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Development of methods for making glycan atlas, and data collection for database publishing

Research Project

Project/Area Number 15K06991
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Research Field Functional biochemistry
Research InstitutionNiigata University

Principal Investigator

Natsuka Shunji  新潟大学, 自然科学系, 教授 (00243163)

Co-Investigator(Renkei-kenkyūsha) SUZUKI Noriko  新潟大学, 自然科学系, 助教 (50401237)
Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2017)
Budget Amount *help
¥5,200,000 (Direct Cost: ¥4,000,000、Indirect Cost: ¥1,200,000)
Fiscal Year 2017: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2016: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2015: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
Keywords糖鎖 / グライコーム / 網羅的解析 / データベース
Outline of Final Research Achievements

A preparing method for glycan atlas, which is a comprehensive database of glycan structure and expression level, was adapted to glycan molecules of various forms. Using this method, we succeeded in comprehensively analyzing the changes in glycan structure during the embryonic development of zebrafish, and some of these results have been published. On the other hand, we also succeeded to accumulate data on structure and expression level by analyzing glycan structure of glycoproteins and animal tissues and published on internet as 2 dimensional glycan maps. This study overcame the technical problems for producing of mice and human glycan atlases.

Report

(4 results)
  • 2017 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2016 Research-status Report
  • 2015 Research-status Report
  • Research Products

    (18 results)

All 2017 2016 2015 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (16 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Structures and developmental alterations of N-glycans of zebrafish embryos2017

    • Author(s)
      Ken Hanzawa, Noriko Suzuki, Shunji Natsuka
    • Journal Title

      Glycobiology

      Volume: 27 Pages: 228-245

    • DOI

      10.1093/glycob/cww124

    • Related Report
      2016 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 希少糖6-デオキシアルトロースを含むN-結合型糖鎖の発見2017

    • Author(s)
      長束俊治、半澤健、田幸正邦、石田秀治
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      京都女子大学(京都府京都市)
    • Year and Date
      2017-03-18
    • Related Report
      2016 Research-status Report
  • [Presentation] ゼブラフィッシュ卵黄の糖タンパク質糖鎖解析2017

    • Author(s)
      飯塚紀公、長束俊治
    • Organizer
      東北糖鎖研究会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] 糖鎖生合成阻害剤キフネンシンによる脊椎動物胚の形態形成異常2017

    • Author(s)
      沢空樹、長束俊治
    • Organizer
      東北糖鎖研究会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] 6-デオキシアルトロースを含むゼブラフィッシュ胚の分泌糖ペプチド2017

    • Author(s)
      長束 俊治、半澤 健
    • Organizer
      東北糖鎖研究会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] 希少糖6-デオキシアルトロースを末端に持つN-結合型糖鎖の発見と解析2017

    • Author(s)
      長束俊治、半澤健、田幸正邦、石田秀治
    • Organizer
      日本応用糖質科学会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] ゼブラフィッシュ胚発生における糖タンパク質糖鎖構造の変遷2017

    • Author(s)
      長束俊治、半澤健、飯塚紀公
    • Organizer
      日本糖質学会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] ゼブラフィッシュの卵黄由来糖鎖の解析2017

    • Author(s)
      飯塚紀公、長束俊治
    • Organizer
      新潟生化学懇話会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] ゼブラフィッシュ胚の糖鎖について2017

    • Author(s)
      長束俊治、半澤健
    • Organizer
      比較グライコーム研究会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] ゼブラフィッシュの発生とN-結合型糖鎖2016

    • Author(s)
      長束俊治、半澤健、佐藤朋史
    • Organizer
      比較グライコーム研究会
    • Place of Presentation
      九州大学(福岡県福岡市)
    • Year and Date
      2016-06-11
    • Related Report
      2016 Research-status Report
  • [Presentation] 脊椎動物に特徴的な2型ラクトサミン構造に関する研究2015

    • Author(s)
      長束俊治
    • Organizer
      日本生化学会
    • Place of Presentation
      神戸国際展示場(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-02
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] ゼブラフィッシュ胚で発現するN-結合型糖鎖の解析2015

    • Author(s)
      半澤健、長束俊治
    • Organizer
      日本生化学会
    • Place of Presentation
      神戸国際展示場(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-02
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] ゼブラフィッシュ胚におけるゴルジα-マンノシダーゼIIの阻害が形態形成と糖鎖構造に与える影響の解析2015

    • Author(s)
      佐藤朋史、半澤健、長束俊治
    • Organizer
      日本生化学会
    • Place of Presentation
      神戸国際展示場(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-02
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] ゼブラフィッシュ胚N-結合型糖鎖の網羅的解析2015

    • Author(s)
      長束俊治
    • Organizer
      東北糖鎖研究会
    • Place of Presentation
      東北薬科大学(宮城県仙台市)
    • Year and Date
      2015-09-04
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] ゼブラフィッシュ胚発生におけるN-結合型糖鎖の変化の解析2015

    • Author(s)
      半澤健、佐藤朋史、長束俊治
    • Organizer
      日本糖質学会
    • Place of Presentation
      東京大学本郷キャンパス(東京都文京区)
    • Year and Date
      2015-07-31
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] グライコミックツールとしての細菌由来α-マンノシダーゼの組換え体調製と基質特異性の解析2015

    • Author(s)
      江間一旭、半澤健、橋本渉、村田幸作、長束俊治
    • Organizer
      日本糖質学会
    • Place of Presentation
      東京大学本郷キャンパス(東京都文京区)
    • Year and Date
      2015-07-31
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] ゼブラフィッシュ胚のN-結合型糖鎖について2015

    • Author(s)
      長束俊治、半澤健、佐藤朋史
    • Organizer
      比較グライコーム研究会
    • Place of Presentation
      九州大学(福岡県福岡市)
    • Year and Date
      2015-06-06
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Remarks] 長束・鈴木研究室、実験法

    • URL

      http://www.sc.niigata-u.ac.jp/biologyindex/natsuka/methods.html

    • Related Report
      2016 Research-status Report

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Published: 2015-04-16   Modified: 2019-03-29  

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