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硫酸還元菌と鉄材料界面における電子伝達阻害を基軸とした嫌気防食技術の基盤構築

Research Project

Project/Area Number 16J07690
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Biofunction/Bioprocess
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

DENG XIAO  東京大学, 工学系研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2016-04-22 – 2019-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2018)
Budget Amount *help
¥3,400,000 (Direct Cost: ¥3,400,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2017: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2016: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
Keywords硫酸還元菌 / 細胞外電子移動 / 外膜シトクロム / トランスクリプトーム / 遺伝子発現 / 電位依存性 / 電極培養 / Iron corrosion / Electron uptake / Sulfate reducer / Iron sulfide / Nanoparticles / 嫌気鉄腐食 / ゲノム解析 / シトクロム
Outline of Annual Research Achievements

これまでの研究では、地下環境において普遍的に存在する硫酸還元菌が外膜シトクロム酵素を有し、それを介して固体から直接電子を引き抜くことを明らかにした。さらに、硫酸還元菌Desulfovibrio ferrophilus IS5株をモデル菌とした研究では、電極電位が負であるほど電極上の細胞活性が高くなることを見出した。しかし、電子引き抜きが微生物の遺伝子発現に与える影響は不明であった。そこで本研究では、IS5株を-0.4 V、-0.5 V (vs. 標準水素電極)、及び電位印加なしの条件下でそれぞれ5日間培養し、遺伝子発現の変化をトランスクリプトーム解析で分析した。その結果、-0.4 V の電極上で培養した細胞では、ATP合成と硫酸塩還元代謝経路をコードする遺伝子群の発現が電極なし条件と比べて約4倍以上増加したことを明らかにした。これは電子引き抜き過程に伴い細胞がエネルギーを獲得することを強く示唆した。さらに、電極電位が-0.5 Vの場合は、-0.4 Vの場合と比較して、細胞が電極から電子を引き抜く速度が大幅に増加したのと同時に、電子摂取を媒介する外膜シトクロム酵素の発現が10倍以上増加していた。この結果は、外膜シトクロム酵素が細胞の電子引き抜きを媒介するというモデルを強く支持する。さらに、ATP合成と硫酸塩還元経路、及び窒素(アンモニウム)や炭素(酢酸)を同化する経路の遺伝子発現も、-0.4 Vの場合と比較して約4倍増加していた。これらの遺伝子群は細胞の成長に深く関与することから、電極からの電子摂取がIS5株の細胞成長にエネルギーを提供することが示唆された。以上の結果より、電子源が不明であるため未培養のままとなっている微生物を培養する新しい手法として、電気化学的培養法が利用できると期待される。

Research Progress Status

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2018 Annual Research Report
  • 2017 Annual Research Report
  • 2016 Annual Research Report
  • Research Products

    (15 results)

All 2019 2018 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 1 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results) Funded Workshop (2 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Southern California(米国)

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Journal Article] Electrode Potential Dependency of Single-Cell Activity Identifies the Energetics of Slow Microbial Electron Uptake Process2018

    • Author(s)
      Deng Xiao、Okamoto Akihiro
    • Journal Title

      Frontiers in Microbiology

      Volume: 9 Pages: 27441-27448

    • DOI

      10.3389/fmicb.2018.02744

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Multi-heme cytochromes provide a pathway for survival in energy-limited environments2018

    • Author(s)
      Deng Xiao、Dohmae Naoshi、Nealson Kenneth H.、Hashimoto Kazuhito、Okamoto Akihiro
    • Journal Title

      Science Advances

      Volume: 4 Issue: 2

    • DOI

      10.1126/sciadv.aao5682

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Energy Acquisition via Electron Uptake by the Sulfate-Reducing Bacterium2018

    • Author(s)
      Deng Xiao、Okamoto Akihiro
    • Journal Title

      Extremophiles

      Volume: -

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Potential Mechanisms of Oligotrophic Life Fueled by Electricity2018

    • Author(s)
      Xiao Deng
    • Organizer
      2018 JSME annual meeting & 20th ASME 微生物電気化学研究部会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Direct Extracellular Electron Uptake by New Class of Outer Membrane C-Type Cytochromes in Sulfur-Metabolizing Bacteria2017

    • Author(s)
      Xiao Deng, Hashimoto Kazuhito, Akihiro Okamoto
    • Organizer
      The 97th Annual Meeting of the Chemical Society of Japan
    • Place of Presentation
      Keio University Hiyoshi Campus
    • Year and Date
      2017-03-16
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Outer Membrane Multi-heme Cytochromes Enable Extracellular Electron Uptake by Sulfate Reducing Bacteria2017

    • Author(s)
      Deng Xiao、 Hashimoto Kazuhito、 Okamoto Akihiro
    • Organizer
      International Union of Microbiological Societies
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Multi-heme Cytochromes Found In Oxidized Sulfur Reducing Bacteria Mediate Direct Extracellular Electron Uptake2017

    • Author(s)
      Deng Xiao、Dohmae Naoshi、Nealson Kenneth H.、Hashimoto Kazuhito、Okamoto Akihiro
    • Organizer
      Extracellular Electron Transfer: Mechanisms and Opportunities
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Membrane Cytochromes Enable Energy Acquisition in Energy-limited Environments2017

    • Author(s)
      Deng Xiao、 Hashimoto Kazuhito、 Okamoto Akihiro
    • Organizer
      微生物生態学会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Presentation] Iron Corrosive Sulfate Reducing Bacteria Uptake Extracellular Electrons Via Outer Membrane C-Type Cytochromes2016

    • Author(s)
      Xiao Deng, Hashimoto Kazuhito, Akihiro Okamoto
    • Organizer
      The Pacific Rim Meeting on Electrochemical and Solid-state Science
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawaii
    • Year and Date
      2016-10-02
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] C-Type Cytochromes Covered Outer Membrane and Nanowires Mediate Extracellular Electron Uptake of Sulfate Reducing Bacteria2016

    • Author(s)
      Xiao Deng, Hashimoto Kazuhito, Akihiro Okamoto
    • Organizer
      The 3rd Asia Pacific Conference of the International Society for Microbial Electrochemistry and Technology
    • Place of Presentation
      Busan, South Korea
    • Year and Date
      2016-08-31
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks]

    • URL

      http://advances.sciencemag.org/content/4/2/eaao5682.full

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 微生物培養方法、微生物培養装置、及び、二酸化炭素還元装置2019

    • Inventor(s)
      岡本章玄、トウ ギョウ
    • Industrial Property Rights Holder
      物質材料研究機構
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2019
    • Acquisition Date
      2019
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Funded Workshop] Extracellular Electron Transfer: Mechanisms and Opportunities2017

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Funded Workshop] International Union of Microbiological Societies2017

    • Related Report
      2017 Annual Research Report

URL: 

Published: 2016-05-17   Modified: 2024-03-26  

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