• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

核膜を介した双方向輸送に関わる蛋白質の多様な相互作用の構造生物学的研究

Research Project

Project/Area Number 16048225
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionKumamoto University

Principal Investigator

山縣 ゆり子  熊本大学, 大学院・医学薬学研究部, 教授 (40183678)

Project Period (FY) 2004
Project Status Completed (Fiscal Year 2004)
Budget Amount *help
¥3,600,000 (Direct Cost: ¥3,600,000)
Fiscal Year 2004: ¥3,600,000 (Direct Cost: ¥3,600,000)
Keywords核膜輸送タンパク質 / 構造生物学 / タンパク質の結晶化 / タンパク質の大量発現
Research Abstract

熊本大学谷らによって酵母のmRNAの核外輸送ができない温度感受性株の一つの原因蛋白質として見出されたPtr7はATP/GTP結合モチーフをもつ酵母の生育に必須の新規蛋白質で、核膜を介した核と細胞質間の双方向の輸送に必須であることが示されている。こ本研究の目的は、この新たに見出されたPtr7のX線結晶構造解析を行い、核膜孔複合体因子の一部に見られ、輸送に関わる蛋白質と相互作用するFGリピート領域と同様の配列をもつ意味やヒトPtr7と相互作用すると考えられている幾つかの蛋白質との核膜を介したソフトな相互作用を解明することである。本年度の成果は以下の通りである。
1.現在、Ptr7蛋白質の最も有望な大量産生系は封入体として生じる蛋白質を6M尿素で可溶化後、透析法でゆっくり尿素の濃度を薄くして行くことによって、蛋白質のリフォールディングを行い、大腸菌1リットルの培養で数100μgの蛋白質が得られる条件である。大腸菌の培養量を増やしてより大量に精製するという方向で精製を行った。Prt7蛋白質を精製する都度、結晶が得られた沈殿剤にPEG6000を用いた条件を中心にしつつ、広範な条件の結晶化のスクリーニングを行い、X線解析に適した結晶の調製に取り組んだ。
2.合わせてより効率のよいリフォールデリング条件の検索を、主に添加物を加えて検討したが、現在のところ今以上に効率よく精製できる条件は見つかっていない。1の方法でPtr7の精製を行う一方、平行して、可溶性でより大量に得られる発現系の構築のため、種々の発現ベクターや大腸菌宿主を用いて、培養条件(温度、誘導方法、時間など)を検討した。現在のところpBluescrpt系とp ET系ベクターをもとに独自に作成した発現ベクターを用いたものが有望と思われる。

Report

(1 results)
  • 2004 Annual Research Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2005 2004

All Journal Article (6 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Identification of single Mn2+ binding sites required for activation of the mutant proteins of E. coli RNase HI at Glu48 and/or Asp 134 by X-ray crystallography2005

    • Author(s)
      Tsunaka Y. et al.
    • Journal Title

      J.Mol.Biol. 345

      Pages: 1171-1183

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Optimal site-specific PEGylation of mutant TNF-alpha improves its antitumor potency2004

    • Author(s)
      Yoshioka Y. et al.
    • Journal Title

      Biochem.Biophys.Res.Commun. 318

      Pages: 808-814

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] The Crystal Structure of the Tryptophan Synthase β Subunit from the Hyperthermophile. Pyrococcus furiosus2004

    • Author(s)
      Hioki Y. et al.
    • Journal Title

      Eur.J.Biochem. 271

      Pages: 2624-2635

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Structure of human MTH1, a Nudix family hydrolase that selectively degrades oxidized purine nucleoside triphosphates2004

    • Author(s)
      Mishima M. et al.
    • Journal Title

      J.Biol.Chem. 279

      Pages: 33806-33815

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Crystallization and preliminary X-ray analysis of Escherichia coli MutT in binary and ternary complex forms2004

    • Author(s)
      Nakamura T. et al.
    • Journal Title

      Acta Cryst. D60

      Pages: 161-1643

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Functionalization of TNF-alpha using phage display technique and PEGylation improves its antitumor therapeutic window2004

    • Author(s)
      Shibata H. et al.
    • Journal Title

      Clinical Cancer Res. 10

      Pages: 8293-8300

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Book] タンパク質のかたちから生命の謎を解く2005

    • Author(s)
      田之倉優 編
    • Total Pages
      232
    • Publisher
      株式会社 クバプロ
    • Related Report
      2004 Annual Research Report

URL: 

Published: 2004-04-01   Modified: 2018-03-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi