| Project/Area Number |
16658020
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Exploratory Research
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Research Field |
Plant pathology
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| Research Institution | Kochi University |
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Principal Investigator |
曵地 康史 高知大学, 農学部, 教授 (70291507)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
木場 章範 高知大学, 農学部, 助教授 (50343314)
大西 浩平 高知大学, 遺伝子実験施設, 助教授 (50211800)
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| Project Period (FY) |
2004 – 2005
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2005)
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| Budget Amount *help |
¥3,100,000 (Direct Cost: ¥3,100,000)
Fiscal Year 2005: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
Fiscal Year 2004: ¥1,900,000 (Direct Cost: ¥1,900,000)
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| Keywords | oxolinic acid / Burkholderia glumae / 生存適応能 / DNAジャイレース / 耐性 / 生存適応能力 / キノロン系薬剤 |
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| Research Abstract |
イネもみ枯細菌病菌Burkholderia glumaeのキノロン系薬剤oxolinic acid(OA)の耐性機構について網羅的な解析を行い、以下の事項について明らかにした。
1.B.glumae圃場分離株のOA耐性は、いずれもGyrAの83番目のアミノ酸残基(GyrA83)のSerからArgまたはIleへの変異による。
2.GyrAの81(GyrA81)、82(GyrA82)および87番目(GyrA87)のアミノ酸残基の変異によってもB.glumaeはOA耐性となる。
3.B.glumaeのイネ小穂において、GyrA81、GyrA82およびGyrA87にそれぞれ変異を有する株の増殖能は著しく劣り、GyrA83に変異を有する株の、OA処理をした小穂における増殖能は、親株の小穂における増殖能と同等であった。すなわち、OA耐性株のうち、GyrA83に変異を有する株のみがイネ体における生存適応能を示すが、それもOA処理時に限られる。
4.GyrA83のアミノ酸変異によるOA耐性化は、house keeping遺伝子であるgyrBやrpoDの多様性や挿入配列を指標としたゲノムの多様性よりもスピードが速く、ゲノム複製のエラーによりもたらされる。すなわち、OA耐性B.glumae圃場分離株の起源を解析するためには、挿入配列ERICとBOXを用いたrep-PCRとgyrBとrpoDの塩基配列による系統解析とともに、GyrA83のアミノ酸解析とOA耐性度の解析が必要である。
5.GyrA83のアミノ酸に対応した塩基配列を基に、MAMA PCR法によるOA耐性B.glumae感染イネ種子の選抜方法を開発した。
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