Generation of regular structure with function based on alpha/beta-heteropeptides
| Project/Area Number |
16K08157
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Research Field |
Chemical pharmacy
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
Otani Yuko 東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 講師 (60451853)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2018)
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| Budget Amount *help |
¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000)
Fiscal Year 2018: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2017: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2016: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
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| Keywords | 非天然アミノ酸 / 二環性βープロリン / タンパク質ータンパク質相互作用 / 構造解析 / 分子動力学計算 / ペプチド / 二環性βプロリン / 二環性アミン / コンホメーション / アミノ酸 / β－アミノ酸 / 人工アミノ酸 / アミド平衡 / NMR / ヘテロペプチド / α/β－ヘテロペプチド / 二環性アミノ酸 / タンパク質－タンパク質相互作用 / 規則構造 |
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| Outline of Final Research Achievements |
In this work we focused on conformationally constrained proline-type bicyclic β-amino acids whose amide cis-trans equilibrium of these amides is completely tipped to one side. Various kinds of α-amino acids were connected to the bicyclic amine. It was found that all hetero-dimers take only cis-amide structure. It was found that the bicyclic scaffold have potential ability to constrain the conformation of neighboring α-amino acids.
α,β-Heterooligomers from the dimer to the octamer were synthesized by coupling of the bicyclic β-amino acid and L-Ala. It is suggested that the heterooligomers take extended helical structures.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
近年、創薬分野では抗体医薬や環状ペプチドが注目されている。これらはタンパク質の精密な分子認識を利用することで高い活性を持ちうるが、合成法や細胞膜透過性などに 改善の余地がある。非天然アミノ酸を組み込んだ人工の短いペプチドやペプチド類縁体は、活性に重要な天然ペプチドの構造を保持しつつ、コンホメーションを安定化し物性の改善に役立つことが期待される。本研究成果より堅牢な骨格を持つ二環性アミノ酸を非天然アミノ酸として用いる際の基礎的な構造情報を得ることができ、将来ペプチドやミニサイズ化したタンパク質のデザインに応用可能であると考えられる。
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Report
(4 results)
Research Products
(54 results)
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[Journal Article] Conformational Constraint of the Glycerol Moiety of Lysophosphatidylserine, an Emerging Lysophospholipid Mediator, Affords Compounds with Receptor Subtype Selectivity2016
Author(s)
Sejin Jung, Asuka Inoue, Sho Nakamura, Takayuki Kishi, Akiharu Uwamizu, Misa Sayama, Masaya Ikubo, Yuko Otani, Kuniyuki Kano, Kumiko Makide, Junken Aoki, Tomohiko Ohwada
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Journal Title
The Journal of Medicinal Chemistry
Volume: 59
Issue: 8
Pages: 3750-3776
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
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[Presentation] ３原子相互作用による窒素カチオンの安定化2016
Author(s)
寧 桜唐, 福田 朋也, 尾谷 優子, 池田 博隆, 川幡 正俊, 山口 健太郎, 大和田 智彦
Organizer
第２７回基礎有機化学討論会
Place of Presentation
広島国際会議場（広島県広島市）
Year and Date
2016-09-03
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