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Basic research for the application of bacterial polyheadral organelle for bio-nano-reactor

Research Project

Project/Area Number 15K14237
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Allocation TypeMulti-year Fund
Research Field Biofunction/Bioprocess
Research InstitutionOkayama University

Principal Investigator

Tobimatsu Takamasa  岡山大学, ヘルスシステム統合科学研究科, 准教授 (30188768)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 森 光一  岡山大学, ヘルスシステム統合科学研究科, 助教 (50379715)
Project Period (FY) 2015-04-01 – 2019-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2018)
Budget Amount *help
¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2017: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2016: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2015: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Keywordspduオルガネラ / 多面体オルガネラ / ナノバイオ / バイオリアクター / ジオールデヒドラターゼ / プロパンジオール資化
Outline of Final Research Achievements

Considerable number of bacteria have proteinaceous polyhedral organelle in which metabolic reactions are carried out minimize the loss of volatile metabolic intermediates. In this study, we have searched for the interaction regions between enzymes of the pdu organelle. Short N-terminal regions of medium and small subunit of diol dehydratase and PduP aldehyde dehydrogenase is shown to be required for the interaction between organelle enzymes.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

細菌の多面体構造体の中に酵素群を詰め込めばナノスケールのバイオリアクターとして用いられると期待されている。そのためには詰め込みシグナルの同定が必要であるが、これまでの研究ではオルガネラの殻タンパク質と相互作用する2つの領域がシグナルとして同定されているだけであった。本研究は殻内部のオルガネラ酵素間の相互作用に関わるペプチド領域を明らかにしたものである。これらのペプチドや、同等の機能を持つペプチドを用いれば、様々な酵素類をオルガネラに組み込むことが可能になると考えられることより、本研究はバイオナノリアクターの実現に大いに寄与するものであると考えられる。

Report

(5 results)
  • 2018 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2017 Research-status Report
  • 2016 Research-status Report
  • 2015 Research-status Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2018 2017 2016 2015

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (7 results)

  • [Journal Article] Site-Specific Integration by Recruitment of a Complex of ΦC31 Integrase and Donor DNA to a Target Site by Using a Tandem, Artificial Zinc-Finger Protein.2018

    • Author(s)
      Sumikawa T, Ohno S, Watanabe T, Yamamoto R, Yamano M, Mori T, Mori K, Tobimatsu T, Sera T
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 57 Issue: 50 Pages: 6868-6877

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.8b00979

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cleavage of influenza RNA by using a human PUF-based artificial RNA-binding protein-staphylococcal nuclease hybrid.2016

    • Author(s)
      Mori T, Nakamura K, Masaoka K, Fujita Y, Morisada R, Mori K, Tobimatsu T, Sera T.
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun.

      Volume: 479 Issue: 4 Pages: 736-740

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2016.09.142

    • Related Report
      2016 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Diol Dehydratase-Reactivase Is Essential for Recycling of Coenzyme B12 in Diol Dehydratase.2016

    • Author(s)
      Toraya T, Tanokuchi A, Yamasaki A, Nakamura T, Ogura K, Tobimatsu T.
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 55 Issue: 1 Pages: 69-78

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.5b01023

    • Related Report
      2015 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 補酵素B12関与ジオールデヒドラターゼβサブユニットN末の低溶性化領域の解析2018

    • Author(s)
      飛松 孝正、池田 渓太、森 光一、世良 貴志
    • Organizer
      第451回ビタミンB研究協議会
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] 補酵素B12関与diol dehydrataseβおよびγサブユニットのN末領域による低溶解性化能の解析2017

    • Author(s)
      池田渓太、平田佳久、森光一、世良貴史、虎谷哲夫、飛松孝正
    • Organizer
      ConBio2017
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] 補酵素B12関与ジオールデヒドラターゼの低溶解性化決定部位を用いたタンパク質精製法:単量体酵素への拡張2016

    • Author(s)
      飛松孝正、北川優輔、森光一、世良貴史
    • Organizer
      第446回ビタミンB研究協議会
    • Place of Presentation
      岐阜市
    • Year and Date
      2016-11-05
    • Related Report
      2016 Research-status Report
  • [Presentation] pduオルガネラ酵素の、補酵素B12関与ジオールデヒドラターゼとの相互作用の解析2016

    • Author(s)
      飛松 孝正、河本 聖也、池田 祐輝、大月 恵太、角田 尚幸、森 光一、世良 貴志
    • Organizer
      ビタミンB研究協議会
    • Place of Presentation
      京都市
    • Year and Date
      2016-01-30
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] Klebsiella oxytoca pdu オペロンを発 現させた大腸菌組換え体の機能解析2015

    • Author(s)
      斉藤拓也、荒木優貴乃、柴田千 尋、世良貴史、森光一、虎谷哲 夫、飛松孝正
    • Organizer
      BMB2015
    • Place of Presentation
      神戸市
    • Year and Date
      2015-12-01
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] カラム不要でシンプルな活性のあるタンパ ク質の究極の精製法:単量体酵素への拡張2015

    • Author(s)
      北川優輔、世良貴史、森光一、飛 松孝正
    • Organizer
      BMB2015
    • Place of Presentation
      神戸市
    • Year and Date
      2015-12-01
    • Related Report
      2015 Research-status Report
  • [Presentation] 根粒菌由来B12 補酵素関与新奇デヒドラ ターゼの酵素機能の解明2015

    • Author(s)
      仙波和崇、杉原岳志、世良貴史、 飛松孝正、森光一
    • Organizer
      BMB2015
    • Place of Presentation
      神戸市
    • Year and Date
      2015-12-01
    • Related Report
      2015 Research-status Report

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Published: 2015-04-16   Modified: 2020-03-30  

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