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DNA配列設計によりアメーバ運動を自律的に制御する細胞サイズ分子ロボット

Research Project

Project/Area Number 16J02406
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Life / Health / Medical informatics
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

佐藤 佑介  東北大学, 工学研究科, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2016-04-22 – 2018-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2017)
Budget Amount *help
¥2,300,000 (Direct Cost: ¥2,300,000)
Fiscal Year 2017: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2016: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
KeywordsDNAナノテクノロジー / 分子ロボティクス / 細胞サイズリポソーム / モータタンパク質 / 人工細胞 / 相分離膜 / DNAオリガミ / マイクロマシン
Outline of Annual Research Achievements

本年度は,細胞サイズ分子ロボット界面における分子デバイスの集積化および運動の自律制御のための信号分子増幅回路の実装に向けた研究を行った.
分子デバイスの集積化技術の開発に向けて,前年度に開発したアメーバ型分子ロボットの筐体が相分離リポソームであることを踏まえ,相分離脂質膜上におけるDNAオリガミ構造の自己集合特性について調査した.成果として,相分離膜上のDNAオリガミは脂質の相およびイオン強度に依存した自己集合特性を示すことが明らかとなった.この知見は,外部環境に応答して膜面上で自己組織化する分子デバイス開発のための要素技術として応用でき,分子ロボットの自律的な動作決定や膜面上の分子配置の制御を実現する上で重要な成果である.この成果について学術論文として報告した.
また,信号増幅回路の実装においても成果があった.従来のリポソーム内部でのDNA増幅反応は高温域での人為的な温度サイクルを必要とするものであり,分子ロボットの構成要素への熱損傷や反応が自律的に進まないなどの課題があった.本年度の成果として,生理学的等温条件で特定のDNA分子を増幅する機構を細胞サイズリポソームに実装することに成功した.さらに,その増幅挙動が試験管内とリポソーム内との間で大きく異なることを明らかとした.これは,分子ロボットの自律制御を実現する上で有用な知見であり,この成果について,発表賞を受賞するとともに,現在学術論文として投稿するための準備を行っている.
運動方向の規定については,計画時にはマイクロビーズを用いることを想定していたが,ビーズの封入率の個体差が大きく,困難であることが明らかとなった.一方,本年度に開発したDNAナノ構造の集積化技術は,人工機能性膜ドメインの構築へも応用できる成果である.今後,この成果をもとに分子ロボットの局所的な変形・方向性を持った運動へと発展させたいと考えている.

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2017 Annual Research Report
  • 2016 Annual Research Report
  • Research Products

    (24 results)

All 2018 2017 2016 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (15 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Invited: 4 results) Remarks (5 results)

  • [Journal Article] Environment-dependent Self-assembly of DNA Origami Lattices on Phase-separated Lipid Membranes2018

    • Author(s)
      Yusuke Sato, Masayuki Endo, Masamune Morita, Masahiro Takinoue, Hiroshi Sugiyama, Satoshi Murata, Shin-ichiro M. Nomura, and Yuki Suzuki
    • Journal Title

      Advanced Materials Interfaces

      Volume: 印刷中

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] アメーバ型分子ロボットの可能性2017

    • Author(s)
      佐藤佑介, 川又生吹, 野村 M. 慎一郎
    • Journal Title

      医療と検査機器・試薬

      Volume: 40 Pages: 190-194

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Journal Article] Micrometer-sized molecular robot changes its shape in response to signal molecules2017

    • Author(s)
      Yusuke Sato, Yuichi Hiratsuka, Ibuki Kawamata, Satoshi Murata, Shin-ichiro M. Nomura
    • Journal Title

      Science Robotics

      Volume: 2 Issue: 4

    • DOI

      10.1126/scirobotics.aal3735

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] BIOMOD: Road to Molecular Robotics2016

    • Author(s)
      佐藤佑介, 瀧ノ上正浩, 野村 M. 慎一郎
    • Journal Title

      Seibutsu Butsuri

      Volume: 56 Issue: 5 Pages: 290-292

    • DOI

      10.2142/biophys.56.290

    • NAID

      130005264848

    • ISSN
      0582-4052, 1347-4219
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 分子ロボットへの信号DNA増幅機構の実装に向けて2018

    • Author(s)
      佐藤佑介,小宮健,川又生吹,村田智,野村 M, 慎一郎
    • Organizer
      第1回分子ロボティクス年次大会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] 相分離脂質膜上におけるDNAオリガミの自己集合2018

    • Author(s)
      佐藤佑介,遠藤政幸,森田雅宗,瀧ノ上正浩,杉山弘,村田智,野村 M. 慎一郎,鈴木勇輝
    • Organizer
      第1回分子ロボティクス年次大会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] Molecular robots under construction: amoeba-type artificial cell model2017

    • Author(s)
      野村 慎一郎, 佐藤 佑介, 平塚 祐一, 川岸 由, 小椋 利彦, 川又 生吹, 村田 智
    • Organizer
      第64回応用物理学会春期学術講演会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜,神奈川
    • Year and Date
      2017-03-14
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Controlling dynamic shape change of giant liposome by using molecular motors and DNAs2017

    • Author(s)
      Yusuke Sato
    • Organizer
      Workshop on Soft and Nano Materials Orchestrated with Wisdom from Japan
    • Place of Presentation
      Pension SHAROM, Hokkaido, Japan
    • Year and Date
      2017-01-08
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 分子信号を認識して動く細胞サイズリポソームの構築に向けて2017

    • Author(s)
      佐藤佑介
    • Organizer
      「細胞を創る」研究会10.0
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Development of a cell-sized molecular robot controlled by an external molecular signal2017

    • Author(s)
      Yusuke Sato, Yuki Suzuki, Ibuki Kawamata, Satoshi Murata, Yuichi Hiratsuka, Ken Komiya, Masayuki Endo, Shin-ichiro M. Nomura
    • Organizer
      The 55th Annual Meeting of the BSJ
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] Non Natural Tiny-wet Machine: Molecular Robot2017

    • Author(s)
      Yusuke Sato, Y. Hiratsuka, I. Kawamata, S. Murata, Sin-ichiro M. Nomura
    • Organizer
      The 28th International Symposium on Micro-NanoMechatronics and Human Science
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] DNA devices and molecular motors control dynamic shape change of giant liposome in response to DNA signals2017

    • Author(s)
      Yusuke Sato, Y. Hiratsuka, I. Kawamata, S. Murata, S. M. Nomura
    • Organizer
      Foundations of Nanoscience Meeting (FNANO 2017)
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Amoeba type molecular robot: controlling shape change of giant liposome entrapping molecular motors and DNA circuits2016

    • Author(s)
      Yusuke Sato, Yuichi Hiratsuka, Ibuki Kawamata, Satoshi Murata, Shin-ichiro M. Nomura
    • Organizer
      The 54rh Annual Meeting of the BSJ
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場,茨城
    • Year and Date
      2016-11-25
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] アメーバ型分子ロボット:シグナル分子に応じた動的変形挙動の切り替え制御が可能な巨大リポソーム2016

    • Author(s)
      佐藤佑介,平塚祐一,川又生吹,村田智,野村 M. 慎一郎
    • Organizer
      細胞をつくる研究会9.0
    • Place of Presentation
      早稲田大学国際会議場,東京
    • Year and Date
      2016-11-21
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] アメーバ型分子ロボット2016

    • Author(s)
      佐藤 佑介, 平塚祐一, 川又生吹, 村田智, 野村 M. 慎一郎
    • Organizer
      CBI学会2016年大会
    • Place of Presentation
      タワーホール船堀,東京
    • Year and Date
      2016-10-25
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Robotic Vesicle: Motility Control of Microcapsule by DNA devices and Molecular Motors2016

    • Author(s)
      Y. Sato, Y. Hiratsuka, I. Kawamata, S. Murata, S. M. Nomura
    • Organizer
      Thirteenth International Conference on Flow Dynamics
    • Place of Presentation
      Sendai International Center, Miyagi, Japan
    • Year and Date
      2016-10-10
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Robotic vesicle: Motility control of molecular robot by DNA devices and molecular motors2016

    • Author(s)
      野村 慎一郎,佐藤 佑介,平塚 祐一,川又 生吹,村田 智
    • Organizer
      第34回日本ロボット学会学術講演会
    • Place of Presentation
      山形大学小白川キャンパス,山形
    • Year and Date
      2016-09-07
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Motility control of amoeba type molecular robot by DNA devices and molecular motors2016

    • Author(s)
      Yusuke SATO, Yuichi HIRATSUKA, Ibuki KAWAMATA, Satoshi MURATA and Shin-ichiro M. NOMURA
    • Organizer
      The 22nd International Conference on DNA computing and Molecular Programming
    • Place of Presentation
      Munich, Germany
    • Year and Date
      2016-09-04
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Construction of liposome-based molecular robot: molecular motors and simple DNA circuit transform their compartment2016

    • Author(s)
      Yusuke SATO, Yuichi HIRATSUKA, Ibuki KAWAMATA, Satoshi MURATA and Shin-ichiro M. NOMURA
    • Organizer
      Foundations of Nanoscience Meeting (FNANO 2016)
    • Place of Presentation
      Utah, USA
    • Year and Date
      2016-04-11
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] IEEE Spectrum

    • URL

      http://spectrum.ieee.org/the-human-os/biomedical/devices/celllike-robot-programmable-with-dna

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Remarks] Popular Science

    • URL

      http://www.popsci.com/researchers-in-japan-create-tiny-amoeba-robot?dom=rss-default&src=syn

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Remarks] Asian scientist

    • URL

      https://www.asianscientist.com/2017/03/in-the-lab/molecular-robot-dna-protein/

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Remarks] 日経新聞: 東北大、分子機械を組み合わせアメーバ型分子ロボットを開発

    • URL

      http://www.nikkei.com/article/DGXLRSP438016_Y7A220C1000000/

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Remarks] Chem-Station: 分子機械を組み合わせてアメーバ型分子ロボットを作製

    • URL

      http://www.chem-station.com/blog/2017/04/molrobot.html

    • Related Report
      2016 Annual Research Report

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Published: 2016-05-17   Modified: 2024-03-26  

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