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フラビウイルスの病原性発現機構におけるウイルス由来長鎖ncRNAの役割の解明

Research Project

Project/Area Number 16J00854
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Veterinary medical science
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

武藤 芽未  北海道大学, 獣医学研究科, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2016-04-22 – 2018-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2017)
Budget Amount *help
¥1,700,000 (Direct Cost: ¥1,700,000)
Fiscal Year 2017: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2016: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Keywords非翻訳領域 / ウイルス / 人獣共通感染症 / フラビウイルス / Non-coding RNA
Outline of Annual Research Achievements

フラビウイルス属のウイルスは熱性疾患や重篤な脳炎を引き起こす人獣共通感染症原因ウイルスが属している。フラビウイルスは、非翻訳領域から長鎖ncRNA(lncRNA)を産生する事が既に知られており、lncRNAがウイルスの増殖性や病原性制御に影響を及ぼすことが指摘されている。しかし、ウイルス由来lncRNAが関わる病原性の制御機構の詳細は明らかになっていない。先行研究より、TBEVのlncRNAの産生に関わる特定領域(3’-UTR)に欠損やpolyAの挿入がある場合、高い病原性を示すことが明らかとなっている。また、マウスを用いた実験によって、この3’-UTRにみられる多様性は、宿主内に侵入したウイルスの増殖性や病原性の制御機構に関与している可能性が示唆されてきた。昨年度の研究成果では、TBEV低病原性株であるOshima株由来3’-UTRに結合し、高病原性株であるSofjin株由来3’-UTRには結合しない宿主蛋白質としてCold Shock Domain E1 (CSDE1)、Fragile X mental retardation protein (FMRP)およびInterleukin factor 3 (ILF3)同定した。これらの蛋白質と3’-UTR の結合を検証するため、RNA免疫沈降を行った。Flagを付加したCSDE1、FMRPおよびILF3過発現細胞を作出し、ウイルス由来3’-UTR と混合した。Flag抗体を用いて免疫沈降を行い、過発現蛋白質が検出されることを確認した。沈降画分内のRNAを抽出し、TBEV特異的なプライマーを用いてReverse transcription PCR(RT-PCR)を行ったところ、Oshima株由来3’-UTRを混合した画分にのみTBEV特異的なRNAが検出されることを確認した。

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2017 Annual Research Report
  • 2016 Annual Research Report
  • Research Products

    (4 results)

All 2018 2017 2016

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Journal Article] Identification and analysis of host proteins that interact with the 3′-untranslated region of tick-borne encephalitis virus genomic RNA2018

    • Author(s)
      Muto Memi、Kamitani Wataru、Sakai Mizuki、Hirano Minato、Kobayashi Shintaro、Kariwa Hiroaki、Yoshii Kentaro
    • Journal Title

      Virus Reserch

      Volume: 249 Pages: 52-56

    • DOI

      10.1016/j.virusres.2018.03.006

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Identification of host proteins interacting with the 3’ UTR of tick-borne encephalitis virus.2017

    • Author(s)
      Memi Muto
    • Organizer
      International Union of Microbiological Societies
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Identification of host proteins interacting with the 3’ UTR of tick-borne encephalitis virus.2016

    • Author(s)
      武藤 芽未
    • Organizer
      The 64th Annual Meeting of the Japanese Society for Virology
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター 北海道札幌市
    • Year and Date
      2016-10-23
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Identification of host proteins interacting with the 3’ UTR of tick-borne encephalitis virus.2016

    • Author(s)
      Memi Muto
    • Organizer
      The 4th Sapporo Summer Seminar for One Health
    • Place of Presentation
      北海道大学 北海道札幌市
    • Year and Date
      2016-09-20
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2016-05-17   Modified: 2024-03-26  

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