Oscillation of transcription during development

• Project/Area Number: 15K18543
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Research Field: Developmental biology
• Research Institution: Toho University
• Principal Investigator: MURAMOTO Tetsuya 東邦大学, 理学部, 講師 (10612575)
• Project Period (FY): 2015-04-01 – 2017-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2016)
• Budget Amount: ¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000); Fiscal Year 2016: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000); Fiscal Year 2015: ¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
• Keywords: 遺伝子発現制御 / 転写 / 細胞分化 / 周期的発現 / ライブイメージング / 発生・分化 / 遺伝子発現調節 / ライブセルイメージング / 遺伝子発現動態

Outline of Final Research Achievements

Transcriptome analysis was performed to identify genes expressing periodically and synchronously in the cell population during development. Cell lines to visualize transcriptional dynamics were generated for 22 candidate genes showing the oscillatory pattern. Live-cell analysis revealed one of the genes displayed oscillatory pattern during early development.

Research Products

• [Presentation] 周期的な局在変化を示す転写因子の細胞内動態解析 (2016)
  • Author(s): 岡野由里、船江聡子、村本哲哉
  • Organizer: 第39回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜(神奈川県・横浜市）
  • Year and Date: 2016-12-01
• [Presentation] 発生分化における短周期発現振動を示す遺伝子群の同定とその解析 (2016)
  • Author(s): 菊地亜紀、清水祐季、村本哲哉
  • Organizer: 第39回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜(神奈川県・横浜市）
  • Year and Date: 2016-12-01
• [Presentation] 細胞性粘菌での CRISPR/Cas システムの利用 (2016)
  • Author(s): 関根僚也、村本哲哉
  • Organizer: 第6回日本細胞性粘菌学会例会
  • Place of Presentation: 上智大学（東京都・千代田区）
  • Year and Date: 2016-10-15
• [Presentation] 転写因子の細胞内動態解析による多細胞体構築機構の解明 (2016)
  • Author(s): 岡野由里、船江聡子、川田健文、村本哲哉
  • Organizer: 第6回日本細胞性粘菌学会例会
  • Place of Presentation: 上智大学（東京都・千代田区）
  • Year and Date: 2016-10-15
• [Presentation] 転写ダイナミックスの世代を超えた継承の解明 (2016)
  • Author(s): 菊地亜紀、村本哲哉
  • Organizer: 第6回日本細胞性粘菌学会例会
  • Place of Presentation: 上智大学（東京都・千代田区）
  • Year and Date: 2016-10-15
• [Presentation] 発生分化における短周期発現振動を示す遺伝子の探索と解析 (2016)
  • Author(s): 清水祐季、菊地亜紀、平岡真奈、村本哲哉
  • Organizer: 第6回日本細胞性粘菌学会例会
  • Place of Presentation: 上智大学（東京都・千代田区）
  • Year and Date: 2016-10-15
• [Presentation] 細胞性粘菌 lncRNA の動態解析 (2016)
  • Author(s): 嵯峨幸夏、橘高昂平、田向沙樹、栗原直也、島田奈央、村本哲哉、川田健文
  • Organizer: RNAフロンティアミーティング
  • Place of Presentation: いこいの湯宿 いろは（北海道・ニセコ町）
  • Year and Date: 2016-08-31
• [Presentation] 遺伝子発現動態のイメージング解析 (2015)
  • Author(s): 村本哲哉
  • Organizer: 第5回日本細胞性粘菌学会例会
  • Place of Presentation: 弘前大学（青森県弘前市）
  • Year and Date: 2015-10-10
  • Invited
• [Presentation] 発生分化における周期的転写活性化とそのゲノム動態 (2015)
  • Author(s): 関根僚也、菊地亜紀、村本哲哉
  • Organizer: 第5回日本細胞性粘菌学会例会
  • Place of Presentation: 弘前大学（青森県弘前市）
  • Year and Date: 2015-10-10
• [Presentation] 発生分化過程でみられる転写の振動現象のイメージング解析 (2015)
  • Author(s): 村本哲哉
  • Organizer: 第37回つくば藻類・プロティストフォーラム
  • Place of Presentation: 筑波大学（茨城県つくば市）
  • Year and Date: 2015-06-22
  • Invited
• [Presentation] Nucleocytoplasmic shuttling of a GATA transcription factor functions as a development timer (2015)
  • Author(s): Muramoto, T., and Ueda, M.
  • Organizer: The 48th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists
  • Place of Presentation: つくば国際会議場（茨城県つくば市）
  • Year and Date: 2015-06-03