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クロマチンループによる形態形成遺伝子の発現制御メカニズム

Research Project

Project/Area Number 15J06985
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Developmental biology
Research InstitutionNational Institute of Genetics

Principal Investigator

毛利 亘輔  国立遺伝学研究所, 系統生物研究センター, 特別研究員(PD) (60719491)

Project Period (FY) 2015-04-24 – 2018-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2017)
Budget Amount *help
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2017: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2016: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2015: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords構造多型 / マウス / エンハンサー / クロマチンループ / ESCO2 / コヒーシン
Outline of Annual Research Achievements

昨年度から解析を行っていたHammer toe (Hm)マウスについて、ゲノム編集と遺伝子発現解析を組み合わせることで、新規エンハンサーが発生関連遺伝子の発現を誘導するためのゲノム構造が明らかになった。1つのエンハンサー配列ではなく複数のエンハンサーが協調的に働くことと、その並び方あるいは方向が発現量に影響することが明らかになった。これらの分子生物学的試薬について、試薬を購入した。
また、特別研究員として3年間取り組んだ成果を論文として発表するに至った。その際のレビュワーとのやりとりにおいて要求された確認実験のために試薬を購入し、使用している。掲載誌はProceedings of the National Academy of Sciences of the United States of Americaで、本年度12月にオンライン上に、1月に誌面に掲載された。
昨年度から準備していたESCO2を試薬誘導的にノックアウトする系統については、qPCR解析による発現解析を行い、ESCO2遺伝子の欠失に伴う発生関連遺伝子群の発現変動を調べた。Creタンパク質を核内に局在させるためのTamoxifenは母体腹腔内にE12.5で投与し、24時間後のE13.5で解剖、前肢および後肢での発現を定量した。Hoxd10およびHoxd13が微増していたものの、ESCO2の有意な発現低下は認められず、四肢の形態にも明白な変化は見られなかった。ESCO2の発現低下についてはNonsense Mediated Decayが起きていない可能性も依然としてあり、断定はできない。一方、ゲノムPCRでは欠失アリルが検出されている。

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2017 Annual Research Report
  • 2016 Annual Research Report
  • 2015 Annual Research Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2017 2016 2015

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results)

  • [Journal Article] Enhancer adoption caused by genomic insertion elicits interdigitalShhexpression and syndactyly in mouse2017

    • Author(s)
      Mouri Kousuke、Sagai Tomoko、Maeno Akiteru、Amano Takanori、Toyoda Atsushi、Shiroishi Toshihiko
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 115 Issue: 5 Pages: 1021-1026

    • DOI

      10.1073/pnas.1713339115

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] A new cis-regulatory element acquired by inter-chromosomal translocation changes of mouse limb morphology2017

    • Author(s)
      Kousuke Mouri
    • Organizer
      50th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Orientation-dependent enhancer evoked by chromosomal translocation in mouse Hm2017

    • Author(s)
      Kousuke Mouri
    • Organizer
      18th International Congress of Developmental Biology
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] エンハサーの転座による遺伝子発現調節変化2016

    • Author(s)
      毛利亘輔
    • Organizer
      第88回日本遺伝学会
    • Place of Presentation
      三島市
    • Year and Date
      2016-09-07
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Genetic analysis of mouse Hammer toe (Hm) mutant reveals long-range enhancer modulation2015

    • Author(s)
      毛利亘輔
    • Organizer
      第29回 モロシヌス研究会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2015-07-03
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] Genetic analysis of mouse Hammer toe (Hm) mutant reveals long-range enhancer modulation2015

    • Author(s)
      毛利亘輔
    • Organizer
      第48回 日本発生生物学会
    • Place of Presentation
      つくば
    • Year and Date
      2015-06-02
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2015-11-26   Modified: 2024-03-26  

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