ネパールにおけるロタウイルスの進化とワクチン導入が及ぼす影響の評価

• Project/Area Number: 16H05831
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 海外学術
• Research Field: Hygiene and public health
• Research Institution: Nagasaki University
• Principal Investigator: ゴウチャン プニータ 長崎大学, 医歯薬学総合研究科(医学系), 客員研究員 (20721038)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 金子 美穂 (後藤美穂) 長崎大学, 医歯薬学総合研究科(医学系), 助教 (50599909)
• Project Period (FY): 2016 – 2019
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2019)
• Budget Amount: ¥17,550,000 (Direct Cost: ¥13,500,000、Indirect Cost: ¥4,050,000); Fiscal Year 2019: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2018: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000); Fiscal Year 2017: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000); Fiscal Year 2016: ¥5,200,000 (Direct Cost: ¥4,000,000、Indirect Cost: ¥1,200,000)
• Keywords: ロタウイルス / G12P[6]型 / ネパール / ワクチン / 分子疫学 / ウイルス進化 / Rotavirus / G12P[6] / Molecular Epiedmiology / Nepal / Sequencing / Rotavirus A / Gastroenteritis / Children under 5 years / Genotyping / Electropherotyping / Whole genome sequencing / Rotavirus Nepal / Molecular Epidemiology / Genotype / Electropherotype / Strain / G12P[6]ロタウイルス

Outline of Annual Research Achievements

ネパールでは2017年に予定されていたロタウイルスワクチンの定期接種への導入が2020年6月に延期されたが、本研究ではワクチン導入がネパールにおけるロタウイルス下痢症の発生状況および流行株変異に与える影響を評価することを目的としており、ワクチン導入前の流行動態のサーベイランスを継続することが必要不可欠であることから、2019年度もこれまでと同様の調査を実施した。2019年に急性下痢症によりカトマンズ市内のカンティ小児病院を受診した5歳未満の下痢症患児から便検体を採取し、ELISA(免疫学的測定法)により126のロタウイルス陽性検体を同定した。これらの検体からロタウイルスゲノムRNAを抽出し、ポリアクリルアミドゲル電気泳動に供した。126検体のうち68検体について、ロタウイルスゲノムに由来する11本のバンドが明瞭に観察され、バンドパターンによる株の分類(electropherotyping)が可能であった。Long RNAパターンをもつ株は10種類、Short RNAパターンをもつ株は1種類の計11種類のパターンに分類された。これらのバンドパターンを過去に同地域で優勢を占めたG12P[6]株の複数のバンドパターンと比較したが、一致するものは見られなかった。本研究のこれまでの結果と合わせると、ネパールでは現行のロタウイルスワクチン株とは異型であり世界的にはまれなG12P[6]株が依然としてロタウイルス流行株の優勢を占めているとともに、それらは同じG12P[6]型をもつものの遺伝学的には異なる複数の株から構成されており、常に優勢株の置き換わりが起きているということが示唆された。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Research Products

• [Int'l Joint Research] トリブバン大学(ネパール)
• [Presentation] Changing trend in Rotavirus A observed among Nepali children under 5 years in the most recent years (2019)
  • Author(s): Punita Gauchan
  • Organizer: 第67回 日本ウイルス学会学術集会
• [Presentation] Anticipating rotavirus vaccine introduction in the national immunization programme in Nepal (2017)
  • Author(s): Punita Gauchan
  • Organizer: グローバルヘルス合同大会2017(第58回日本熱帯医学会大会・第32回日本国際保健医療学会学術大会・第21回日本渡航医学会学術集会 合同大会)
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] ネパールにおけるG12P[6]遺伝子型ロタウイルスA の持続的流行の基盤にある株交代 現象の全ゲノム解析による検証 (2017)
  • Author(s): Punita Gauchan
  • Organizer: 第70 回 日本細菌学会九州支部総会 第54 回 日本ウイルス学会九州支部総会
• [Presentation] Molecular epidemiology of Rotavirus A strains in Nepal, 2005-2011, and whole genome analysis of the predominant G12P[6] strains (2017)
  • Author(s): Punita Gauchan
  • Organizer: The 64th Annual Meeting of the Japanese Society for Virology
• [Presentation] Molecular epidemiology of Rotavirus A strains in Nepal, 2005-2011, and whole genome analysis of the predominant G12P[6] strains (2016)
  • Author(s): Punita Gauchan
  • Organizer: The 64th annual meeting of the Japanese Society for Virology,
  • Place of Presentation: Sapporo Convention Center (Hokkaido, Sapporo)
  • Year and Date: 2016-10-23