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遺伝子ネットワーク解明に向けた高機能性人工デコイ核酸の開発

Research Project

Project/Area Number 16011235
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

今西 武  大阪大学, 大学院・薬学研究科, 教授 (40028866)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 土井 健史  大阪大学, 大学院・薬学研究科, 教授 (00211409)
Project Period (FY) 2004
Project Status Completed (Fiscal Year 2004)
Budget Amount *help
¥3,400,000 (Direct Cost: ¥3,400,000)
Fiscal Year 2004: ¥3,400,000 (Direct Cost: ¥3,400,000)
Keywords人工核酸 / デコイ法 / DNA / オリゴヌクレオチド / NF-KB / アポトーシス / 遺伝子発現制御
Research Abstract

1.人工デコイ核酸の設計と合成について
(1)2'4'-BNAに加えて、最近開発に成功した3'-amino-2'-deoxy-3',4'-BNAや2',4'-BNA^<coc>のデコイ核酸への導入を行なった。
(2)NF-kBに対する人工デコイ核酸の従来の標的配列に加え新たに種々のデコイ分子配列を設計し、その合成にあたった。(今西)
2.人工デコイ核酸の物性評価について
人工デコイ核酸の安定性をTm測定により、各種転写因子との結合親和性をゲルシフトアッセイ等により詳細に評価した。(今西、土井)
3.細胞系での人工デコイ核酸の機能評価について
(1)培養細胞に対し人工デコイ核酸を導入し、細胞内における各種遺伝子の発現の様子を、ディファレンシャルディスプレイ法、リアルタイムPCR法及び発現タンパク質に対する蛍光標識抗体を用い詳細に解析した。(土井)
(2)上記検討にて見い出した遺伝子群を対応するアンチセンス分子などにて発現抑制し、関連遺伝しの発現レベルを解析することで、遺伝子ネットワークの詳細を検討した。(土井)
(3)得られた結果をもとに遺伝子ネットワークのモデルを構築しその検証を行なった。(土井)

Report

(1 results)
  • 2004 Annual Research Report
  • Research Products

    (5 results)

All 2004 Other

All Journal Article (5 results)

  • [Journal Article] Synthesis and conformation of a novel bridged nucleic acid having a trans-fused 3,5,8-trioxabicyclo[5.3.0]decane structure2004

    • Author(s)
      S.Obika, T.Osaki, M.Sekiguchi, R.Somjing, Y.Harada, T.Imanishi
    • Journal Title

      Tetrahedron Letters 45,24

      Pages: 4801-4804

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] 2',4'-BNA derivatives bearing an unnatural nucleobase: Synthesis and application to triplex-forming oligonucleotides2004

    • Author(s)
      H.Inohara, S.Obika, T.Imanishi
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symposium Series 48

      Pages: 165-166

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Synergistic stabilization of triplex by combination of comb-type cationic copolymer and 2',4'-BNA2004

    • Author(s)
      T.Katayama, A.Maruyama, S.Obika, T.Imanishi, H.Torigoe
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symposium Series 48

      Pages: 165-166

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Synthesis and properties of a novel bridged nucleic acid analogue bearing a P3'->N5' phosphoramidate linkage, 5'-amino-3',5'-BNA2004

    • Author(s)
      M.Sekiguchi, S.Obika, R.Somjing, T.Imanishi
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symposium Series 48

      Pages: 7-8

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Adjustment of the γ dihedral angle of an oligonucleotide P3'->N5' phosphoramidate enhances its binding affinity towards complementary

    • Author(s)
      S.Obika, M.Sekiguchi, R.Somjing, T.Imanishi
    • Journal Title

      Angew.Chem., Int.Ed.Engl. (in press)

    • Related Report
      2004 Annual Research Report

URL: 

Published: 2004-04-01   Modified: 2018-03-28  

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