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テンサイ細胞質雄性不稔性における翻訳後制御過程の研究

Research Project

Project/Area Number 16J01146
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Science in genetics and breeding
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

荒河 匠  北海道大学, 農学院, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2016-04-22 – 2019-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2018)
Budget Amount *help
¥2,500,000 (Direct Cost: ¥2,500,000)
Fiscal Year 2018: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2017: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2016: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Keywords細胞質雄性不稔性 / ミトコンドリア / 分子進化 / 植物ミトコンドリア / 稔性回復遺伝子 / タンパク質間相互作用 / 遺伝子進化
Outline of Annual Research Achievements

本年度は、テンサイ細胞質雄性不稔性(CMS)の翻訳後制御に関する課題のうち、稔性回復遺伝子Rf1の複対立性を利用した解析と分子進化学的な解析を行った。
①多様なRf1対立遺伝子の機能解析
分子構造および作用力の異なる優性Rf1を特徴づけたところ、Rf1の作用力は、CMS関連ミトコンドリア遺伝子preSatp6と翻訳後相互作用する遺伝子コピーのmRNAと正に相関した。さらに、CMS株固有に見られるpreSATP6ホモオリゴマーはRf1保持株において減少し、その減少量は相互作用コピーのmRNAと正に相関した。一方で構造の異なる劣性rf1を調査すると、コードされるコピーはpreSatp6と相互作用しなかった。これらの事実に基づき、相互作用コピーの有無により稔性回復アレルを判別するDNAマーカーの開発に成功した。
②Rf1の分子進化学的解析
系統解析及びシンテニー解析を行ったところ、Rf1は属レベルの系統特異的な重複によって生じたことが示唆された。 次に、Oma1オーソログとRf1の機能を比較した。形質転換カルスを用いた調査によれば、テンサイ及びシロイヌナズナOma1オーソログはいずれもpreSATP6とは相互作用しない。発現解析を行うと、Oma1オーソログは全身で発現するが、Rf1は雄性器官特異的に発現していた。未成熟葯におけるmRNAの発現動態を調べたところ、シロイヌナズナOma1の発現パターンに対し、テンサイではOma1オーソログとRf1が相補的に発現していた。
これらのことから、Rf1の進化に遺伝子重複と機能分化が関わること、およびパラログであるRf1は花粉形成過程においてオーソログの機能を相補していると考えられた。したがって、Rf1が稔性回復以外の機能を保持する可能性が示唆された。今後、Rf1進化に核-細胞質の共進化や中立的な側面がどのように関与したか明らかにする必要がある。

Research Progress Status

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2018 Annual Research Report
  • 2017 Annual Research Report
  • 2016 Annual Research Report
  • Research Products

    (22 results)

All 2018 2017 2016 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (16 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results) Remarks (3 results)

  • [Journal Article] A fertility-restoring genotype of beet (Beta vulgaris L.) is composed of a weak restorer-of-fertility gene and a modifier gene tightly linked to the Rf1 locus2018

    • Author(s)
      Arakawa Takumi、Uchiyama Daisuke、Ohgami Takashi、Ohgami Ryo、Murata Tomoki、Honma Yujiro、Hamada Hiroyuki、Kuroda Yosuke、Taguchi Kazunori、Kitazaki Kazuyoshi、Kubo Tomohiko
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 13 Issue: 6 Pages: 1-20

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0198409

    • NAID

      120006471032

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Identification and characterization of a semi-dominant restorer-of-fertility 1 allele in sugar beet (Beta vulgaris)2018

    • Author(s)
      Arakawa Takumi、Ue Sachiyo、Sano Chihiro、Matsunaga Muneyuki、Kagami Hiroyo、Yoshida Yu、Kuroda Yosuke、Taguchi Kazunori、Kitazaki Kazuyoshi、Kubo Tomohiko
    • Journal Title

      Theoretical and Applied Genetics

      Volume: 132 Issue: 1 Pages: 227-240

    • DOI

      10.1007/s00122-018-3211-6

    • NAID

      120006776811

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Efficient callus formation and plant regeneration are heritable characters in sugar beet (Beta vulgaris L.)2016

    • Author(s)
      Hiroyo Kagami, Kazunori Taguchi, Takumi Arakawa, Yosuke Kuroda, Hideto Tamagake and Tomohiko Kubo
    • Journal Title

      Hereditas

      Volume: 153 Issue: 1

    • DOI

      10.1186/s41065-016-0015-z

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] テンサイCMSの花粉稔性にはpreSATP6複合体の蓄積量が相関する2018

    • Author(s)
      荒河 匠, 上 幸代, 佐野 千紘, 鏡 豊代, 吉田 有宇, 北﨑 一義, 久保 友彦
    • Organizer
      第134回日本育種学会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] 花粉稔性回復遺伝子の分子進化過程は核-ミトコンドリアコンフリクト仮説に符合するか2018

    • Author(s)
      荒河 匠, 勝山 嵩也, 菅谷 元, 本間 雄二朗, 佐野 千紘, 久保 友彦
    • Organizer
      第2回日本共生生物学会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] Molecular interaction of cytoplasmic male sterility in sugar beet2018

    • Author(s)
      Takumi Arakawa, Kazuyoshi Kitazaki, Muneyuki Matsunaga, Rika Yui-Kurino, Hiroaki Matsuhira, Tetsuo Mikami, Tomohiko Kubo
    • Organizer
      76th The International Institute of Sugar Beet Research (IIRB) Congress
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Molecular basis of nuclear-mitochondrial interaction in cytoplasmic male sterility in sugar beet2018

    • Author(s)
      Takumi Arakawa, Kazuyoshi Kitazaki, Muneyuki Matsunaga, Rika Yui-Kurino, Hiroaki Matsuhira, Tetsuo Mikami, Tomohiko Kubo
    • Organizer
      25th International Congress on Sexual Plant Reproduction
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] テンサイ花粉稔性回復遺伝子Rf1の進化的側面2018

    • Author(s)
      荒河 匠, 勝山 嵩也, 菅谷 元, 本間 雄二朗, 佐野 千紘, 久保 友彦
    • Organizer
      日本育種学会第133回講演会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] テンサイ花粉稔性回復遺伝子Rf1の進化には遺伝子重複と機能分化が関わる2018

    • Author(s)
      荒河 匠, 勝山 嵩也, 菅谷 元, 本間 雄二朗, 佐野 千紘, 久保 友彦
    • Organizer
      第59回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] Post-translational mechanisms in repression of male sterility-associated mitochondrial gene in sugar beet (Beta vulgaris)2017

    • Author(s)
      Takumi Arakawa, Kazuyoshi Kitazaki, Muneyuki Matsunaga, Hiroaki Matsuhira, Tetsuo Mikami and Tomohiko Kubo
    • Organizer
      10th International Conference on Plant Mitochondrial Biology
    • Place of Presentation
      浙江大学(杭州市・中国)
    • Year and Date
      2017-05-27
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] テンサイRf1の不完全優性対立遺伝子存在下におけるpreSATP6タンパク質複合体の挙動2017

    • Author(s)
      荒河 匠, 上 幸代, 鏡 豊代, 吉田 有宇, 久保 友彦
    • Organizer
      日本育種学会第131回講演会
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県・名古屋市)
    • Year and Date
      2017-03-29
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] 染色体組換えにより生じたテンサイ新規Rf1アレルの特徴づけ2017

    • Author(s)
      荒河 匠, 大神 貴史, 内山 大輔, 佐野 千紘, 久保 友彦
    • Organizer
      日本育種学会第132回講演会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] テンサイ花粉稔性回復遺伝子Rf1の進化過程2017

    • Author(s)
      荒河 匠, 勝山 嵩也, 菅谷 元, 本間 雄二朗, 佐野 千紘, 久保 友彦
    • Organizer
      第40回 日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] Post-translational mechanisms in repression of male sterility-associated mitochondrial gene in sugar beet (Beta vulgaris)2017

    • Author(s)
      Takumi Arakawa, Kazuyoshi Kitazaki, Muneyuki Matsunaga, Hiroaki Matsuhira, Tetsuo Mikami and Tomohiko Kubo
    • Organizer
      The 10th International Conference of Plant Mitochondrial Biology
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] テンサイ稔性回復遺伝子Rf1における不完全優性を示す対立遺伝子の同定2016

    • Author(s)
      上 幸代, 荒河 匠, 鏡 豊代, 吉田 有宇, 久保 友彦
    • Organizer
      日本育種学会・日本作物学会北海道談話会
    • Place of Presentation
      北海道大学(北海道・札幌市)
    • Year and Date
      2016-12-03
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] テンサイ花粉不稔に関わるミトコンドリアタンパク質preSATP6の機能解析2016

    • Author(s)
      荒河 匠, 松永 宗幸, 北﨑 一義 , 久保 友彦
    • Organizer
      第39回 日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県・横浜市)
    • Year and Date
      2016-11-30
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] テンサイ細胞質雄性不稔性に関わるpreSATP6タンパク質複合体の機能解析2016

    • Author(s)
      荒河 匠, 松永 宗幸, 北﨑 一義 , 久保 友彦
    • Organizer
      日本育種学会第130回講演会
    • Place of Presentation
      鳥取大学(鳥取県・鳥取市)
    • Year and Date
      2016-10-08
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Post-translational regulation in nuclear-mitochondrial interaction of cytoplasmic male sterility in sugar beet2016

    • Author(s)
      Takumi Arakawa, Kazuyoshi Kitazaki, Muneyuki Matsunaga, Hiroaki Matsuhira, Tetsuo Mikami and Tomohiko Kubo
    • Organizer
      The 13th International Colloquium on Endocytobiology and Symbiosis
    • Place of Presentation
      京都府立大学(京都府・京都市)
    • Year and Date
      2016-09-13
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Post-translational mechanism is associated with sex determination in sugar beet plant2016

    • Author(s)
      Takumi Arakawa, Kazuyoshi Kitazaki, Rika Yui-Kurino, Tetsuo Mikami and Tomohiko Kubo
    • Organizer
      Agriculture biodiversity conference 2016
    • Place of Presentation
      北海道大学(北海道・札幌市)
    • Year and Date
      2016-08-24
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 遺伝子制御HPトップ - 北海道大学 農学部

    • URL

      http://lab.agr.hokudai.ac.jp/ikushu/gelab/index.html

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Remarks] 北海道大学遺伝子制御学研究室のHP

    • URL

      http://www.agr.hokudai.ac.jp/ikushu/gelab/index.html

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Remarks] 北海道大学遺伝子制御学研究室ホームページ

    • URL

      http://www.agr.hokudai.ac.jp/ikushu/gelab/

    • Related Report
      2016 Annual Research Report

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Published: 2016-05-17   Modified: 2024-03-26  

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