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タンパク結合プロファイルに基づいた染色体代謝ネットワークの解析

Research Project

Project/Area Number 16013250
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

白髭 克彦  東京工業大学, バイオ研究基盤支援総合センター・遺伝子実験分野, 助教授 (90273854)

Project Period (FY) 2004
Project Status Completed (Fiscal Year 2004)
Budget Amount *help
¥7,000,000 (Direct Cost: ¥7,000,000)
Fiscal Year 2004: ¥7,000,000 (Direct Cost: ¥7,000,000)
KeywordsDNAチップ / 染色体動態 / ゲノム解析 / 動態シミュレーション
Research Abstract

出芽酵母、および、分裂酵母の全染色体についてもChIP-chip法により染色体上のタンパクの配置を解析可能なシステムを構築した。このシステムを用い、出芽酵母染色体上での姉妹染色体分体間接着タンパク、コヒーシンの配置メカニズムの解析と、DNA二本鎖切断時に於ける配置の変化を追跡した。まず、コヒーシンが転写と排他的に染色体上で棲み分けていることを明らかにした。さらに、DNA二本鎖切断時にはダイナミックにコヒーシンが切断部位へ移動して行くことを通じ、コヒーシン複合体のDNA修復への関与を明らかにした。コヒーシンの修復機能はコヒーシンを染色体に結合させる上で必要不可欠なScc2蛋白に依存しており、二本鎖切断時にはScc2の新たな結合が、セントロメアおよび、切断部位に検出される。現在、コヒーシンのDNA切断時に於ける配置変化に必要な因子を検索中である。
一方、分裂酵母染色体ではコヒーシンの配置は、必ずしも転写と排他的にはならず、その配置原理は出芽酵母と異なる。分裂酵母染色体はそのレプリコン構造に於いても、出芽酵母染色体とは異なることが示されている。現在、分配装置の配置を始め種々の染色体高次構造形成因子についての解析を通し、真核生物染色体に共通の構築原理を明らかにすると共に、この二つの酵母の染色体構造を比較することにより、大きなサイズの染色体の構築のために必要な因子とその役割について明らかにしようと考えている。

Report

(1 results)
  • 2004 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2005 2004 2003

All Journal Article (8 results)

  • [Journal Article] Glucose-dependent cell size is regulated by a G protein-coupled receptor system in yeast Saccharomyces cerevisiae.2005

    • Author(s)
      H.Tamaki, C.W.Yun, T.Mizutani, T.Tsuzuki, Y.Takagi, M.Shinozaki, Y.Kodama, K.Shirahige, H.Kumagai
    • Journal Title

      Genes Cells. 10

      Pages: 193-206

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] RSC Nucleosome-remodeling complex plays prominent roles in transcriptional regulation throughout budding yeast gametogenesis.2004

    • Author(s)
      H.Koyama, T.A.Nagao, T.Inai, K.Miyahara, Y.Hayasida, K.Shirahige, E.Tsuchiya
    • Journal Title

      Biosci Biotechnol Biochem. 68

      Pages: 909-919

    • NAID

      10013144047

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Reciprocal association of the budding yeast ATM-related proteins Tel1 and Mec1 with telomeres in vivo.2004

    • Author(s)
      H.Takata, Y.Kanoh, N.Gunge, K.Shirahige, Akira Matsuura
    • Journal Title

      Mol.Cell 14

      Pages: 515-522

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Cohesin relocation from sites of chromosomal loading to places of convergent transcriptions.2004

    • Author(s)
      A.Lengronne, Y.Katou, S.Mori, S.Yokobayashi, G.Kelly, T.Itoh, Y.Watanabe, K.Shirahige^*, F.Uhlmann^* (^*equally contributed author)
    • Journal Title

      Nature 430

      Pages: 573-578

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Yeast Pho85 kinase is required for proper gene expression during the diauxic shift.2004

    • Author(s)
      N.Nishizawa, Y.Katou, K.Shirahige, A.Toh-E
    • Journal Title

      Yeast 21

      Pages: 903-918

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Postreplicative recruitment of Cohesin to double-strand breaks is required for DNA repair.2004

    • Author(s)
      L.Strom, H.B.Lindroos, K.Shirahige, C.Sjogren
    • Journal Title

      Mol.Cell 16

      Pages: 1003-1015

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Spo13 Facilitates Monopolin Recruitment to Kinetochores and Regulates Maintenance of Centromeric Cohesion during Yeast Meiosis.2004

    • Author(s)
      V.L.Katis, J.Maton, S.Mori, K.Shirahige, W.Zachariae, K.Nasmyth
    • Journal Title

      Curr Biol. 14

      Pages: 2183-2196

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] S-phase checkpoint proteins Tof1 and Mrc1 form a stable replication pausing complex.2003

    • Author(s)
      Y.Katou, Y.Kanoh, N.Bando, H.Noguchi, H.Tanaka, T.Ashikari.K.Sugimoto, K.Shirahige
    • Journal Title

      Nature 424

      Pages: 1078-1083

    • Related Report
      2004 Annual Research Report

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Published: 2004-04-01   Modified: 2018-03-28  

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