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抗HIVタンパク質 APOBEC3F の構造および機能解析

Research Project

Project/Area Number 15J12567
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Structural biochemistry
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

中島 雅晶  名古屋大学, 工学研究科, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2015-04-24 – 2017-03-31
Project Status Declined (Fiscal Year 2016)
Budget Amount *help
¥1,700,000 (Direct Cost: ¥1,700,000)
Fiscal Year 2016: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2015: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
KeywordsHIV / APOBEC3 / APOBEC3F / Vif
Outline of Annual Research Achievements

APOBEC3 ファミリータンパク質は,HIV-1 を含むレトロウイルスやレトロトランスポゾンなどの増殖を抑制するヒトの抗ウイルスタンパク質である.HIV-1 は感染細胞内で Vif を発現し,ユビキチン・プロテアソーム系を介したAPOBEC3 の分解を促進することで,APOBEC3 の抗ウイルス活性を中和する.本研究課題では7種類の APOBEC3 ファミリータンパク質の中でも,高い抗 HIV 活性を有する APOBEC3F に注目し,APOBEC3F と Vif の相互作用に関する構造学的・生化学的な解析を実施した.

今年度は研究計画に基づきAPOBEC3F の変異体を用いた APOBEC3F と Vif の結合に関する生化学的な解析を行い,両者の結合に関与する13 のアミノ酸残基を同定した.本解析から同定されたアミノ酸残基を,申請者らによって決定された APOBEC3FのC末端ドメインの結晶構造にマッピングし,APOBEC3FのVif 結合インターフェイスの詳細な構造学的特徴(APOBEC3F の Vif 結合インターフェイスはαヘリックス2と3, 4 に亘って展開されていること,主に負電荷を帯びていること)を明らかとした.また,Vif についても変異体解析を行い,Vif の結晶構造(Guo et al., Nature, 2014)上に重要なアミノ酸をマッピングしたところ,Vif の APOBEC3F 結合インターフェイスの表面積や表面電荷等の構造学的特徴が相補的であることがわかった.本研究課題で明らかとなった上記のAPOBEC3F とVif の結合に関する構造情報は,両者の相互作用を標的とした抗 HIV 薬開発における重要な基盤情報となると考えられる.これら研究成果はJ. Virology, 90(2), 1034-1047 (2016) に掲載された.

Research Progress Status

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

Report

(1 results)
  • 2015 Annual Research Report
  • Research Products

    (3 results)

All 2016 2015

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] Structural Insights into HIV-1 Vif-APOBEC3F Interaction2016

    • Author(s)
      Nakashima M, Ode H, Kawamura T, Kitamura S, Naganawa Y, Awazu H, Tsuzuki S, Matsuoka K, Nemoto M, Hachiya A, Sugiura W, Yokomaku Y, Watanabe N, Iwatani Y
    • Journal Title

      Journal of Virology

      Volume: 90 Issue: 2 Pages: 1034-1047

    • DOI

      10.1128/jvi.02369-15

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Unique Flap Conformation in an HIV-1 Protease with High-Level Darunavir Resistance2016

    • Author(s)
      Nakashima M, Ode H, Suzuki K, Fujino M, Maejima M, Kimura Y, Masaoka T, Hattori J, Matsuda M, Hachiya A, Yokomaku Y, Suzuki A, Watanabe N, Sugiura W, Iwatani Y
    • Journal Title

      Frontiers in Microbiology

      Volume: 7 Pages: 61-61

    • DOI

      10.3389/fmicb.2016.00061

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Comparative analysis of the antiviral APOBEC3C enzymes in primates: implication for degeneration of their catalytic activities2015

    • Author(s)
      Masaaki Nakashima,Hirotaka Ode,Shinya Tsuzuki,Hiroaki Awazu,Kenta Matsuda,Kei Sato,Atsuko Hachiya,Yoshiyuki Yokomaku,Nobuhisa Watanabe,Yasumasa Iwatani
    • Organizer
      第63回日本ウイルス学会学術集会
    • Place of Presentation
      博多
    • Year and Date
      2015-11-22
    • Related Report
      2015 Annual Research Report

URL: 

Published: 2015-11-26   Modified: 2024-03-26  

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