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SAGE法による食道癌・胃癌特異的遺伝子の探索とその意義に関する臨床疫学的研究

Research Project

Project/Area Number 16024213
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionHiroshima University

Principal Investigator

安井 弥  広島大学, 大学院・医歯薬学総合研究科, 教授 (40191118)

Project Period (FY) 2004
Project Status Completed (Fiscal Year 2004)
Budget Amount *help
¥7,100,000 (Direct Cost: ¥7,100,000)
Fiscal Year 2004: ¥7,100,000 (Direct Cost: ¥7,100,000)
Keywords胃癌 / SAGE法 / MIA / GW112 / カアスタムアレイ / 臨床疫学 / CLDN18
Research Abstract

SAGE法により、世界最大のSAGEライブラリーを完成し(GEO accession no. GSE545)、胃癌の発生・進展に関与する多くの遺伝子を同定してきた。胃癌SAGEライブラリーとデータベース中の主要な12種類の正常臓器のライブラリーとの比較から、癌特異的発現遺伝子候補をリストアップし、定量的RT-PCR法による実際の胃癌と正常臓器における発現解析により、少なくとも8遺伝子が特異的に発現することを見い出した。この中にはMIA(melanoma inhibitory activity)とGW112という既知の遺伝子が含まれていた。胃癌についての定量的RT-PCR法では、進行癌症例で有意に発現レベルが高く、MIA陽性例は陰性例に比較して有意に予後不良であった。ELISAにて測定した血中MIA値は、高度進行胃癌症例で高値であった。GW112は、胃癌の58%(29/50)において過剰発現(T/N>2)しており、悪性度と相関していた。
SAGEで抽出した164の特異的遺伝子に既知の遺伝子を加えたオリゴDNAカスタムアレイを用いて、20例の胃がん組織について遺伝子発現を解析し、T grade、N grade、Histologyなどを判別する有意な遺伝子群を抽出した。
また、SAGEライブラリーの比較から胃癌において発現が抑制されている遺伝子としてCLDN18を同定した。RT-PCR法によって胃癌では65%にCLDN18の発現低下が認められた。さらに、5'UTRにG/AのSNPの存在が見い出され、胃癌症例対照研究から、A/G及びG/G genotypeが胃がんの発生リスクに関連する可能性が示唆された。

Report

(1 results)
  • 2004 Annual Research Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2005 2004

All Journal Article (9 results)

  • [Journal Article] A single nucleotide polymorphism of the MMP9 promoter affects tumor progression and invasive phenotype of gastric cancer2005

    • Author(s)
      Matsumura, S.
    • Journal Title

      J.Cancer Res.Clin.Oncol. 131

      Pages: 19-25

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Loss of heterozygosity and histone hypoacetylation of the PINX1 gene are associated with reduced expression in gastric carcinoma2005

    • Author(s)
      Kondo, T.
    • Journal Title

      Oncogene 24

      Pages: 157-164

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Histone H3 acetylation is associated with reduced p21^<WAF1/CIP1> expression in gastric carcinoma2005

    • Author(s)
      Mitani, Y.
    • Journal Title

      J.Pathol. 205

      Pages: 65-73

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Gene expression profile of gastric carcinoma : Identification of genes and tags potentially involved in invasion, metastasis and carcinogenesis by serial analysis of gene expression2004

    • Author(s)
      Oue, N.
    • Journal Title

      Cancer Res. 64

      Pages: 2397-2405

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Expression of POT1 is associated with tumor stage and telomere length in gastric carcinoma2004

    • Author(s)
      Kondo, T.
    • Journal Title

      Cancer Res. 64

      Pages: 523-529

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Search for new biomarkers of gastric cancer through serial analysis of gene expression and its clinical implication2004

    • Author(s)
      Yasui, W.
    • Journal Title

      Cancer Sci. 95

      Pages: 385-392

    • NAID

      10013722794

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Frequent epigenetic inactivation of RIZ1 by promoter hypermethylation in human gastric carcinoma2004

    • Author(s)
      Oshimo, Y.
    • Journal Title

      Int.J.Cancer 110

      Pages: 212-218

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Epigenetic inactivation of SOCS-1 by CpG island hypermethylation in human gastric carcinoma2004

    • Author(s)
      Oshimo, Y.
    • Journal Title

      Int.J.Cancer 112

      Pages: 1003-1009

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] A single nucleotide polymorphism in the MMP-1 promoter is correlated with histological differentiation of gastric cancer2004

    • Author(s)
      Matsumura, S.
    • Journal Title

      J.Cancer Res.Clin.Oncol. 130

      Pages: 259-265

    • Related Report
      2004 Annual Research Report

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Published: 2004-04-01   Modified: 2018-03-28  

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