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Overcoming fermentation inhibition for improved production of aromatic compounds by recombinant Escherichia coli

Research Project

Project/Area Number 16K07665
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Research Field Applied microbiology
Research InstitutionKobe University

Principal Investigator

Kawaguchi Hideo  神戸大学, 科学技術イノベーション研究科, 特命准教授 (50463873)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 寺村 浩  神戸大学, 科学技術イノベーション研究科, 学術研究員 (10645089)
蓮沼 誠久  神戸大学, 先端バイオ工学研究センター, 教授 (20529606)
Project Period (FY) 2016-04-01 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000)
Fiscal Year 2020: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2019: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2018: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2017: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2016: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
KeywordsEscherichia coli / Fermentation inhibition / Metabolism / Biomass / fermentation inhibition / lignocellulosic bimass / phenyllactate / metabolism / バイオマス / 発酵阻害 / 大腸菌 / 代謝解析 / 芳香族化合物 / 発酵 / ソルガム / 代謝工学 / 酵素糖化 / メタボローム / フェニル乳酸 / 応用微生物
Outline of Final Research Achievements

The aims of this study was to understand the mechanisms of fermentation inhibition in Escherichia coli for the production of an aromatic compound, phenyllactic acid (PhLA). To achieve the goal, the residue of a biomass crop, sorghum, was used as a model lignocellulosic feedstock, and the enzymatic hydrolysate was used as carbon source for PhLA fermentation by recombinant E. coli to investigate the fermentation inhibition.
This study was composed of the following three activities: (i) chemical analysis of the enzymatic hydrolysate of sorghum residue to identify potential fermentation inhibitors, (ii) identification of point(s) in the fermentation inhibition by metabolome analysis, and (iii) metabolic engineering to develop a robust cell against fermentation inhibition. Consequently, we clarified that fermentation inhibition was depend on the cultivars of sorghum and the structure of chemicals contained in enzymatic hydrolysate of the sorghum residues.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

イネ科の大型植物であるソルガムは、収量が高く(サトウキビと同等)、栽培可能地域が広範囲で、かつ農業に適さない耕作限界地でも栽培可能であるため、農業と競合しない産業利用を目的とする“バイオマス植物”としての社会利用が近年注目されている。
しかしこれまで実施例は、搾汁液を用いた酵母によるエタノール発酵しかなく、未利用残渣や他の生産菌への応用が研究されていなかった。本研究を通じて、ソルガム残渣利用の実現可能性を初めて証明し、予想される発酵阻害の程度とその主要な原因物質を特定できたことは、学術的な新しさだけでなく、将来の社会実装に向けた基盤情報として重要な意義がある。

Report

(5 results)
  • 2020 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2019 Research-status Report
  • 2017 Research-status Report
  • 2016 Research-status Report
  • Research Products

    (21 results)

All 2020 2019 2017 2016 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (13 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 5 results) Book (1 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Enhanced phenyllactic acid production in Escherichia coli via oxygen limitation and shikimate pathway gene expression2019

    • Author(s)
      2.Hideo Kawaguchi, Hiroki Miyagawa, Sachiko Nakamura-Tsuruta, Naoki Takaya, Chiaki Ogino, Akihiko Kondo
    • Journal Title

      Biotechnology Journal

      Volume: 14 Issue: 6 Pages: 1800478-1800478

    • DOI

      10.1002/biot.201800478

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Microbial conversion of biomass into bio-based polymers2017

    • Author(s)
      Hideo Kawaguchi, Chiaki Ogino, Akihiko Kondo
    • Journal Title

      Bioresource Technology

      Volume: 245(Part B) Pages: 1664-1673

    • DOI

      10.1016/j.biortech.2017.06.135

    • Related Report
      2017 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Sucrose Purification and Repeated Ethanol Production from Sugars Remaining in Sweet Sorghum Juice Subjected to a Membrane Separation Process2017

    • Author(s)
      Kengo Sasaki, Yota Tsuge, Hideo Kawaguchi, Masahiro Yasukawa, Daisuke Sasaki, Takashi Sazuka, Eiji Kamio, Chiaki Ogino, Hideto Matsuyama and Akihiko Kondo
    • Journal Title

      App Micbio Biotech

      Volume: 101 Issue: 15 Pages: 6007-6014

    • DOI

      10.1007/s00253-017-8316-3

    • Related Report
      2017 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Differences in Glucose Yield of Residues from among Varieties of Rice, Wheat, and Sorghum after Dilute Acid Pretreatment2017

    • Author(s)
      Hiroshi Teramura, Kengo Sasaki, Hideo Kawaguchi, Fumio Matsuda, Jun Kikuchi, Tomokazu Shirai, Takashi Sazuka, Masanori Yamasaki, Shigeo Takumi, Chiaki Ogino and Akihiko Kondo
    • Journal Title

      Biosci Biotech Biochem

      Volume: 81 Issue: 8 Pages: 1650-1656

    • DOI

      10.1080/09168451.2017.1336922

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      2017 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] リグノセルロース系バイオマスからのバイオモノマー発酵生産2017

    • Author(s)
      川口 秀夫、近藤 昭彦
    • Journal Title

      ケミカルエンジニヤリング

      Volume: 62 Pages: 13-20

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      2016 Research-status Report
  • [Presentation] Microbial production of aromatic compounds applied to synthesize bioplastics from plant biomass2020

    • Author(s)
      Hideo Kawaguchi, Tatsuo Kaneko, Takashi Sazuka, Tomohisa Hasunuma, Chiaki Ogino, Akihiko Kondo
    • Organizer
      JAIST World Conference 2020―International Symposium for Innovative Sustainable Materials & The 7th International Symposium for Green-Innovation Polymers (GRIP2020)
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      2020 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 遺伝子組換え大腸菌によるフェニル乳酸発酵をモデルとする発酵阻害メカニズムの解明2020

    • Author(s)
      川口 秀夫、蓮沼 誠久、佐塚 隆志、高谷 直樹、近藤 昭彦
    • Organizer
      日本農芸化学会 2021年度仙台大会
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  • [Presentation] 微生物を活用したバイオリファイナリー研究:植物からつくるバイオプラスチック2020

    • Author(s)
      川口 秀夫
    • Organizer
      北勢バイオコミュニティ研究会キックオフセミナー
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    • Invited
  • [Presentation] ソルガムの酵素糖化効率品種間差を決定する物理化学特性の探索2019

    • Author(s)
      川口 秀夫、福本 妙子、佐塚 隆志
    • Organizer
      第10回 ソルガムワークショップ
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  • [Presentation] ソルガムバガスの酵素糖化効率支配因子の探索2019

    • Author(s)
      川口 秀夫、佐々木 大介、福本 妙子、森田 健太、竹中 武蔵、冨田 康平、佐塚隆志、松本 拓也、西野孝、近藤 昭彦
    • Organizer
      日本農芸化学会関西・中部支部2019年度合同神戸大会
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      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 微生物を活用してバイオマスからバイオプラッスチックを作る2019

    • Author(s)
      川口 秀夫
    • Organizer
      みえバイオリファイナリー研究会公開セミナー
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      2019 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] Effects of glucose concentration and any other condition on gene expression patterns during phenyllactic acid production by recombinant Escherichia coli2017

    • Author(s)
      Hiroki Miyagawa, Hideo Kawaguchi, Chiaki Ogino, Ken-Ichi Oinuma, Naoki Takaya, Akihiko Kondo
    • Organizer
      23rd Symposium of Young Asian Biological Engineers' Community (YABEC 2017)
    • Related Report
      2017 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Development of microbial cell factories for production of aromatic chemicals and derivatives2017

    • Author(s)
      Akihiko Kondo, Shuhei Noda, Hideo Kawaguchi
    • Organizer
      The 13th Asian Congress on Biotechnology 2017
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      2017 Research-status Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 組換え大腸菌によるフェニル乳酸における多様な草本系バイオマス糖化液の発酵阻害とその成分の比較2017

    • Author(s)
      川口 秀夫、吉原 久美子、佐塚 隆志、高谷 直樹、蓮沼 誠久、寺村 浩、荻野 千秋、近藤 昭彦
    • Organizer
      日本農芸化学会関西支部例会 第501回講演会
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] 時系列データと代謝マップからの実反応経路の推定2016

    • Author(s)
      富永 大介、川口 秀夫、堀 良美、蓮沼 誠久、荻野 千秋、油谷 幸代
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2016-12-01
    • Related Report
      2016 Research-status Report
  • [Presentation] 疎水性アルコールを用いた植物バイオマスの効率的な成分分離法の開発2016

    • Author(s)
      寺村 浩、佐々木 建吾、白井 智量、川口 秀夫、荻野 千秋、菊地 淳、佐塚 隆志、近藤昭彦
    • Organizer
      第61回リグニン討論会
    • Place of Presentation
      京都大学宇治キャンパス(宇治市)
    • Year and Date
      2016-10-27
    • Related Report
      2016 Research-status Report
  • [Presentation] 遺伝子組換え大腸菌を用いたフェニル乳酸生産に影響を与える遺伝子の発現解析2016

    • Author(s)
      宮川 寛規、川口 秀夫、荻野 千秋、老沼 研一、高谷 直樹、近藤 昭彦
    • Organizer
      第68回 日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      ANAクラウンプラザホテル富山(富山市)
    • Year and Date
      2016-09-29
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      2016 Research-status Report
  • [Presentation] バイオリファイナリー:植物資源の利用によるホワイトバイオテクノロジー2016

    • Author(s)
      川口 秀夫、近藤 昭彦
    • Organizer
      第19回ケナフ等植物資源利用研究発表会・第 22 回特別講演会
    • Place of Presentation
      愛媛県紙産業技術センター(愛媛中央市)
    • Year and Date
      2016-09-09
    • Related Report
      2016 Research-status Report
    • Invited
  • [Book] 研究開発の俯瞰報告書:ライフサイエンス・臨床医学分野(2017年)2017

    • Author(s)
      川口 秀夫、荻野 千秋
    • Total Pages
      11
    • Publisher
      JST/CRDS
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      2016 Research-status Report
  • [Remarks] 研究室HP

    • URL

      http://www2.kobe-u.ac.jp/~akondo/

    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Remarks] 研究室ホームページ

    • URL

      http://www2.kobe-u.ac.jp/~akondo/kawaguchi.html

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      2016 Research-status Report

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Published: 2016-04-21   Modified: 2025-02-27  

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