111) Surface2018

    • Author(s)
      S. Maeda, K. Sugiyama, Y. Sumiya, M. Takagi, K. Saita
    • Journal Title

      Chemistry Letters

      Volume: 47 Issue: 4 Pages: 396-399

    • DOI

      10.1246/cl.171194

    • NAID

      130006638939

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Designing Backbone of Hexasilabenzene Derivatives Possessing a High Unimolecular Kinetic Stability2018

    • Author(s)
      Y. Sumiya, S. Maeda
    • Journal Title

      Chemistry - A European Journal

      Volume: 印刷中 Issue: 47 Pages: 12264-12268

    • DOI

      10.1002/chem.201801699

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] An autocatalytic cycle in autoxidation of triethylborane2017

    • Author(s)
      R. Uematsu, C. Saka, Y. Sumiya, T. Ichino, T. Taketsugu, S. Maeda
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Volume: 53 Issue: 53 Pages: 7302-7305

    • DOI

      10.1039/c7cc02541f

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Full Rate Constant Matrix Contraction Method for Obtaining Branching Ratio of Unimolecular Decomposition2017

    • Author(s)
      Yosuke Sumiya, Tetsuya Taketsugu, Satoshi Maeda
    • Journal Title

      Journal of Computational Chemistry

      Volume: 38 Issue: 2 Pages: 101-109

    • DOI

      10.1002/jcc.24526

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Kinetic Analysis for the Multistep Profiles of Organic Reactions: Significance of the Conformational Entropy on the Rate Constants of the Claisen Rearrangement2015

    • Author(s)
      Yosuke Sumiya, Yutaka Nagahata, Tamiki Komatsuzaki, Tetsuya Taketsugu, Satoshi Maeda
    • Journal Title

      The Journal of Physical Chemistry

      Volume: 119 Issue: 48 Pages: 11641-11649

    • DOI

      10.1021/acs.jpca.5b09447

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 速度定数行列縮約法を用いた反応経路自動探索の効率化:多成分連結反応への応用2017

    • Author(s)
      住谷陽輔、武次徹也、前田理
    • Organizer
      日本化学会 第97春季年会
    • Place of Presentation
      慶應義塾大学 日吉キャンパス(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2017-03-16
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] 複雑化学反応経路ネットワークに適用し得る速度解析法の開発と反応予測2017

    • Author(s)
      住谷陽輔
    • Organizer
      クロスボーダーシンポジウム
    • Place of Presentation
      北海道大学理学部(札幌市北区)
    • Year and Date
      2017-01-08
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 多成分連結反応の反応経路ネットワークとその速度論的理解:パッセリーニ反応2017

    • Author(s)
      住谷陽輔、前田理
    • Organizer
      第20回理論化学討論会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] Conformational Entropy of Unimolecular Reactions Studied by a New Kinetic Approach2017

    • Author(s)
      Yosuke Sumiya, Tetsuya Taketsugu, Satoshi Maeda
    • Organizer
      13TH INTERNATIONAL CONFERENCE OF COMPUTATIONAL METHODS IN SCIENCES AND ENGINEERING (ICCMSE2017)
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Reaction mechanism and kinetics of organic multicomponent reactions studied by combined automatic reaction path search and rate constant matrix contraction methods2017

    • Author(s)
      Yosuke Sumiya, Satoshi Maeda
    • Organizer
      第33回化学反応討論会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Conformational entropy of Claisen rearrangement calculated by rate constant matrix contraction method2017

    • Author(s)
      Yosuke Sumiya, Satoshi Maeda
    • Organizer
      11th Triennial Congress of the World Association of Theoretical and Computational Chemistry
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 分子内Diels-Alder反応におけるコンフォメーションエントロピー2016

    • Author(s)
      住谷陽輔、武次徹也、前田理
    • Organizer
      第10回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      神戸ファッションマート(兵庫県神戸市東灘区)
    • Year and Date
      2016-09-13
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Conformational entropy in Claisen rearrangement studied by a new kinetic approach2016

    • Author(s)
      住谷陽輔、武次徹也、前田理
    • Organizer
      International Symposium on Pure & Applied Chemistry 2016
    • Place of Presentation
      Borneo Convention Centre(Kuching, Malaysia)
    • Year and Date
      2016-08-15
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Kinetic Analysis for Complex Reaction Networks: Importance of Conformational Entropy2016

    • Author(s)
      住谷陽輔、武次徹也、前田理
    • Organizer
      23rd IUPAC Conference on Physical Organic Chemistry
    • Place of Presentation
      University of New South Wales(Sydney, Australia)
    • Year and Date
      2016-07-03
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 複雑反応経路網上で起こる単分子解離反応の分岐比の厳密解2016

    • Author(s)
      住谷陽輔、武次徹也、前田理
    • Organizer
      第19回理論化学討論会
    • Place of Presentation
      早稲田大学 西早稲田キャンパス(東京都新宿区大久保)
    • Year and Date
      2016-05-23
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] 単分子解離反応の分岐比を算出する速度定数行列完全縮約法の開発2016

    • Author(s)
      住谷陽輔、武次徹也、前田理
    • Organizer
      化学反応経路探索のニューフロンティア2016
    • Place of Presentation
      京都教育文化センター(京都府京都市左京区)
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Kinetic analysis for complex reaction networks: Application to organic reactions2015

    • Author(s)
      住谷陽輔、前田理、武次徹也
    • Organizer
      Pacifichem2015
    • Place of Presentation
      Hawaii Convention Center (Honolulu, America)
    • Year and Date
      2015-12-15
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 時間発展を考慮した反応経路自動探索2015

    • Author(s)
      住谷陽輔、前田理、武次徹也
    • Organizer
      第9回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都・目黒区)
    • Year and Date
      2015-09-16
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 速度論に基づく複雑反応経路網の解析と自動探索との連携2015

    • Author(s)
      住谷陽輔、前田理、武次徹也
    • Organizer
      化学反応経路探索のニューフロンティア2015
    • Place of Presentation
      品川区立総合区民会館きゅりあん(東京都・品川区)
    • Year and Date
      2015-09-15
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] Kinetic analysis of the reaction path network for C6H62015

    • Author(s)
      住谷陽輔、前田理、武次徹也
    • Organizer
      31th Symposium on Chemical Kinetics and Dynamics
    • Place of Presentation
      北海道大学工学部フロンティア応用化学研究棟(北海道・札幌市)
    • Year and Date
      2015-06-03
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 速度論に基づく複雑反応経路網の解析: 異性化反応への応用2015

    • Author(s)
      住谷陽輔、前田理、武次徹也
    • Organizer
      第18回理論化学討論会
    • Place of Presentation
      大阪大学会館(大阪府・豊中市)
    • Year and Date
      2015-05-20
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      https://ambitious-lp.sci.hokudai.ac.jp/report/event/qualifying-examination/repo_6280.html

    • Related Report
      2016 Annual Research Report

URL: 

Published: 2015-11-26   Modified: 2024-03-26  

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