• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

結晶性ペプチド配位子を用いた金属酵素活性中心の合成的研究

Research Project

Project/Area Number 16033211
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Science and Engineering
Research InstitutionGunma University

Principal Investigator

奥 浩之  群馬大学, 工学部, 助教授 (20301749)

Project Period (FY) 2004 – 2005
Project Status Completed (Fiscal Year 2005)
Budget Amount *help
¥4,300,000 (Direct Cost: ¥4,300,000)
Fiscal Year 2005: ¥2,100,000 (Direct Cost: ¥2,100,000)
Fiscal Year 2004: ¥2,200,000 (Direct Cost: ¥2,200,000)
Keywordsペプチド / X線結晶構造解析 / 生体関連化学 / ヒスチジン / ロイシン / ピリジルアラニン / グルタミン酸 / アスパラギン酸 / 金属酵素 / 生物無機化学 / 活性中心
Research Abstract

本研究は、結晶性の良いペプチドを用いて金属酵素活性中心を化学合成することを目的としている。これによりアミノ酸に由来する配位環境まで含めた、より複雑で大きな活性中心の構築を目指している。現在までに以下の成果を得た。
(1)配位子の基礎設計
ペプチドヘリックスを錯体配位子として用いる場合、問題となる点は合成・溶解度・結晶性に加えてコンフォメーションの安定性である。今回、安定なペプチドヘリックスをデザインする必要性から単結晶構造解析を用いて、2次構造の安定化と発生機構について検討を行った。-(Leu-Leu-Lac)-(Lac=L-lactic acid)の場合、βシートの単結晶は6〜2残基に於いて、ヘリックスの単結晶は11〜14残基以上の配列から得られることがわかった。
(2)窒素配位子を持つペプチドヘリックス
金属酵素活性中心を構成するアミノ酸のうち、窒素配位子としてヒスチジン(His)がよく見られる。しかしペプチド合成に於いてHisは保護基の選択、脱保護、溶解性に問題が多い。そこで始めにHisアナログとして用いられるPal(β-(3-pyridyl)-L-alanine)を組み込んだペプチド配位子と錯体の合成研究を行った。Pal族基を2つ有するペプチドヘリックスとCo(II)の錯形成の場合、無限鎖を除き、分子間と分子内の配位形式が考えられる。配列を変えて合成を行い、この2種類を得ることに成功した。
(3)カルボン酸配位子を持つペプチドヘリックス
金属酵素活性中心を構成するアミノ酸として、酸素配位子としてアスパラギン酸(Asp)とグルタミン酸(Glu)がよく見られる。GluとAsp残基を有するペプチドヘリックスとCo(II)の錯形成による錯体構造がX線構造解析から得られた。結晶構造中には1:1の錯形成で生じた無限鎖構造が観察された。

Report

(2 results)
  • 2005 Annual Research Report
  • 2004 Annual Research Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2005 2004 Other

All Journal Article (11 results) Patent(Industrial Property Rights) (2 results)

  • [Journal Article] tert-Butoxycarbonyl-L-Leucyl-L-Alanine Trichloroethyl Ester (Boc-L-Leu-L-Ala-OTce).2005

    • Author(s)
      Hiroyuki Oku
    • Journal Title

      Acta Cryst. E61

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Synthesis and Properties of Helical Peptides Having His and Glu Residues as a Model of Metal-Binding Protein.2005

    • Author(s)
      Yosuke Kimura
    • Journal Title

      Peptide Science 2004

      Pages: 437-440

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Synthetic Study of an Antigenic Peptide Having a Partial Sequence Synthesis and Properties of Thermo-Responsible Polydepsipeptide Containing Hmb (2-hydroxy-3-methyl-butanoic acid) Residues.2005

    • Author(s)
      Kazuaki Shichiri
    • Journal Title

      Peptide Science 2004

      Pages: 633-636

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Synthesis of a Model peptide Containing a Metal Binding Site of Carbon Monooxide Dehydrogenase/Acetyl Coenzyme A Synthase(CODH/ACS).2005

    • Author(s)
      Ikuo Kondo
    • Journal Title

      Peptide Science 2004

      Pages: 625-628

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Synthetic Study of a Cyclic Peptoide Aureobasidine A.2005

    • Author(s)
      Ryo Naito
    • Journal Title

      Peptide Science 2004

      Pages: 649-652

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Synthesis, Crystal Structure and Molecular Conformation of Na-Boc-L-Leucyl-(Z)-β-(3-pyridyl)-α,β- Dehydroalanyl-L-Leucine Methyl Ester2005

    • Author(s)
      Keiichi Yamada
    • Journal Title

      J.Pep.Res. 65巻

      Pages: 167-174

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Addition of a Peptide Fragment on a α-Helical Depsipeptide Induces α/310-Conjugated Helix : Synthesis, Crystal Structure, and Sepctr oscopic Analysis of Boc-Leu-Leu-Ala-(Leu-Leu-Lac)3-Leu-Leu-OEt.2004

    • Author(s)
      Hiroyuki Oku
    • Journal Title

      Biopolymers 75巻

      Pages: 242-254

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] A synthetic intermediate of enantiopure N-protected β-hydroxyvalin e, (2R)-2-[N-(tert-butoxycarbonyl) amino]-3-methylbutane-1,3-diol2004

    • Author(s)
      Hiroyuki Oku
    • Journal Title

      Acta Cryst. E60巻

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] A synthetic fragment of a cyclic depsipeptide, aureobasidine A : tert-Butoxycarbonyl-L-all-isoleucyl-N-methyl-L-valine (Boc-L-all-Ile-L-MeVal-OH)2004

    • Author(s)
      Hiroyuki Oku
    • Journal Title

      Acta Cryst. E60巻

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] An N-Protected depsipeptide Free Acid Prepared by Direct Synthesis Without Using a Terminal-C Protecting Group : tert-Butoxycarbonyl-L-Alanyl-L-Leucyl-L-Lactic Acid (Boc-L-Ala-L-Leu-Lac-OH)2004

    • Author(s)
      Hiroyuki Oku
    • Journal Title

      Acta Cryst. E60巻

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] A Short Depsipeptide : tert-Butoxycarbonyl-L-Lactic Acid Benzyl Ester (Boc-L-Ala-L-Lac-OBzl)

    • Author(s)
      Hiroyuki Oku
    • Journal Title

      Acta Cryst. E60巻

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 温度応答性デプシペプチドポリマー2005

    • Inventor(s)
      奥 浩之
    • Industrial Property Rights Holder
      群馬大学
    • Filing Date
      2005-10-20
    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 温度応答性デプシペプチドポリマー2004

    • Inventor(s)
      奥 浩之
    • Industrial Property Rights Holder
      群馬大学
    • Industrial Property Number
      2004-305953
    • Filing Date
      2004-10-20
    • Related Report
      2004 Annual Research Report

URL: 

Published: 2004-04-01   Modified: 2018-03-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi