Molecular analysis of oral flora in patients aspiration pneumonia using next generation sequencer

• Project/Area Number: 15K20542
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Research Field: Surgical dentistry
• Research Institution: Wakayama Medical University
• Principal Investigator: Shinsuke Ieda 和歌山県立医科大学, 医学部, 博士研究員 (10739684)
• Project Period (FY): 2015-04-01 – 2019-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2018)
• Budget Amount: ¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000); Fiscal Year 2017: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000); Fiscal Year 2016: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000); Fiscal Year 2015: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
• Keywords: 次世代シーケンサー / 真菌叢 / 細菌叢

Outline of Final Research Achievements

I could not collect enough samples and analyze the association oral flora and aspiration pneumonia.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

検体数が十分に集めることができず、下記の調査ができなかった。
口腔細菌・真菌叢と全身疾患（糖尿病・誤嚥性肺炎・感染性心内膜炎などの循環器疾患・腎炎・早産や低体重児出産など）と関連が指摘されているが、原因となる菌や菌叢は明らかにされていない。これら疾患患者の口腔内・血液・気道分泌物内の口腔細菌・真菌叢について次世代シーケンサーで解析すれば診断時間が短縮され、遺伝子レベルで菌種を同定するため診断精度の向上に資すると考えた。