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タンパク質レベルの遺伝子量補償機構の体系的な解析

Research Project

Project/Area Number 16J00852
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field System genome science
Research InstitutionOkayama University

Principal Investigator

石川 浩史  岡山大学, 異分野融合先端研究コア, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2016-04-22 – 2018-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2017)
Budget Amount *help
¥1,900,000 (Direct Cost: ¥1,900,000)
Fiscal Year 2017: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2016: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Keywordsタンパク質複合体 / E3ユビキチンリガーぜ / N末端アセチル化酵素 / 遺伝子量補償 / ユビキチン-プロテアソーム系 / 酵母 / リボソームプロファイリング
Outline of Annual Research Achievements

多くの遺伝子では、遺伝子コピー数の増加はタンパク質発現量の増加に直接的に結びつき、そのコピー数が2倍になるとタンパク質発現量も2倍になる。これに対して、少数の遺伝子では、遺伝子コピー数の増加に伴いmRNAの発現量は増加するもののタンパク質発現量の増加にはそのまま結びつかないことが知られている。この現象は遺伝子量補償と呼ばれ、タンパク質複合体を構成するサブユニットをコードする遺伝子で優位に観察されることから、その生物学的役割の一つにサブユニット間の量比の維持があることが強く示唆されている。また、そのメカニズムについては、細胞内の主要なタンパク質分解経路であるユビキチン-プロテアソーム系を介したタンパク質分解の加速の関与が示されている。しかしながら、過剰なサブユニットのユビキチン化がどのようなメカニズムで引き起こされるのかは、近年いくつかのメカニズムが報告されているものの、それらの関係性は不明であり、全容解明には至っていない。本研究は、細胞が過剰なサブユニットを選択的にユビキチン化し分解するメカニズムの解明を目指し、これに関与するE3ユビキチンリガーゼの同定、ならびに、タンパク質N末端のアセチル化が関与する可能性の検証、を行った。E3ユビキチンリガーゼの解析では、Tom1及びNot4の関与を示した。一方、タンパク質N末端のアセチル化については、それを担う複数の酵素(Naa10, Naa20, Naa40)の関与を示した。このことは、複数のE3ユビキチンリガーゼ及びN末端アセチル化酵素を介して遺伝子量補償が起こることを示している。本研究により、複合体サブユニットの量比をコントロールするメカニズムの複雑さが具体化したと同時に、今後この分野の研究で重要となる問題が定義されつつある。以上の成果は論文としてまとめられている段階であり、当初の期待通りに研究が進展している。

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2017 Annual Research Report
  • 2016 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results) Book (1 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] University of California, Berkeley(米国)

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Journal Article] Post-translational dosage compensation buffers genetic perturbations to stoichiometry of protein complexes2017

    • Author(s)
      Koji Ishikawa, Koji Makanae, Shintaro Iwasaki, Nicholas T. Ingolia, Hisao Moriya
    • Journal Title

      PLoS Genetics

      Volume: 13(1) Issue: 1 Pages: e1006554-e1006554

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1006554

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Robustness of the Linearity in Gene Expression Level under Genetic Perturbations2017

    • Author(s)
      Koji Ishikawa, Koji Makanae, Shintaro Iwasaki, Nicholas T. Ingolia, Hisao Moriya
    • Organizer
      日本学術振興会第9回HOPEミーティング
    • Place of Presentation
      東京国際フォーラム(東京・千代田区)
    • Year and Date
      2017-02-26
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Multiple E3 ubiquitin ligases and N-terminal acetyltransferases are involved in protein-level dosage compensation that controls stoichiometry of protein complexes2017

    • Author(s)
      Koji Ishikawa, Hisao Moriya
    • Organizer
      The 42nd FEBS Congress, From Molecules to Cells and Back
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 遺伝子発現量の乱れをタンパク質レベルで補償する機構の解析2016

    • Author(s)
      石川浩史, 蒔苗浩司, 岩崎信太郎, Nicholas T. Ingolia, 守屋央朗
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム第49回研究報告会
    • Place of Presentation
      シーサイドホテル舞子ビラ(兵庫・神戸)
    • Year and Date
      2016-08-31
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Book] 実験医学増刊Vol.35 No.52017

    • Author(s)
      石川浩史, 江口優一, 守屋央朗
    • Total Pages
      6
    • Publisher
      株式会社 羊土社
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Remarks] 岡山大学Webレター(OU-MRU)Vol.37

    • URL

      http://www.okayama-u.ac.jp/eng/research_highlights/index_id48.html

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Remarks] 岡山大学プレスリリース

    • URL

      https://www.okayama-u.ac.jp/tp/release/release_id447.html

    • Related Report
      2016 Annual Research Report

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Published: 2016-05-17   Modified: 2024-03-26  

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