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ニホンドロソコエビの遺伝子発現解析を用いた汽水域底質の汚染源推定

Research Project

Project/Area Number 16J04681
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Civil and environmental engineering
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

日置 恭史郎  東京大学, 工学系研究科, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2016-04-22 – 2018-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2017)
Budget Amount *help
¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,300,000)
Fiscal Year 2017: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2016: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Keywords生態毒性 / cDNA-AFLP / 底質 / 道路塵埃 / Sediment TIE / 次世代シーケンサー / 遺伝子発現 / 非モデル生物
Outline of Annual Research Achievements

昨年度の研究によって、cDNA-AFLP法によって非モデル生物における新規の曝露マーカー遺伝子を探索でき、多様な化学物質を含む環境試料へも適用可能であることが示された。今年度は、これら遺伝子発現解析の結果が、Sediment TIE(Toxicity Identification Evaluation)などの物理化学的な処理を主とした従来の毒性原因物質特定手法と整合するかどうか検証した。
cDNA-AFLP解析時に使用した物と同一の道路塵埃試料を用いて、Sediment TIEを実施した。結果、陽イオン交換樹脂SIR-300を添加した系よりも炭素系吸着剤XAD-4を添加した系で有意に10日間致死率および成長阻害が低減され、有機系物質による毒性寄与が示唆された。さらにSediment TIEにおける曝露試験中の溶存態濃度の分析結果から、亜鉛、銅と遊離アンモニアよりもニコチンの道路塵埃毒性への寄与が大きいことが明らかになった。これらの結果は、道路塵埃曝露時の発現パターンはニコチン曝露時の発現パターンと最も類似していたというcDNA-AFLP解析の結果と整合しており、cDNA-AFLPによって探索されたマーカー遺伝子の頑健性を示している。ただしニコチンのみを曝露した追加実験を実施したところ、道路塵埃曝露系で検出された溶存態ニコチン濃度では有意な致死影響は見られなかった。したがって、溶存態ニコチン以外の他の未測定物質や測定物質間の複合影響が道路塵埃の急性毒性に寄与していると示唆された。
さらに次世代シーケンサーを用いて、ニホンドロソコエビのストレス応答関連遺伝子の塩基配列を取得した。金属曝露に関連するメタロチオネインや異物代謝に関わるシトクロムP450などの遺伝子の塩基配列を、相同性検索に基づき決定した。これらのデータは、今後本種を用いた生態毒性研究をおこなう上で有用な基礎知見である。

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2017 Annual Research Report
  • 2016 Annual Research Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2018 2017 2016

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Journal Article] De novo transcriptome sequencing of an estuarine amphipod Grandidierella japonica exposed to zinc2018

    • Author(s)
      Hiki Kyoshiro、Nakajima Nobuyoshi、Watanabe Haruna、Nakajima Fumiyuki、Tobino Tomohiro
    • Journal Title

      Marine Genomics

      Volume: 印刷中 Pages: 11-14

    • DOI

      10.1016/j.margen.2017.11.011

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Causes of highway road dust toxicity to an estuarine amphipod: Evaluating the effects of nicotine2017

    • Author(s)
      Hiki Kyoshiro、Nakajima Fumiyuki、Tobino Tomohiro
    • Journal Title

      Chemosphere

      Volume: 168 Pages: 1365-1374

    • DOI

      10.1016/j.chemosphere.2016.11.122

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Application of cDNA-AFLP to biomarker exploration in a non-model species Grandidierella japonica2017

    • Author(s)
      Hiki Kyoshiro、Nakajima Fumiyuki、Tobino Tomohiro
    • Journal Title

      Ecotoxicology and Environmental Safety

      Volume: 140 Pages: 206-213

    • DOI

      10.1016/j.ecoenv.2017.02.037

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Duration of life-cycle toxicity tests with the ostracod Heterocypris incongruens2017

    • Author(s)
      Hiki Kyoshiro、Tobino Tomohiro、Nakajima Fumiyuki、Tsukahara Kenta
    • Journal Title

      Environmental Toxicology and Chemistry

      Volume: 36 Issue: 12 Pages: 3443-3449

    • DOI

      10.1002/etc.3931

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] トキシコゲノミクスデータベースを用いた毒性要因推定手法の検討2017

    • Author(s)
      日置恭史郎、中島典之、飛野智宏
    • Organizer
      第23回日本環境毒性学会研究発表会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] 亜鉛曝露下のニホンドロソコエビにおけるde novoトランスクリプトーム解析2017

    • Author(s)
      日置恭史郎, 中嶋信美, 渡部春奈, 中島典之, 飛野智宏
    • Organizer
      NGS現場の会 第五回研究会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] Exploration of biomarkers in a benthic amphipod for toxic chemicals in road dust using cDNA-AFLP2017

    • Author(s)
      Hiki Kyoshiro、Nakajima Fumiyuki、Tobino Tomohiro
    • Organizer
      18th International Conference on Diffuse Pollution and Eutrophication
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 汽水産端脚類ニホンドロソコエビを用いた高速道路塵埃の毒性評価2017

    • Author(s)
      日置恭史郎
    • Organizer
      第21回日本水環境学会シンポジウム
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] Sediment TIE手法を用いた道路塵埃のニホンドロソコエビへの毒性要因の推定2016

    • Author(s)
      日置恭史郎、中島典之、飛野智宏
    • Organizer
      第22回日本環境毒性学会研究発表会
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Transcriptional profiling of a native estuarine amphipod exposed to road dust and the related chemicals by cDNA-AFLP2016

    • Author(s)
      Kyoshiro Hiki, Fumiyuki Nakajima, Tomohiro Tobino
    • Organizer
      7th SETAC World Congress/SETAC North America 37th Annual Meeting
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research

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Published: 2016-05-17   Modified: 2024-03-26  

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