Detection of ALK fusion genes in plasma exosomes
| Project/Area Number |
16K07150
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Research Field |
Tumor diagnostics
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| Research Institution | Kindai University |
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Principal Investigator |
SAKAI Kazuko 近畿大学, 医学部, 講師 (20580559)
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| Research Collaborator |
NISHIO kazuto
NISHIO makoto
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2018)
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| Budget Amount *help |
¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2017: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2016: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
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| Keywords | エキソソーム / 非小細胞肺癌 / 融合遺伝子 / セルフリーDNA / ALK融合遺伝子 / 次世代シーケンサー |
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| Outline of Final Research Achievements |
We tried to detect EML4-ALK fusion gene in plasma-derived exosomal RNA derived from non-small cell lung cancer patients. We established a PCR-based assay to detect ALK fusion transcripts and tried to detect ALK fusion transcripts in exosomal RNA of the xenograft model bearing human lung cancer cell lines. However we failed to detect the fusion transcripts in exosomal RNA. Next, we tried to detect ALK fusion genes in circulating free DNA (cfDNA) obtained from plasma of non-small cell lung cancer patients. EML4-ALK fusion genes could be detected in one of 6 cases using CAPP-seq technology.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
肺がんにおいては、ALK融合遺伝子をはじめとするドライバー変異に対する分子標的薬の開発が進み、分子標的薬への治療反応性をモニタリングするための持続採取が可能で侵襲性の低い血液検体を用いたバイオマーカー検査が求められている。血中での融合遺伝子検出には困難を伴うが、本研究により非小細胞肺がんの血液検体からALK融合遺伝子が検出された。同手法は、他のがん種における融合遺伝子検出にも応用可能であると考えられる。
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Report
(4 results)
Research Products
(1 results)
