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リボソームによるmRNA切断:分子機構と生理的意義

Research Project

Project/Area Number 16657050
Research Category

Grant-in-Aid for Exploratory Research

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Molecular biology
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

饗場 弘二  名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (20025662)

Project Period (FY) 2004 – 2005
Project Status Completed (Fiscal Year 2005)
Budget Amount *help
¥2,900,000 (Direct Cost: ¥2,900,000)
Fiscal Year 2005: ¥1,400,000 (Direct Cost: ¥1,400,000)
Fiscal Year 2004: ¥1,500,000 (Direct Cost: ¥1,500,000)
KeywordstmRNA / トランス翻訳 / mRNA切断 / nonstop mRNA / リボソーム / 翻訳サーベイランス / リボソームの停滞 / レアコドン / 新生ポリペプチド
Research Abstract

バクテリアのtmRNAはtRNAとmRNAの両方の機能を持つユニークな低分子RNAで、トランス翻訳において中心的な役割を果たしている。トランス翻訳モデルは、モデル遺伝子の解析から提唱され、その機構のユニークさから多くの注目を浴びている。
これまでにモデル遺伝子を用いた解析より、終止コドンがトランス翻訳の新たな標的であること、この終止コドンにおけるトランス翻訳機構の解析を行なった結果、新生ポリペプチド鎖のC末端アミノ酸配列が決定因子であること、C末端アミノ酸配列はRFによる翻訳終結反応を阻害していること、終止コドンの種類に依存しないことなどを明らかにした。さらに解析を進めた結果、終止コドンにおけるトランス翻訳は、終止コドンの位置でリボソームが停滞した結果、mRNAの切断が起こり、nonstop mRNAの3'末端が産生されたためであることを明らかにしてきた。
従来から連続するアルギニンのレアコドンで翻訳伸長中のリボソームが停滞した場合に、トランス翻訳が起こることが知られている。このトランス翻訳は、正常なmRNA上のレアコドンで停滞したリボソームのA-siteにtmRNAが作用する結果と考えられてきた。すなわち、nonstop mRNAの3'末端以外におけるトランス翻訳の例とされてきた。今回、レアコドンにおけるトランス翻訳も、停滞したリボソームに応答してmRNAの切断が誘起され、生じたnonstop mRNAにtmRNAが作用する結果であることを証明した。本研究結果は、リボソームの停滞は、一般にmRNAの切断とトランス翻訳を引き起こすこと、nonstop mRNAの3'末端がおそらく普遍的唯一のtmRNAの作用点であることを示している。
本研究結果は『翻訳サーベイランス機構』を利用した遺伝子発現制御機構や、真核生物における『翻訳サーベイランス機構』の探索などにもつながることが期待される。

Report

(2 results)
  • 2005 Annual Research Report
  • 2004 Annual Research Report
  • Research Products

    (11 results)

All 2006 2005 2004

All Journal Article (11 results)

  • [Journal Article] Protein tagging at rare codons is caused by tmRNA action at the 3' end of nonstop mRNA generated in response to ribosome stalling.2006

    • Author(s)
      Li, X., Hirano, R., Tagami, H., Aiba, H.
    • Journal Title

      RNA 12

      Pages: 248-255

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Translational repression is sufficient for gene silencing by bacterial small non-coding RNAs in the absence of mRNA destruction.2006

    • Author(s)
      Morita, T., Mochizuki, Y., Aiba, H.
    • Journal Title

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA. in press

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Implication of membrane localization of target mRNA in the action of a small RNA : mechanism of post-transcriptional regulation of glucose transporter in Escherichia coli.2005

    • Author(s)
      Kawamoto, H., Morita, T., Shimizu, A., Inada, T., Aiba, H.
    • Journal Title

      Genes Dev. 19

      Pages: 328-338

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Translation of aberrant mRNAs lacking a termination codon or with a shortened 3'-UTR is repressed after initiation in yeast.2005

    • Author(s)
      Inada, T., Aiba, H.
    • Journal Title

      EMBO J. 24

      Pages: 1584-1595

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] RNase E-based ribonucleoprotein complexes : mechanical basis of mRNA destabilization mediated by bacterial noncoding RNAs.2005

    • Author(s)
      Morita, T., Maki, K., Aiba, H.
    • Journal Title

      Genes Dev. 19

      Pages: 2176-2186

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Implication of membrane localization of target mRNA in the action of a small RNA : mechanism of post-transcriptional regulation of glucose transporter in Escherichia coli.2005

    • Author(s)
      Kawamoto, H., Morita.T., Shimizu, A., Inada, T., Aiba, H.
    • Journal Title

      Genes Dev. 19

      Pages: 328-338

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      2004 Annual Research Report
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    • Author(s)
      El-Kazzaz, W., Morita, T., Tanaka, Y., Inada, T., Aiba, H.
    • Journal Title

      Mol.Microbiol. 51

      Pages: 1117-1128

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  • [Journal Article] Nascent peptide-mediated ribosome stalling at a stop codon induces mRNA cleavage resulting in nonstop mRNA that is recognized by tmRNA.2004

    • Author(s)
      Sunohara, T., Jojima, K., Yamamoto, Y., Inada, T., Aiba, H.
    • Journal Title

      RNA 10

      Pages: 378-386

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  • [Journal Article] Ribosome stalling during translation elongation induces cleavage of mRNA being translated in Escherichia coli.2004

    • Author(s)
      Sunohara, T., Jojima, K., Tagami, H., Inada, T., Aiba, H.
    • Journal Title

      J.Biol.Chem. 279

      Pages: 15368-15375

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  • [Journal Article] Membrane localization itself but not binding to IICB^<Gle> is directly responsible for the inactivation of the global repressor Mlc in Escherichia coli.2004

    • Author(s)
      Tanaka, Y., Itoh, F., Kimata, K., Aiba, H.
    • Journal Title

      Mol.Microbiol. 53

      Pages: 941-951

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  • [Journal Article] Enolase in the RNA degradosome plays a crucial role in the rapid decay of glucose transporter mRNA in the response to phosphosugar stress in Escherichia coli.2004

    • Author(s)
      Morita, T., Kawamoto, H., Mizota, T., Inada, T., Aiba, H.
    • Journal Title

      Mol.Microbiol. 54

      Pages: 1063-1075

    • Related Report
      2004 Annual Research Report

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Published: 2004-04-01   Modified: 2016-04-21  

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