大規模バイオロギングデータのマイニング~福島沿岸の震災復興への貢献
Project/Area Number |
16J05814
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Research Category |
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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Allocation Type | Single-year Grants |
Section | 国内 |
Research Field |
Aquatic bioproduction science
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Research Institution | The Institute of Statistical Mathematics |
Principal Investigator |
野田 琢嗣 統計数理研究所, データ科学研究系, 特別研究員(PD)
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Project Period (FY) |
2016-04-22 – 2019-03-31
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Project Status |
Completed (Fiscal Year 2018)
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Budget Amount *help |
¥5,200,000 (Direct Cost: ¥4,000,000、Indirect Cost: ¥1,200,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2017: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2016: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
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Keywords | 行動 / バイオロギング / データベース / クラウド / コンテナ技術 / 魚類、行動 / データマイニング / 魚類 |
Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、バイオロギングによって得られた、福島県水域での魚類の行動に関する大規模データから、情報抽出する技術の開発に取り組んだ。この達成のため、1.データベースシステムの開発、2.情報抽出技術の開発、3.データ取得、の3つを並行して進めた。詳細は以下である。 1.バイオロギングデータを蓄積・統合し、クラウド上で解析可能なデータベースシステムを開発した。外部のデータソースやライブラリと連携した解析や様々な種類のデータの解析を容易にするために、Dockerとよばれる仮想化コンテナ技術を利用したバッチ解析システムを開発した。本システムは、解析の種類ごとに必要なライブラリや外部リソースを確保可能なだけではなく、環境構成時にコンテナをクラウド上の高速演算環境で構成すれば、高速に計算を完了することができるため、大容量データの解析にも対応できる。実際に、目的の解析処理ごとに構成するコンテナやファイルをデータベースで管理するクラウドシステムを構築した。 2.福島県水域の魚類のロガーデータおよびテレメトリーデータから行動情報を抽出する技術を開発した。昨年度までは、ホシガレイに深度・温度ロガーを装着し得られたデータから潮汐予測モデルと照合することで位置を算出する技術を開発した。本年度は、平成26年―28年にかけて福島県松川浦で取得した魚類のテレメトリーデータの解析を行った。昨年度までに受信機に装着した発信機の信号を用いて、複数受信機の時刻を同期するアルゴリズムの構築を行っている。本年度はその構築した手法を用いて重複した信号をフィルターし、同場所で取得したニホンウナギのテレメトリーデータの解析を行った。 3.共同研究により、福島県水域にて現場実験を行い、継続してデータを取得した。平成30年度においても、11月末に松川浦にて合計10尾のホシガレイの人工種苗、天然親魚にデータロガーを装着・放流した。
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Research Progress Status |
平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
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Strategy for Future Research Activity |
平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
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Report
(3 results)
Research Products
(32 results)
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[Journal Article] Spatial and seasonal variations of radiocesium concentrations in an algae-grazing annual fish, ayu Plecoglossus altivelis collected from Fukushima Prefecture in 20142019
Author(s)
Morishita, D., Wada, T., Noda, T., Tomiya, A., Enomoto, M., Sato, T., Suzuki, S., Kawata, G.
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Journal Title
Fisheries Science
Volume: 85
Issue: 3
Pages: 295-302
DOI
NAID
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Peer Reviewed
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[Journal Article] Effects of water temperature on white-spotted conger Conger myriaster activity levels determined by accelerometer transmitters2019
Author(s)
Hori, T., Noda, T., Wada, T., Iwasaki, T., Arai, N., Mitamura, H
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Journal Title
Fisheries Science
Volume: 85
Issue: 2
Pages: 295-302
DOI
Related Report
Peer Reviewed
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[Journal Article] Jellyfish and other gelata as food to four penguin species - insights from predator-borne videos2017
Author(s)
J.-B. Thiebot, J. P. Y. Arnould, A. Gomez-Laich, K. Ito, A. Kato, T. Mattern, H. Mitamura, T. Noda, T. Poupart, F. Quintana, T. Raclot, Y. Ropert-Coudert, J. E. Sala, P. J. Seddon, G. J. Sutton, K. Yoda, A. Takahashi
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Journal Title
Frontiers in Ecology and the Environment
Volume: 15
Issue: 8
Pages: 437-441
DOI
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Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Presentation] 汽水域におけるニホンウナギ天然魚の移動生態-養殖魚との比較-2019
Author(s)
野田琢嗣, 小巻拓平, 和田敏裕, 久米学, Alisa Kutzer, 寺島佑樹, 藤田恒雄, 佐藤太津真, 山田学, 松本陽, 堀友彌, 高木淳一, 三田村啓理, 荒井修亮, 山下洋
Organizer
平成31年度日本水産学会春季大会
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[Presentation] 福島県松川浦と流入河川におけるニホンウナギの摂餌生態2019
Author(s)
Alisa Kutzer, 小巻拓平, 野田琢嗣, 和田敏裕, 久米学, 寺島佑樹, 堀友彌, 高木淳一, 三田村啓理,笠井亮秀, 荒井修亮, 山下 洋
Organizer
平成31年度日本水産学会春季大会
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Author(s)
Noda, T., Yap, M., Miyamoto, Y., Arai, N., Mitamura, H., Ichikawa, K., Uchida, K., Kimura, S. S., Miyashita, K., Shirakawa, H., Tsuda, Y. and Kitagawa, T.
Organizer
PITTCON2017
Place of Presentation
Chicago
Year and Date
2017-03-05
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[Presentation] Spawning migration and vertical movement of spotted halibut Verasper variegatus (family Pleuronectidae) in the waters off Fukushima, northeastern Japan, revealed by depth-temperature data loggers2017
Author(s)
T Noda, T Wada, T Hori, J Takagi, T Sato, I Matsumoto, T Fujita, N Arai, H Mitamura
Organizer
International Flatfish Symposium 2017
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Int'l Joint Research
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[Presentation] Development of a Pinger for Classification of Feeding Behavior of Fish Based on Axis-Free Acceleration Data2016
Author(s)
Horie, J., Sasakura, T., Arai, N., Horie, J., Ina, Y., Mashino, Y., Mitamura, H., Moriya, K., Noda, T.
Organizer
Techno Ocean 2016
Place of Presentation
Kobe
Year and Date
2016-10-06
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Int'l Joint Research
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[Presentation] Schooling behaviour of Pacific bluefin tuna in a sea net cage monitored by a novel fine-scale positioning telemetry system2016
Author(s)
Mitamura, H., Saito, W., Ichikawa, K., Arai, N., Takagi, J., Noda, T., Fujioka, K., Fukuda, H.
Organizer
International Society on Biotelemetry 21st Symposium 2016
Place of Presentation
Leuven
Year and Date
2016-05-22
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