植物RNAiに関わるRNAポリメラーゼRDR6が異常RNAを識別する分子機構
Project/Area Number |
16J07290
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Research Category |
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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Allocation Type | Single-year Grants |
Section | 国内 |
Research Field |
Molecular biology
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Research Institution | The University of Tokyo |
Principal Investigator |
Baeg Kyungmin (2017) 東京大学, 新領域創成科学研究科, 特別研究員(DC2)
BAEG KYUNGMIN (2016) 東京大学, 新領域創成科学研究科, 特別研究員(DC2)
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Project Period (FY) |
2016-04-22 – 2018-03-31
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Project Status |
Completed (Fiscal Year 2017)
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Budget Amount *help |
¥1,900,000 (Direct Cost: ¥1,900,000)
Fiscal Year 2017: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2016: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
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Keywords | RNAサイレンシング |
Outline of Annual Research Achievements |
今までの研究により外来遺伝子による転写後遺伝子抑制(PTGS)は外来遺伝子から生成されたpoly(A)鎖のないRNAがPTGSの引金になる事が明かとなった. しかしながら, 植物には内在のpoly(A)鎖を持つRNAにもかかわらず, PTGSの標的になるRNAが存在する. このRNAは特殊なRISCによってターゲティングされることが知られている. その代表例であるTAS3 RNAはRISCの標的部位を二つ持っていて5’側標的部位はRISCと結合し, 3’側標的部位はRISCによって切断される. TAS3の二つの標的部位はTAS RNAから生成される二次的小分子RNA (phasiRNA) 生合成に重要であることが知られている. しかしながら, なぜRISCによるTAS3のターゲティングがphasiRNA生成に重要なのかについては未だにわかっていない. 上記の疑問を解決するために,私はphasiRNAの試験管内再現を試した. タバコ培養細胞抽出液にTAS3によるphasiRNA生成経路に必要である因子らを発現させてからTAS3 RNAを入れることでphasiRNAが生成が確認された. この結果により, 私はTAS3 RNAによるphasiRNA生合成に成功した. 次にRISCによる切断がPTGSの開始ステップである二本鎖RNA合成に影響を及ぼすのかを調てみた. その結果, RISCの標的部位どちらかに変異が入っている場合,合成された相補鎖RNAは検出されなかった. この結果から, RISCによる結合とRISCによる切断は二本鎖合成に必要であることが明らかとなった.
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Research Progress Status |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
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Strategy for Future Research Activity |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
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Report
(2 results)
Research Products
(7 results)