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シロイヌナズナのフェノーム解析と4000遺伝子についての破壊株の作製

Research Project

Project/Area Number 16011265
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

黒森 崇  独立行政法人理化学研究所, 植物変異開発研究チーム, 研究員 (80332295)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 和田 拓治  独立行政法人理化学研究所, 個体統合解析研究チーム, チームリーダー (50360673)
Project Period (FY) 2004
Project Status Completed (Fiscal Year 2004)
Budget Amount *help
¥6,000,000 (Direct Cost: ¥6,000,000)
Fiscal Year 2004: ¥6,000,000 (Direct Cost: ¥6,000,000)
Keywordsシロイヌナズナ / タグライン / フェノーム解析
Research Abstract

1.シロイヌナズナのトランスポゾン挿入変異体の育成と発芽率の測定
植物変異開発研究チームがこれまでに作製していたトランスポゾン挿入変異株の中で、遺伝子への挿入が予測されるラインを選別し、1,478ライン(合計4,768ライン)について種子50粒ずつをプレート培地に播種し、発芽率・初期育成率を測定した。これまでの結果を合計すると発芽率については、4,215ライン(88%)が80%以上の発芽率を示したのに対し、212ライン(4.4%)については発芽率70%未満であり、発芽に影響のある遺伝子変異体の候補と考えられた。育成率については110ライン(2.3%)が50%未満の育成率を示し、これらの変異体は致死表現型の候補と考えられた。
2.シロイヌナズナの形態観察による表現型データの記録
プレートで約3週間育成の後、各ライン8個体ずつを土に植え換え植物体を育て、形態に異常の観察されるラインについてデジタル画像によって記録を取った。これまでに行った植物体地上部の観察で比較的はっきりした表現型を示したのは265ライン(5.5%)だった。その中には、植物体の矮性・アルビノ形質・植物体の色が薄い・遅咲き・葉の形態異常・茎の形態異常・花の形態異常・さやの形態異常など様々な表現型が含まれていた。
3.シロイヌナズナの遺伝子破壊系統の選別と各種スクリーニング
上記表現型解析の過程で、647ライン(合計1,965ライン)はトランスポゾンがホモに挿入されており、遺伝子破壊株系統になっていると予測された。それらの植物個体から種子回収を行い、地上部観察では見ることのできなかった根・根毛・胚軸・トライコームの定量的表現型スクリーニングと、環境ストレス条件下での耐性変異体のスクリーニングを始めた。

Report

(1 results)
  • 2004 Annual Research Report
  • Research Products

    (5 results)

All 2005 2004 2003

All Journal Article (5 results)

  • [Journal Article] LARGE : a large-scale database of RIKEN Arabidopsis resources ranging from transcriptome to phenome.2005

    • Author(s)
      Sakurai T
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research 33

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] AtJPT3 is a key determinant of nitrate-dependent cytokinin biosynthesis in Arabidopsis.2004

    • Author(s)
      Takei K
    • Journal Title

      Plant and Cell physiology 45

      Pages: 1053-1062

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Quantitative trait loci analysis of nitrate storage in Arabidopsis leading to an investigation of the contribution of the anion channel gene, AtGLC-c, to variation2004

    • Author(s)
      Harada H
    • Journal Title

      Journal of Experimental Botany 55

      Pages: 2005-2014

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] The HALTED ROOT (HLR) gene encoding the 26S proteasome subunit RPT2a is essential for the maintenance of Arabidopsis meristems.2004

    • Author(s)
      Ueda M.
    • Journal Title

      Development 131

      Pages: 2101-2111

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] An Arabidopsis ACT2 dominant-negative mutation, which disturbs F-actin polymerization, reveals its distinctive function in root development.2003

    • Author(s)
      Nishimura T
    • Journal Title

      Plant and Cell physiology 44

      Pages: 1131-1140

    • Related Report
      2004 Annual Research Report

URL: 

Published: 2004-04-01   Modified: 2018-03-28  

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