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オーキシンにより制御されるクロマチン構造ダイナミクスの解析

Research Project

Project/Area Number 15J07264
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Morphology/Structure
Research InstitutionTokyo University of Science

Principal Investigator

長谷川 淳子  東京理科大学, 理工学研究科, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2015-04-24 – 2017-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2016)
Budget Amount *help
¥200,000 (Direct Cost: ¥200,000)
Fiscal Year 2016: ¥100,000 (Direct Cost: ¥100,000)
Fiscal Year 2015: ¥100,000 (Direct Cost: ¥100,000)
Keywordsオーキシン応答 / ヒストンシャペロン / ヒストンバリアント / クロマチン構造 / オーキシン
Outline of Annual Research Achievements

これまでの研究結果に基づき、平成28年度は
1.オーキシン応答阻害によってクロマチン構造が弛緩する。
2.オーキシン応答阻害によってクロマチン構造制御因子の発現量が変化する。
の2点について詳細な解析を行なった。1.前年度までにタバコBY-2培養細胞を用いた実験系によってオーキシン飢餓培養条件ではクロマチン構造が弛緩することを明らかにしていたが、オーキシン応答の変化によってクロマチン構造が変化するかは実験的に明らかにできていなかった。そこで、シロイヌナズナ培養細胞であるMM2dにオーキシン応答阻害剤PEO-IAAを処理し、クロマチン構造が変化するかどうかを検証した。DNA損傷量を測定するコメットアッセイ及びMNaseに対する感受性を調べるMNaseアッセイを用いて、クロマチン構造の変化を確認したところ、いずれの実験においてもオーキシン応答阻害によってクロマチン構造が弛緩することが明らかになった。
2.オーキシン応答によってヒストンシャペロンであるFAS1の発現が制御されていたことから、他のクロマチン構造制御因子もオーキシン応答によって発現を制御されていると考えた。この仮説を検証するためにシロイヌナズナ培養細胞MM2dに対しオーキシン応答阻害剤であるPEO-IAA、または対照区としてDMSOを処理し、サンプリングを行った。これらのサンプルからRNAを抽出し、RNAシークエンスを実施した。PEO-IAA処理後6時間で発現が下がった遺伝子群に対してジーンオントロジー解析を行なった結果、「Nucleosome assembly」に含まれる遺伝子が多く含まれることがわかった。遺伝子発現が低下した遺伝子群の中にどのようなクロマチン構造制御因子があるかを確認したところ、FAS1だけではなく他のヒストンシャペロンやヒストンバリアント遺伝子が含まれていた。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2016 Annual Research Report
  • 2015 Annual Research Report
  • Research Products

    (16 results)

All 2017 2016 2015 Other

All Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] RAD54 forms DNA repair foci in response to DNA damage in living plant cells.2017

    • Author(s)
      Hirakwa, T., Hasegawa, J., White, C and Matsunaga, S.
    • Journal Title

      PLANT JOURNAL

      Volume: 90 Issue: 2 Pages: 372-382

    • DOI

      10.1111/tpj.13499

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] 植物の内部を切片化せずに観察2016

    • Author(s)
      長谷川淳子、松永幸大
    • Journal Title

      B&I バイオサイエンスとインダストリー

      Volume: 74-5 Pages: 378-379

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] 短時間で植物組織の内部を観察する手法TOMEI2016

    • Author(s)
      長谷川淳子、松永幸大
    • Journal Title

      B&I バイオサイエンスとインダストリー

      Volume: 74-5 Pages: 406-408

    • NAID

      40020960224

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Three-dimensional imaging of plant organs using a simple and rapid transparency technique.2016

    • Author(s)
      Hasegawa J, Sakamoto Y, Nakagami S, Aida M, Sawa S, Matsunaga S
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol

      Volume: 57 Issue: 3 Pages: 462-472

    • DOI

      10.1093/pcp/pcw027

    • NAID

      120005756556

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The coordination of ploidy and cell size differs between cell layers in leaves.2016

    • Author(s)
      Katagiri, Y., Hasegawa, J., Fujikura, U., Hoshino R., Matsunaga, S. and Tsukaya, H.
    • Journal Title

      DEVELOPMENT

      Volume: 143 Pages: 1120-1125

    • DOI

      10.1242/dev.130021

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Chromatin structure changes in response to auxin signaling.2017

    • Author(s)
      Junko Hasegawa, Takuya Sakamoto, Sachihiro Matsunaga
    • Organizer
      第58回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      鹿児島大学郡元キャンパス(鹿児島県・鹿児島市)
    • Year and Date
      2017-03-16
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Chromatin compaction is regulated by plant hormone signaling.2016

    • Author(s)
      Junko Hasegawa, Takuya Sakamoto, Sachihiro Matsunaga
    • Organizer
      PLANT GENOME STABILITY AND CHANGE 2016
    • Place of Presentation
      湘南国際村センター(神奈川県・逗子市)
    • Year and Date
      2016-07-07
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] TOMEI is the rapid 3D imaging technique for whole plant tissues2016

    • Author(s)
      長谷川淳子,坂本勇貴,中上知,相田光宏,澤進一郎,松永幸大
    • Organizer
      第57回日本物生理学会年会
    • Place of Presentation
      岩手大学(岩手県)
    • Year and Date
      2016-03-18
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 植物における深部イメージング観察障害排除プロトコールの確立を目指して2015

    • Author(s)
      長谷川淳子、坂本勇貴、中上知、勝山雄喜、澤進一郎、松永幸大
    • Organizer
      、第1回イメージングフロンティアセンターシンポジウム
    • Place of Presentation
      東京理科大学野田キャンパス(千葉県)
    • Year and Date
      2015-12-25
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 植物における透明化と深部イメージングへの挑戦2015

    • Author(s)
      長谷川淳子、坂本勇貴、中上知、勝山雄喜、澤進一郎、松永幸大
    • Organizer
      第24回日本バイオイメージング学会
    • Place of Presentation
      東京理科大学葛飾キャンパス(東京都)
    • Year and Date
      2015-09-26
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 新規深部イメージング手法"TOMEI"の確立と解析2015

    • Author(s)
      長谷川淳子, 中上知, 坂本勇貴, 澤進一郎, 松永幸大
    • Organizer
      日本植物学会第79回大会
    • Place of Presentation
      朱鷺メッセ(新潟県)
    • Year and Date
      2015-09-06
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 深部イメージング手法"TOMEI"による観察と解析2015

    • Author(s)
      長谷川淳子,坂本勇貴,中上知,澤進一郎,松永幸大
    • Organizer
      日本植物形態学会第27回大会
    • Place of Presentation
      朱鷺メッセ(新潟県)
    • Year and Date
      2015-09-05
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] “TOMEI”, a simple and quick clearing method for plant tissues2015

    • Author(s)
      ○Junko Hasegawa, Yuki Sakamoto, Yuna Nakagawa, Satoru Nakagami, Yuki Katsuyama, Shinichiro Sawa, Sachihiro Matsunaga
    • Organizer
      International ERATO Higashiyama Live-Holonics Symposium and Technical Workshop 2015"Organogenesis from Eggs to Mature Plants"
    • Place of Presentation
      名古屋大学東山キャンパス(愛知県)
    • Year and Date
      2015-08-27
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 深部イメージング手法を用いた葉のDNA量と細胞体積の相関解析2015

    • Author(s)
      長谷川淳子、松永幸大
    • Organizer
      2015年度細胞周期セミナー
    • Place of Presentation
      サンヒルズ三河湾(愛知県)
    • Year and Date
      2015-06-12
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Remarks] 透明作物を短時間で作製する手法“TOMEI”の開発

    • URL

      http://www.jst.go.jp/pr/announce/20160229/

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Remarks] 細胞と葉の大きさを決める隠されたしくみ

    • URL

      http://www.tus.ac.jp/today/20160406_001.pdf

    • Related Report
      2015 Annual Research Report

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Published: 2015-11-26   Modified: 2024-03-26  

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