• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

遺伝子多様度解析を用いたアントクメ個体群消滅危険性の予測

Research Project

Project/Area Number 15J11734
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Aquatic bioproduction science
Research InstitutionTokyo University of Marine Science and Technology

Principal Investigator

秋田 晋吾  東京海洋大学, 海洋科学技術研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2015-04-24 – 2018-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2017)
Budget Amount *help
¥2,500,000 (Direct Cost: ¥2,500,000)
Fiscal Year 2017: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2016: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2015: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Keywords磯焼け / 藻場 / マイクロサテライト / 遺伝子多様度 / アントクメ / nad3-16s / 生物系統地理 / カジメ類の雑種
Outline of Annual Research Achievements

本課題では,遺伝子多様度の高い個体群が環境変異や物理的撹乱に強いことに着目し,海藻類の個体群である藻場における遺伝子多様度を解明することで,磯焼けの発生リスクが高い個体群を検出できるか調べた。平成29年度は,平成27年度に採集した個体と平成28年度に開発したマイクロサテライトマーカーを用いて,1)集団遺伝解析および2)遺伝子多様度解析を行った。
1)集団遺伝解析
平成28年度に実施した系統地理解析の結果を検証するために,11個のマイクロサテライトマーカーを用いて集団遺伝解析を行った。その結果,アントクメの遺伝集団は九州西岸と太平洋岸の2グループ,もしくは,伊豆大島,平沢,仁科,早田浦,土佐清水,串木野,長島,野母崎,新三重および原島と嫦娥崎の10グループに分かれると推定された。この結果は前年度に実施した系統地理解析を支持し,各地の個体群は遺伝的に大きく離れており,本種の分散能力は低いことが示唆された。
2)遺伝子多様度解析
各地の個体群において,検出されたアレルの数(Na: 最小の個体群に補正),ヘテロ接合度の観察値(Ho)と期待値(He),近交係数(Fis)およびアレル共有度(Psaxy)を求めた。これらの指数のうち近交係数(Fis)は,嫦娥崎,原島,新三重,野母崎,串木野,土佐清水および仁科で低く,長島,早田浦,伊豆大島および平沢で高いことが確認された。各地の生育状況から,アントクメの個体群は,拡大(嫦娥崎,原島),安定(長島,早田浦,伊豆大島および平沢)および縮小(新三重,野母崎)の3段階に分けられ,Fisと比較すると,大きな変動を示す個体群でFisが低く,Fisは個体群の現状を示す指標となり得ることが示された。

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2017 Annual Research Report
  • 2016 Annual Research Report
  • 2015 Annual Research Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2018 2017 2016 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Development of 11 Ecklonia radicosa (Phaeophyceae, Laminariales) SSRs markers using next-generation sequencing and intra-genus amplification analysis2018

    • Author(s)
      Akita Shingo、Koiwai Keiichiro、Hanyuda Takeaki、Kato Syou、Nozaki Reiko、Uchino Tsubasa、Sakamoto Takashi、Kondo Hidehiro、Hirono Ikuo、Fujita Daisuke
    • Journal Title

      Journal of Applied Phycology

      Volume: in press Issue: 3 Pages: 2111-2115

    • DOI

      10.1007/s10811-018-1406-5

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 遺伝子多様度解析を用いたアントクメ個体群の消長予測2018

    • Author(s)
      秋田晋吾・小祝敬一郎・近藤秀裕・廣野育生・坂本崇・藤田大介
    • Organizer
      日本藻類学会第42回大会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] Phylogeographical study revealed instability of annual kelp Ecklonia radicosa population2017

    • Author(s)
      Shingo Akita, Keiichiro Koiwai, Keigo Kobayashi, Hidehiro Kondo, Ikuo Hirono, Daisuke Fujita
    • Organizer
      22 nd International Seaweed Symposium
    • Place of Presentation
      Copenhargen Denmark
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] アントクメの系統地理学的解析2017

    • Author(s)
      秋田晋吾・小祝敬一郎・羽生田岳昭・近藤秀裕・廣野育生・藤田大介
    • Organizer
      日本藻類学会第41回大会
    • Place of Presentation
      高知
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] 長﨑県壱岐沿岸で採集されたカジメ類の交雑体における分子同定の試み2016

    • Author(s)
      秋田晋吾・小祝敬一郎・清本節夫・吉村拓・近藤秀裕・廣野育生・藤田大介
    • Organizer
      日本藻類学会40回大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-03-20
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Remarks] Researchmap

    • URL

      https://researchmap.jp/akita4567/

    • Related Report
      2017 Annual Research Report

URL: 

Published: 2015-11-26   Modified: 2024-03-26  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi