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翻訳伸長段階におけるリボソームストークタンパク質複合体の分子動態解析

Research Project

Project/Area Number 16J01001
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Molecular biology
Research InstitutionNiigata University

Principal Investigator

今井 大達  新潟大学, 自然科学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2016-04-22 – 2019-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2018)
Budget Amount *help
¥2,800,000 (Direct Cost: ¥2,800,000)
Fiscal Year 2018: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2017: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2016: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Keywordsリボソーム
Outline of Annual Research Achievements

最終年度は①リボソームストーク・ABCE1間相互作用の細胞内の機能解析と②ABCE1依存のサブユニット解離反応におけるリボソームストークの機能解析を行った。

①P1とABCE1の相互作用の細胞内機能解析を試みた。酵母ABCE1(Rli1)は致死遺伝子であるため、その発現をガラクトースプロモーターで制御する出芽酵母株rli1-degron株を作製した。rli1-degron株にRli1-野生型、またはリボソームストークと結合しないRli1-3S変異体の発現プラスミドをそれぞれ補填し、内在性Rli1非存在下における生育を観察した。その結果、3S変異によりrli1-degron株の生育が阻害され、リボソームストーク・ABCE1間相互作用が出芽酵母の生育に重要であることが判明した。

②リボソームストークはABCE1のATP加水分解を促進する。一方で、リボソームサブユニット解離におけるABCE1のATP加水分解の役割は明らかではない。そこでリボソームサブユニット解離におけるABCE1のATP加水分解の役割とリボソームストークの機能解析を行った。出芽酵母80Sリボソーム、Rli1、Dom34、eIF6をそれぞれ精製し、試験管内でのリボソームサブユニット解離を検出した。非加水分解性ATPアナログであるANP-PMPを用いると、ABCE1依存のリボソームサブユニット解離が著しく阻害された。この結果からABCE1のATP加水分解はリボソームサブユニット解離に必須であることが判明した。さらにRli1-3S変異体を用いると、ABCE1のATP加水分解効率およびリボソームサブユニット解離効率がそれぞれ約60%まで低下した。これらの結果から、リボソームストークはABCE1のATP加水分解を促進することでリボソームサブユニット解離を誘導することが判明した。

Research Progress Status

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2018 Annual Research Report
  • 2017 Annual Research Report
  • 2016 Annual Research Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2018 2017 2016

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Journal Article] The ribosomal stalk protein is crucial for the action of the conserved ATPase ABCE12018

    • Author(s)
      Imai, H., Abe, T., Miyoshi, T., Nishikawa, S., Ito, K., and Uchiumi, T.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res.

      Volume: 46 Issue: 15 Pages: 7820-7830

    • DOI

      10.1093/nar/gky619

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Binding of translation elongation factors to individual copies of the archaeal ribosomal stalk protein aP1 assembled onto aP0.2017

    • Author(s)
      Honda, T., Imai, H., Suzuki, T., Miyoshi, T, Ito K, Uchiumi T.
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun.

      Volume: 483 Issue: 1 Pages: 153-158

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2016.12.175

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] ATP加水分解酵素ABCE1とリボソームストーク蛋白質の機能的相互作用2018

    • Author(s)
      今井 大達
    • Organizer
      第20回日本RNA学会年会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] リボソームストークによるATP加水分解酵素ABCE1の機能促進機構2018

    • Author(s)
      今井 大達
    • Organizer
      第5回リボソームミーティング
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] Interaction of the ribosome recycling factor ABCE1 with the ribosomal stalk and its role in the ribosome-dependent ATPase activation2017

    • Author(s)
      今井 大達、阿部 高也、三好 智博、伊東 孝祐、内海 利男
    • Organizer
      2017年度生命科学系学会合同年次大会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] Archaeal ribosomal stalk protein aP1 directly binds to the ribosome recycling factor aABCE1 and promotes ribosome-dependent ATP hydrolysis2017

    • Author(s)
      Hirotatsu Imai, Takaya Abe, Tomohiro Miyoshi, Kosuke Ito, Toshio Uchiumi
    • Organizer
      EMBO conference: Protein synthesis and Translational control
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 翻訳リサイクル反応におけるリボソームストークタンパク質P1の機能解析2016

    • Author(s)
      今井 大達
    • Organizer
      第39回日本分子生物学学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜 (神奈川県・横浜市)
    • Year and Date
      2016-12-02
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] A role of archaeal ribosomal stalk protein aP1 in ribosome recycling: binding to an ABC-family ATPase aABCE1 and stimulation of ribosome-dependent ATP hydrolysis2016

    • Author(s)
      Hirotatsu Imai
    • Organizer
      RNA2016
    • Place of Presentation
      Kyoto International Conference Center (Kyoto)
    • Year and Date
      2016-06-29
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 翻訳異常停滞時におけるリボソームストークタンパク質P1の機能解析2016

    • Author(s)
      今井 大達
    • Organizer
      第57回新潟生化学懇話会
    • Place of Presentation
      新潟大学医歯学総合病院 新潟医療人育成センター (新潟県・新潟市)
    • Year and Date
      2016-06-25
    • Related Report
      2016 Annual Research Report

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Published: 2016-05-17   Modified: 2024-03-26  

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