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急速凍結フリーズレプリカ法を駆使した細胞内蛋白質の構造ゲノミクス手法の開発と応用

Research Project

Project/Area Number 16011215
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

片山 栄作  東京大学, 医科学研究所, 教授 (50111505)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 伊東 祐二  鹿児島大学, 工学部, 助教授 (60223195)
Project Period (FY) 2004
Project Status Completed (Fiscal Year 2004)
Budget Amount *help
¥5,600,000 (Direct Cost: ¥5,600,000)
Fiscal Year 2004: ¥5,600,000 (Direct Cost: ¥5,600,000)
Keywords急速凍結電子顕微鏡法 / 3次元像再構成 / アクトミオシン / コンフォメーション変化 / 電子線トモグラフィ / 細胞内分子構築 / 細胞内分子標識 / 蛍光観察
Research Abstract

急速凍結ディープエッチ・レプリカ電子顕微鏡法を中心として、細胞内で機能遂行中の個々の蛋白質分子の3次元構造を一挙に捉え、その分子構造の変化を高精度で解析することを最終目標に据え、その基盤となる3種類の要素技術の開発を続けてきた。1)先ず、急速凍結レプリカ像から蛋白質1分子の3次元構造を再構成法する手法は概ね完成し、今年度はネガティブ染色試料やあるいは樹脂包埋切片など奥行きを持つ構造物のトモグラフィ手法の開発に着手した。新たな着想に基づき、電子線トモグラフィの最大の問題点である高さ方向の分解能劣化を最小限度に抑えて、アクトミオシンのネガティブ染色試料から一切の平均化なしでその3次元像を再構成することに成功した。また、高さ方向の分解能を更に向上させるための効果的な画像修復法を検討した。2)蛋白質表面の凹凸を反映すると推定されるレプリカ像の表面パターンを対象蛋白質の原子モデルからのシミュレーション像と定量的に比較する手法を開発した。それを用いて、機能中に急速凍結固定したアクト重メロミオシンの構造を解析した結果、滑り運動中のミオシン頭部ではこれまでに報告のない新たなコンフォメーションが実現していることが判明した。またクロスブリッジの構造変化の順序を合理的に推定することができた。3)細胞内に存在するさまざまの分子構築において、特定の分子やサブドメインの局在部位と向きをレプリカ試料の視野内で示し、さらには生きた細胞中におけるその分子の動態を蛍光顕微鏡で追うことを可能とする高性能の顕微鏡用標識の開発を進めてきた。上記のクロスブリッジの構造変化を直接の動画像として捉えるため、新たなデザインに基づくコンストラクトをミオシンに融合し、ミオシン頭部に目的とする標識を付加させることに成功した。さらに、生きた細胞内の受容体蛋白質など、より広範囲の分子構築にも同手法を適用すべく同様の試みを開始した。

Report

(1 results)
  • 2004 Annual Research Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2004 2001

All Journal Article (6 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Interaction of myosin/ADP/fluorometal complexes with fluorescent probes and direct observation using quick-freeze deep-etch electron microscopy.2004

    • Author(s)
      Maruta S., Katayama E.
    • Journal Title

      Journal of Biochemistry 136

      Pages: 57-64

    • NAID

      10016200785

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] αB-crystallin-coated MAPs-microtubule・resists nocodazole- and calcium-induced disassembly.2004

    • Author(s)
      Fujita Y., Katayama E.
    • Journal Title

      Journal of Cell Science 117

      Pages: 1719-1726

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Three dimensional morphometrical analyses of astrocytic processes with the high voltage electron microscopy of thick Golgi preparations.2004

    • Author(s)
      Hama K., Katayama E.
    • Journal Title

      Journal of Neurocytology 33

      Pages: 277-285

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] 急速凍結ディープエッチ・レプリカ法:その特長と最近の企てについて2004

    • Author(s)
      片山 栄作
    • Journal Title

      顕微鏡 39

      Pages: 133-136

    • NAID

      10013445089

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Molecular characterization of a 10-kDa buckwheat molecule reactive to allergic patients' IgE.2004

    • Author(s)
      Matsumoto R., Ito Y.
    • Journal Title

      Allergy 59

      Pages: 533-538

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] 単クローン抗体を利用した3次元分子設計法2004

    • Author(s)
      伊東祐二
    • Journal Title

      分子細胞治療 3(4)

      Pages: 459-464

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 立体構造検証支援装置、立体構造検証方法、記録媒体、及びプログラム2001

    • Inventor(s)
      片山 栄作, 馬場 則男
    • Industrial Property Rights Holder
      片山 栄作, 馬場 則男
    • Filing Date
      2001-12-10
    • Acquisition Date
      2004-11-26
    • Related Report
      2004 Annual Research Report

URL: 

Published: 2004-04-01   Modified: 2018-03-28  

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