標的DNA検索機構の理解に向けた核内環境のライブセルイメージング
Project/Area Number |
16J07205
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Research Category |
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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Allocation Type | Single-year Grants |
Section | 国内 |
Research Field |
Molecular biology
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Research Institution | National Institute of Genetics |
Principal Investigator |
野﨑 慎 国立遺伝学研究所, 遺伝メカニズム研究系, 特別研究員(PD) (40780185)
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Project Period (FY) |
2016-04-22 – 2019-03-31
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Project Status |
Completed (Fiscal Year 2018)
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Budget Amount *help |
¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2017: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2016: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
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Keywords | クロマチン / 転写因子 / ライブセルイメージング / 1分子イメージング / 減数分裂 / ヌクレオソーム / 核 / 超解像イメージング / 標的DNA検索 |
Outline of Annual Research Achievements |
本研究の目的は,細胞内において標的DNAがどのように検索されるかという機構の理解を進めることである.2016年度と2017年度には,生細胞クロマチンの超解像イメージングと,転写因子1分子イメージングの開発を進め,クロマチンとタンパク質によるDNA情報検索に関する理解を深めてきた.それらの観察の結果,クロマチンの密な構造(クロマチンドメイン)が,核空間における転写因子による検索可能領域の限定に重要であることが示唆された.2018年度は,さらに踏み込んだ標的DNA検索の研究を行うため,ハーバード大学のNancy Klecknerラボに滞在し,減数分裂期における相同染色体検索の研究を行ってきた.①減数分裂期で,「いつ」「どのように」相同染色体が相互作用し,②「どのように」相同配列を検索するかについて明らかにすることを解くべき問題として設定した.この問題にアプローチするために,出芽酵母において,減数分裂期におけるプログラムDSB(DNA二本鎖切断)が比較的高い頻度で起きるホットスポット周辺のクロマチンを蛍光タンパク質によって染色し,その領域がお互いをどのように検索しているのかについて2色ライブセルイメージを行なった.様々な試行錯誤を繰り返した結果,減数分裂期中のDSBホットスポットの動きを追跡することが可能となった.その結果,相同染色体間の減数分裂前後における相互作用を観察することができた.
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Research Progress Status |
平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
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Strategy for Future Research Activity |
平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
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Report
(3 results)
Research Products
(12 results)
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[Journal Article] Single nucleosome imaging reveals loose genome chromatin networks via active RNA polymerase II2019
Author(s)
R Nagashima, K Hibino, SS Ashwin, M Babokhov, S Fujishiro, R Imai, T Nozaki, S Tamura, T Tani, H Kimura, M Shribak, MT Kanemaki, M Sasai, K Maeshima
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Journal Title
Journal of Cell Biology
Volume: 218
Issue: 5
Pages: 1511-1530
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Dynamic organization of chromatin domains revealed by super-resolution live-cell imaging.2017
Author(s)
Nozaki, T., Imai, R., Tanbo, M., Nagashima, R., Tamura, S., Tani, T., Joti, Y., Tomita, M., Hibino, K., Wendt, K.S., Okada, Y., Nagai, T., Maeshima, K.
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Journal Title
Molecular Cell.
Volume: 67
Issue: 2
Pages: 282-293
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Density imaging of heterochromatin in live cells using orientation-independent-DIC microscopy.2017
Author(s)
Imai, R., Nozaki, T., Tani, T., Kaizu, K., Hibino, K., Ide, S., Tamura, S., Takahashi, K., Shribak, M., and Maeshima, K.
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Journal Title
Molecular Biology of the Cell.
Volume: 28
Issue: 23
Pages: 3349-3359
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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